Monitorización de las comunidades de anfibios mediante metabarcoding de ADN ambiental

Amaia Caro, Ibai Ugarte-Zabaleta, Julen Vázquez-Sanz, Aitor Albaina, María José Madeira, Benjamín Juan Gómez-Moliner
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Abstract

Las metodologías de ADN ambiental o eDNA permiten la detección del ADN presente en el ambiente y posibilitan la identificación y clasificación de las especies presentes en el medio sin necesidad de avistarlas ni capturarlas. De esta forma, permiten trabajar con especies poco abundantes, esquivas y/o en peligro de extinción de una manera eficaz, segura y no invasiva. Por ello, se muestran como una opción muy prometedora para el estudio y monitoreo de las comunidades de anfibios, ya que la probabilidad de detección de algunas especies mediante métodos tradicionales de muestreo puede ser baja y varía dependiendo de las condiciones ambientales. Sin embargo, la técnica aún plantea varios retos, siendo esencial optimizar los procedimientos y ajustarlos a cada tipo de estudio y objetivos perseguidos. Aquí, se presentan los resultados preliminares de la puesta a punto de una metodología metabarcoding basada en el análisis de eDNA para monitorizar las comunidades de anfibios en la Comunidad Autónoma del País Vasco (CAPV). El protocolo de muestreo diseñado y la metodología metabarcoding propuesta, basada en una región del gen 12S mitocondrial, se ha empleado en 60 masas de agua de Álava y dos de Navarra. El locus seleccionado ha mostrado ser adecuado para distinguir las especies de anfibios presentes en el área de estudio. Además, se han obtenido resultados para 38 humedales, mostrando que la metodología tiene potencial para la detección de anfibios y permitiendo identificar los procedimientos a mejorar para optimizar la metodología. Se demuestra, por tanto, que los estudios de eDNA son una metodología prometedora para la monitorización de las comunidades de anfibios.
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通过环境dna元编码监测两栖动物群落
环境dna或eDNA方法允许检测环境中的dna,并允许识别和分类环境中的物种,而不需要看到或捕获它们。通过这种方式,它们可以以一种有效、安全和非侵入性的方式处理稀有、难以捉住和/或濒危物种。因此,它们被证明是研究和监测两栖动物群落的一个很有前途的选择,因为通过传统取样方法检测一些物种的概率可能很低,而且根据环境条件而有所不同。然而,这项技术仍然带来了一些挑战,优化程序并使其适应每种类型的研究和追求的目标是至关重要的。本文提出了一种基于eDNA分析的元编码方法的初步结果,用于监测巴斯克地区自治社区(CAPV)的两栖动物群落。设计的采样方案和提出的元编码方法,基于线粒体12S基因的一个区域,在alava的60个水体和纳瓦拉的两个水体中使用。在本研究中,我们选择了两个地点,分别是位于墨西哥恰帕斯(chiapan)和墨西哥恰帕斯(chiapan)的两个地点,分别位于墨西哥恰帕斯(chiapan)和墨西哥恰帕斯(chiapan)。此外,对38个湿地的结果表明,该方法具有检测两栖动物的潜力,并允许确定需要改进的程序,以优化该方法。因此,eDNA的研究证明了一种很有前景的两栖动物群落监测方法。
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