Étude des transcriptomes par analyse sérielle de l'expression des gènes : Du transcriptome au protéome, une nouvelle lecture de la cellule

Abstract

L'Analyse Serielle de l'Expression des Genes (acronyme anglais SAGE) permet d'identifier l'ensemble des genes exprimes dans un echantillon cellulaire ou tissulaire. Elle se fonde sur l'analyse sequentielle d'un grand nombre de courts fragments d'ADNc, dont chacun represente la signature d'un gene. Leur denombrement donne une mesure precise de leur niveau d'expression. Ce systeme analytique ouvert n'exige aucune hypothese prealable sur les genes exprimes. L'analyse peut donc reveler des produits de transcription encore inconnus, contrairement aux systemes fondes sur l'hybridation a des collections de sondes nucleiques, exigeant une caracterisation prea lable des genes analyses. Ses caracteristiques font de la methode SAGE un outil de decouverte de nouveaux genes et de marqueurs potentiels d'etats pathologiques. Elle permet de selectionner rapidement de nouveaux parametres de diagnostic et d'evaluation de l'efficacite d'agents therapeutiques. Toutes les donnees SAGE peuvent etre reunies dans une base informatique unique, ou chaque nouvelle analyse beneficie de l'ensemble des donnees precedentes. Cette premiere etape dans l'inventaire detaille des composants cellulaires ouvre de nouvelles perspectives pour la modelisation in silico des fonctions biologiques.