Visualizaciones de datos para el análisis de bacterias coexistentes en modelos de clustering de pacientes con Vaginosis Bacteriana

Henry Jesús Hernández-Gómez, Juana Canul-Reich
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Abstract

Las visualizaciones de datos y el aprendizaje automático son dos áreas de las ciencias de la computación en las que existe una convergencia en el análisis y entendimiento de los conjuntos de datos. Esta convergencia permite la comprensión completa y multidimensional de un fenómeno, con el propósito de abordar interrogantes complejas desde diferentes perspectivas. El objetivo de este artículo es describir y mostrar el uso de visualizaciones sobre modelos de clustering para derivar contextos de coexistencia bacteriana en grupos subyacentes de pacientes con un diagnóstico de Vaginosis Bacteriana (VB) positivo. Para este fin, se empleó un modelo previamente desarrollado de clustering jerárquico aglomerativo en el cual se utilizó un conjunto de datos de VB. En conclusión, nuestras evidencias demuestran que las visualizaciones de datos son efectivas para identificar patrones relevantes de coexistencia bacteriana en grupos de pacientes con VB-Positivo. Esto revela relaciones significativas entre distintas bacterias en grupos específicos, en los cuales es posible distinguir la presencia de varios tipos de Lactobacillus, tales como Jensenii, Crispatus, LGasseri, Liner y bacterias anaeróbicas tales como Atopobium, Gardnerella, Megasphaera y Mycoplasma. Estos hallazgos destacan la utilidad de las visualizaciones de datos para comprender e identificar los contextos de coexistencia bacteriana en esta condición médica.
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细菌性阴道病患者聚类模型中共存细菌分析的数据可视化
数据可视化和机器学习是计算机科学的两个领域,在这两个领域中,对数据集的分析和理解趋同。这种趋同使我们能够全面和多维地理解一种现象,以便从不同的角度解决复杂的问题。本文的目的是描述和展示使用聚类可视化模型来推断细菌性阴道病(bv)阳性的潜在患者群体中的细菌共存情况。为了实现这一目标,我们使用了先前开发的聚类层次聚类模型,其中使用了VB数据集。综上所述,我们的证据表明,数据可视化在识别hiv阳性患者群体中细菌共存的相关模式方面是有效的。这揭示了特定群体中不同细菌之间的显著关系,其中可以区分出几种乳杆菌类型的存在,如Jensenii、Crispatus、LGasseri、Liner和厌氧细菌,如Atopobium、Gardnerella、Megasphaera和支原体。这些发现强调了数据可视化在理解和识别这种疾病中细菌共存的环境方面的有用性。
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