文献分享|bioRxiv-Evolutionary Biology：通过基因组基础模型在功能引导的RNA设计中捕获自然进化

本研究介绍了RILLIE策略，通过整合基因组大型语言模型（LLMs）与逆折叠模型（IFMs），在零样本条件下模拟自然进化规律以优化RNA序列。传统RNA设计方法如SELEX依赖体外筛选，耗时且难以模拟体内复杂环境。RILLIE策略通过结合序列和结构信息，成功优化了荧光适配体的功能性能，荧光强度最高提升2.6倍，结合亲和力增强3倍。该方法为RNA工程提供了高效、可扩展的新范式，尤其在RNA疗法与诊断领域具有重要应用前景。