ОПЫТ ПРИМЕНЕНИЯ ВРЕМЯ ПРОЛЕТНОЙ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ (MALDI-TOF) ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ВИРУСНЫХ ПАТОГЕНОВ, В ЧАСТНОСТИ КОРОНОВИРУСА. СИСТЕМАТИЧЕСКИЙ ОБЗОР

Abstract

Актуальность. Масс-спектрометрия MALDI–TOF является диагностическим инструментом, который идентифицирует микроорганизмы с помощью определения массы их молекул. В большинстве лабораторий, на сегодняшний день, эта технология применяется в основном для бактериальной диагностики, однако имеется несколько исследований и в области вирусологии. От различных вирусных заболеваний ежегодно умирают сотни тысяч человек. Диагностика же их затруднена вследствие широкого спектра симптомов вирусных заболеваний, высокой изменчивости, перекрестной реактивности, сложности жизненного цикла вирусов. Своевременная же идентификация вируса способствует ранней терапии и профилактике, а также разработке противовирусных средств для таргетного применения. Доказательством данного аспекта является возникшая пандемия, объявленная в 2019 году, во время которой одной из главных задач был выбор метода диагностики COVID-19. Проведенные исследования во всем мире продемонстрировали эффективность применения метода матричной лазерной десорбции / ионизационной масс-спектрометрии и анализа машинного обучения для обнаружения SARS-CoV-2. Внедрение этой технологии в рутинную работу лабораторий благотворно повлияет на решение вопросов клинической вирусологии, а потенциал технологии - на открытие мутаций и вариантов вирусов, что вызовет интерес к научным исследованиям. Цель. Провести анализ литературы по вопросу использования MALDI-TOF масс-спектрометрии для детекции вирусных патогенов, в том числе SARS-CoV-2. Материалы и методы. Был проведен анализ полнотекстовых публикаций на английском языке за период 2012-2022 гг. в базах данных MEDLINE и SCOPUS. Запрашивались следующие ключевые слова и их комбинации: масс-спектрометрия, вирусология, SARS-CoV-2, MALDI-TOF, COVID-19, MALDI-TOF MS AND virology AND SARS-CoV-2. Было отобрано 57 статей, из которых 24 включены в исследование. Статьи, описывающие применение метода масс-спектрометрии на вирусах животных, насекомых, а также описывающие технологии отличные от MALDI-TOF MS, были исключены. Результаты и выводы. Исходя из результатов изученной литературы, использование масс-спектрометрии возможно в рутинной работе вирусологических лабораторий, однако в настоящее время затруднение вызывают отсутствие единого протокола исследования и общепризнанной базы данных вирусов.