Ağır Metal ile Kontamine Toprakta Fungal Mikrobiyomun Metagenomik Analizi

Turkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology Pub Date : 2023-09-30 DOI:10.24925/turjaf.v11i9.1671-1677.6261

Melike Çebi Kılıçoğlu

{"title":"Ağır Metal ile Kontamine Toprakta Fungal Mikrobiyomun Metagenomik Analizi","authors":"Melike Çebi Kılıçoğlu","doi":"10.24925/turjaf.v11i9.1671-1677.6261","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Gelişen sanayi faaliyetleri ile birlikte günümüzün en önemli sorunlarından biri haline gelen ağır metal kontaminasyonu tüm canlı organizmalar için ciddi bir tehdittir. Bazı funguslar ağır metallere karşı direnç mekanizmalarına sahiptir ve bu durum iyileştirme süreçleri için sürdürülebilir bir yaklaşım olarak kabul edilmektedir. Bu çalışmanın amacı ağır metal kontaminasyonunun yüksek oranlarda olduğu alanlardaki dirençli fungal mikrobiyotayı belirleyerek ağır metallerin biyolojik ıslah yaklaşımlarına ışık tutmaktır. Araştırmada yüksek oranda ağır metal kirliliğine sahip Samsun Organize Sanayi Bölgesinden alınan toprak örneklerindeki Cr, Mn, Ni, Cu, Zn, Cd, Pb, As ve V ağır metal oranları ICP-OES ile tespit edilmiştir. Toprak fungal mikrobiyotası ise metagenenomik yeni nesil sekanslama teknolojisi kullanılarak belirlenmiştir. Metagenomik sekanslama için illumina MiSeq teknolojisi, istatistiksel mikrobiyom analizi için QIIME 2 2017,4 kullanılmıştır. Ağır metalle kontamine olmuş çalışma alanında en yüksek oranlarda sırasıyla Mortierella %53,90, Halokirschsteiniothelia %18,01, Rhizopogon %2,74, Cladosporium %,1,88, Aspergillus %1,62 ve Gibberella %1,12 cinsleri tespit edilmiştir. Sonuçlar metal konsantrasyonundaki fazlalığa dirençli taksonların ortamda dominant olduğunu göstermektedir.","PeriodicalId":23389,"journal":{"name":"Turkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Turkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.24925/turjaf.v11i9.1671-1677.6261","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

Gelişen sanayi faaliyetleri ile birlikte günümüzün en önemli sorunlarından biri haline gelen ağır metal kontaminasyonu tüm canlı organizmalar için ciddi bir tehdittir. Bazı funguslar ağır metallere karşı direnç mekanizmalarına sahiptir ve bu durum iyileştirme süreçleri için sürdürülebilir bir yaklaşım olarak kabul edilmektedir. Bu çalışmanın amacı ağır metal kontaminasyonunun yüksek oranlarda olduğu alanlardaki dirençli fungal mikrobiyotayı belirleyerek ağır metallerin biyolojik ıslah yaklaşımlarına ışık tutmaktır. Araştırmada yüksek oranda ağır metal kirliliğine sahip Samsun Organize Sanayi Bölgesinden alınan toprak örneklerindeki Cr, Mn, Ni, Cu, Zn, Cd, Pb, As ve V ağır metal oranları ICP-OES ile tespit edilmiştir. Toprak fungal mikrobiyotası ise metagenenomik yeni nesil sekanslama teknolojisi kullanılarak belirlenmiştir. Metagenomik sekanslama için illumina MiSeq teknolojisi, istatistiksel mikrobiyom analizi için QIIME 2 2017,4 kullanılmıştır. Ağır metalle kontamine olmuş çalışma alanında en yüksek oranlarda sırasıyla Mortierella %53,90, Halokirschsteiniothelia %18,01, Rhizopogon %2,74, Cladosporium %,1,88, Aspergillus %1,62 ve Gibberella %1,12 cinsleri tespit edilmiştir. Sonuçlar metal konsantrasyonundaki fazlalığa dirençli taksonların ortamda dominant olduğunu göstermektedir.

查看原文

微信好友朋友圈 QQ好友复制链接

本刊更多论文

重金属污染土壤中真菌微生物组的元基因组分析

随着工业活动的发展，重金属污染已成为当今最重要的问题之一，严重威胁着所有生物体。一些真菌对重金属具有抵抗机制，这被认为是一种可持续的补救方法。本研究的目的是通过鉴定重金属污染严重地区的抗性真菌微生物群来阐明重金属的生物修复方法。本研究采用 ICP-OES 方法测定了重金属污染严重的萨姆松有组织工业区土壤样本中的铬、锰、镍、铜、锌、镉、铅、砷和钒重金属比率。使用元基因组新一代测序技术测定了土壤真菌微生物群。元基因组测序采用 Illumina MiSeq 技术，微生物组统计分析采用 QIIME 2 2017,4 技术。在受重金属污染的研究区域检测到了 53.90%的莫蒂尔菌（Mortierella）、18.01%的Halokirschsteiniothelia、2.74%的Rhizopogon、1.88%的Cladosporium、1.62%的曲霉（Aspergillus）和1.12%的吉伯菌（Gibberella）。结果表明，对过量金属浓度具有抗性的分类群在环境中占主导地位。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文去求助

来源期刊

Turkish Journal of Agriculture: Food Science and Technology

自引率

0.00%

发文量