ANÁLISE MOLECULAR, BIOLÓGICA E FILOGENÉTICA DO NOVO CORONAVÍRUS SARS-COV-2

Rordana Gomes Fernandes Pereira, P. R. Queiroz
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Abstract

Introdução: Os coronavírus são uma família de vírus que possuem RNA de fita simples e são capazes de contaminar homens e animais. São conhecidos por sua alta frequência de recombinação e altas taxas de mutação, permitindo que se adaptem a novos hospedeiros e nichos ecológicos. Os níveis virais elevados fornecem um ambiente adequado para a replicação viral, levando a persistência viral, por sua vez, pode originar novas estirpes virais. Objetivo: O objetivo deste trabalho foi analisar o aspecto molecular, biológico e filogenético do SARS-CoV-2. Material e Métodos: Para isso, foi feito um levantamento dos estudos relacionados com o tema ao longo dos anos de 2019 e 2021 e a utilização de vários softwares para a análise filogenética de 105 genomas completos do SARS-Cov-2 provenientes do Brasil, China, Índia, Itália e Estados Unidos e de morcegos de Wuhan (WIV). Resultados: Apenas duas sequências do SARS-Cov-2 isolados no Brasil tiveram semelhança com as sequências WIV, demonstrando que as estirpes brasileiras da pesquisa possuem uma alta variabilidade genética. Já os isolados do SARS-Cov-2 isolados na China apresentam o maior número de sequências relacionadas com as WIV. Nos isolados virais da Índia observou-se uma relação de afinidade por um ancestral comum e os isolados WIV, porém, não possuem uma similaridade direta com as sequências WIV pois a análise mostrou mais ramificações isoladas confirmando achados de estudos que revelaram que a Europa e o Sudeste Asiático são as duas principais rotas de introdução da doença na Índia. Os vírus dos Estados Unidos, da China e da Índia ficaram reunidos com as estirpes do próprio país demostrando através do alinhamento de sequências que mutações diferentes ocorrem pelo mundo. Além disso, algumas estirpes apresentaram proximidade com outras sequências de outros países devido a circulação de pessoas entre as nacionalidades estudadas neste trabalho. Conclusão: O novo Coronavírus foi originado de um processo de coevolução com início em um animal não humano e atingiu os hospedeiros humanos através do salto de espécies. Dessa forma, com base na filogenia molecular do genoma viral essa capacidade zoonótica traz consigo o alerta para possíveis novos surtos ou epidemias devido à evolução e adaptações desse vírus em outros hospedeiros animais.
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新型冠状病毒SARS-COV-2的分子、生物学和系统发育分析
简介:冠状病毒是一种具有单链RNA的病毒家族,能够污染人和动物。它们以高重组频率和高突变率而闻名,这使它们能够适应新的宿主和生态位。高病毒水平为病毒复制提供了合适的环境,导致病毒持久性,进而可能产生新的病毒株。摘要目的:分析SARS-CoV-2的分子、生物学和系统发育特征。材料和方法:这是一个主题相关的调查研究在2019年到2021年,使用不同的软件分析系统发生学的105个基因组完整的冠2从巴西、中国、印度、意大利和美国,武汉的蝙蝠(WIV)。结果:在巴西分离的SARS-Cov-2菌株中,只有两个序列与WIV序列相似,表明巴西菌株具有较高的遗传变异。在中国分离的SARS-Cov-2分离株与WIV相关的序列数量最多。在印度分离的病毒的人的一个共同祖先的关系和隔离WIV直接拥有非常相似,但因为WIV序列分析显示更应被确认的研究结果显示,在欧洲和东南亚是两个主要疾病的介绍印度航线。来自美国、中国和印度的病毒与本国的毒株结合在一起,通过序列比对表明,世界各地正在发生不同的突变。此外,由于本研究研究的民族之间的人员流动,一些菌株与其他国家的序列接近。结论:新型冠状病毒起源于非人类动物的共同进化过程,通过物种跳跃到达人类宿主。因此,基于病毒基因组的分子系统发育,这种人畜共患病能力为可能的新爆发或流行病提供了警报,这是由于该病毒在其他动物宿主中的进化和适应。
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