Abubaker Abdulrahem Thanon Al Ghazal, Mohammad Ibrahim Khalil
{"title":"INVESTIGATION AND IDENTIFICATION OF SOME ACTIVE BIOCHEMICAL IN MEDICAL PLANTS AGAINST CYP51 PROTEIN IN CANDIDA BY USING MOLECULAR DOCKING","authors":"Abubaker Abdulrahem Thanon Al Ghazal, Mohammad Ibrahim Khalil","doi":"10.31413/nat.v11i3.16148","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"ABSTRACT: Common and medical plants were investigated for active biochemical to bind and inhibit the CYP51 protein in candida sp., 22 important plants were chosen and 263 molecular docking reactions were done between active materials and protein, 1441 different active ligands were detected for binding in protein active site, the best 225 ligands were chosen depending the power of affinity bond. Four ligands were candidates for having the best ligand affinity bond and more safety for use according to the toxicity test program; within these ligands, the Epicatechin was found to be the best biochemical for inhibition and bonding to CYP51 protein as it subjects to Lipinski's rule of five.\nKeywords: molecular docking; medical plants; Candida sp.\n \nInvestigação e identificação de alguns bioquímicos ativos em plantas medicinais contra a proteína CYP51 em candida usando Molecular Docking \n \nRESUMO: Plantas comuns e medicinais foram investigadas para bioquímicos ativos para ligar e inibir a proteína CYP51 em Candida sp., 22 plantas importantes foram escolhidas e 263 reações de docking molecular foram feitas entre materiais ativos e proteínas, 1441 ligantes ativos diferentes foram detectados para ligação em proteínas sítio ativo, o melhor ligante 225 foi escolhido dependendo do poder de ligação de afinidade. Quatro ligantes foram candidatos por ter melhor ligação por afinidade e maior segurança para uso de acordo com o programa de testes de toxicidade, dentro destes ligantes a Epicatequina mostrou ser o melhor bioquímico para inibição e ligação à proteína CYP51 por estar sujeita à regra dos cinco de Lipinski.\nPalavras-chave: docking molecular; plantas medicinais; Candida sp.","PeriodicalId":44324,"journal":{"name":"Nativa","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.3000,"publicationDate":"2023-12-03","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Nativa","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.31413/nat.v11i3.16148","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY","Score":null,"Total":0}
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Abstract
ABSTRACT: Common and medical plants were investigated for active biochemical to bind and inhibit the CYP51 protein in candida sp., 22 important plants were chosen and 263 molecular docking reactions were done between active materials and protein, 1441 different active ligands were detected for binding in protein active site, the best 225 ligands were chosen depending the power of affinity bond. Four ligands were candidates for having the best ligand affinity bond and more safety for use according to the toxicity test program; within these ligands, the Epicatechin was found to be the best biochemical for inhibition and bonding to CYP51 protein as it subjects to Lipinski's rule of five.
Keywords: molecular docking; medical plants; Candida sp.
Investigação e identificação de alguns bioquímicos ativos em plantas medicinais contra a proteína CYP51 em candida usando Molecular Docking
RESUMO: Plantas comuns e medicinais foram investigadas para bioquímicos ativos para ligar e inibir a proteína CYP51 em Candida sp., 22 plantas importantes foram escolhidas e 263 reações de docking molecular foram feitas entre materiais ativos e proteínas, 1441 ligantes ativos diferentes foram detectados para ligação em proteínas sítio ativo, o melhor ligante 225 foi escolhido dependendo do poder de ligação de afinidade. Quatro ligantes foram candidatos por ter melhor ligação por afinidade e maior segurança para uso de acordo com o programa de testes de toxicidade, dentro destes ligantes a Epicatequina mostrou ser o melhor bioquímico para inibição e ligação à proteína CYP51 por estar sujeita à regra dos cinco de Lipinski.
Palavras-chave: docking molecular; plantas medicinais; Candida sp.
摘要:研究了普通植物和药用植物结合和抑制假丝酵母(candida sp.) CYP51蛋白的活性生化，筛选出22种重要植物，活性物质与蛋白进行263次分子对接反应，检测到1441种不同的活性配体结合在蛋白活性位点，并根据亲合力强弱筛选出225种最佳配体。根据毒性试验程序，4种配体具有最佳的配体亲和键和更安全的使用;在这些配体中，表儿茶素是抑制和结合CYP51蛋白的最佳生化物质，因为它符合Lipinski的五法则。关键词:分子对接;药用植物;假丝酵母菌(Candida sp. investigatoral)与proteína CYP51 em假丝酵母菌(Candida usando)分子对接研究Plantas comcomes medicinais foram investigadas para bioquímicos ativos para ligar e inibira proteína CYP51 em Candida sp.， 22 Plantas important foram escolhidas e 263 reações de对接分子foram feitas entre materiais ativos e proteínas, 1441 ligantes ativos不同有孔的detectados para liga o em proteínas sítio ativo, o melhor ligante 225 foi escolhido dependentdo do powder de liga ode afinidade。四羧酸盐ligantes foram候选者por ter melhor liga o por afinidade e major segurana para uso de toxicidade, dentro destes ligantes a Epicatequina mostrose o melhor bioquímico para inibi o e liga proteína CYP51 por estar sujeita regra dos cinco de Lipinski。Palavras-chave:对接分子;足底medicinais;假丝酵母sp。
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