{"title":"Van Topraklarından İzole Edilen Colpoda (Ciliophora, Colpodea) Türleri Üzerinde Morfolojik ve Moleküler Filogenetik Araştırmalar","authors":"Pelin Eri̇şen, İsmail Yıldız","doi":"10.53433/yyufbed.1285464","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Van topraklarından izole dilen Colpoda cinsine ait dört siliyat popülasyonu morfolojik olarak incelendi ve 18S rDNA gen dizisine dayalı moleküler filogenetik pozisyonu değerlendirildi. C. lucida, C. maupasi ve C. magna morfolojik olarak literatür verileri ile uyumludur. Morfolojik karakterleri bakımından daha önce tanımlanmış hiçbir popülasyon ile eşleşmeyen bir popülasyon ise Colpoda sp. olarak sunuldu. Maksimum olabilirlik (ML) ve Bayesian çıkarsaması (BI) ile elde edilen filogenetik ağaçlarda Colpoda cinsi üyeleri dış grup olarak kullanılan türlerden tam destek ile ayrılmıştır. Bu çalışmada izole edilen C. lucida ve C. magna filogenetik ağaçlarda türdeşleri ile birlikte konumlanırken C. maupasi popülasyonunun morfolojik olarak benzer olmamasına karşın C. eucaudata ile daha yakın konumlanmıştır. C. lucida türdeşlerinin bazal pozisyonunda onlardan genetik olarak farklılaşmış olarak konumlanmıştır. Bu çalışmada izole edilen Colpoda sp. diğer hemcinslerinden farklı bir kol üzerinde Coploda sp. (JF747216) popülasyonu ile kardeş pozisyonda ve ondan genetik olarak uzak pozisyonda konumlanmıştır. Colpoda sp.’nin filogenetik pozisyonu ve genetik farklılığı onun yeni tür olmaya olduğuna işaret etmektedir.","PeriodicalId":386555,"journal":{"name":"Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-09-04","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.53433/yyufbed.1285464","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Abstract
Van topraklarından izole dilen Colpoda cinsine ait dört siliyat popülasyonu morfolojik olarak incelendi ve 18S rDNA gen dizisine dayalı moleküler filogenetik pozisyonu değerlendirildi. C. lucida, C. maupasi ve C. magna morfolojik olarak literatür verileri ile uyumludur. Morfolojik karakterleri bakımından daha önce tanımlanmış hiçbir popülasyon ile eşleşmeyen bir popülasyon ise Colpoda sp. olarak sunuldu. Maksimum olabilirlik (ML) ve Bayesian çıkarsaması (BI) ile elde edilen filogenetik ağaçlarda Colpoda cinsi üyeleri dış grup olarak kullanılan türlerden tam destek ile ayrılmıştır. Bu çalışmada izole edilen C. lucida ve C. magna filogenetik ağaçlarda türdeşleri ile birlikte konumlanırken C. maupasi popülasyonunun morfolojik olarak benzer olmamasına karşın C. eucaudata ile daha yakın konumlanmıştır. C. lucida türdeşlerinin bazal pozisyonunda onlardan genetik olarak farklılaşmış olarak konumlanmıştır. Bu çalışmada izole edilen Colpoda sp. diğer hemcinslerinden farklı bir kol üzerinde Coploda sp. (JF747216) popülasyonu ile kardeş pozisyonda ve ondan genetik olarak uzak pozisyonda konumlanmıştır. Colpoda sp.’nin filogenetik pozisyonu ve genetik farklılığı onun yeni tür olmaya olduğuna işaret etmektedir.
对从范氏土壤中分离出的四种纤毛虫种群进行了形态学研究,并根据 18S rDNA 基因序列评估了它们的分子系统发育位置。C. lucida、C. maupasi 和 C. magna 在形态上与文献数据一致。一个在形态特征上与之前描述的种群不一致的种群被列为 Colpoda sp.在通过最大似然法(ML)和贝叶斯推断法(BI)得到的系统发生树中,Colpoda 属的成员与作为外群的物种完全分离。本研究中分离出的 C. lucida 和 C. magna 在系统发生树中与其同属种被定位在一起,而 C. maupasi 则被定位在更靠近 C. eucaudata 的位置,尽管其种群在形态上并不相似。C.Lucida位于其同属种的基部位置,在遗传上与同属种有所区别。在本研究中分离出的 Colpoda sp.与其同源种的位置不同,是 Coploda sp.(JF747216)种群的姐妹种,在遗传学上与之相距甚远。的系统发育位置和遗传分化表明它是一个新物种。