Étude de la physiopathologie de la dysfonction chronique du greffon pulmonaire par analyse transcriptomique sur cellule unique d’explants pulmonaires

Abstract

Introduction

La dysfonction chronique du greffon est la complication majeure de la transplantation pulmonaire puisque sa survenue impacte la survie de manière péjorative [1], [2]. Il est important de progresser dans la connaissance des mécanismes physiopathologiques de cette pathologie afin d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques.

Méthodes

Cette étude présente les résultats d’une analyse transcriptomique sur cellule unique d’explants pulmonaires de patients atteints de CLAD (n = 2), comparés à des explants de patients atteints de bronchopneumopathie chronique obstructive (n = 1), de fibrose pulmonaire idiopathique (n = 2) et des donneurs sains (n = 2). Les lobes pulmonaires récupérés lors de transplantations ont été dissociés afin de récupérer les cellules. Une analyse transcriptomique sur cellules uniques a ensuite été réalisée sur le Chromium 10X au sein du laboratoire. Après validation des données, une analyse bio-informatique a été réalisée. Les résultats ont été confirmés au niveau protéique par des marquages sur tissus congelés et paraffiné.

Résultats

Ce travail révèle l’importance des monocytes et macrophages qui semblent surreprésentés dans le CLAD. Une sous analyse de cette population monocytaire a révélé quatre clusters associés au CLAD. Ils présentaient de manière globale une signature transcriptomique inflammatoire et pro fibrosante avec un profil macrophagique orienté M1. Trois cibles d’intérêts identifiées dans l’analyse transcriptomique sur cellule unique, CXCL10 PTX3 et IFIT3, ont été étudiées sur coupes tissulaires congelées en immunofluorescence. PTX3 était abondamment présent sur les coupes tissulaires provenant de tissus pulmonaires avec CLAD, ce qui renforce l’intérêt porté à cette protéine dans le cadre du CLAD. CXCL10 et IFIT3 n’étaient observés sur aucunes des coupes (Fig. 1).

Conclusion

Les monocytes et macrophages associés au CLAD ont une signature transcriptomique particulièrement pro-inflammatoire. Parmi les transcrits d’intérêts exprimés par ces monocytes, PTX3 semble être une cible qui mériterait d’être étudiée davantage dans la dysfonction chronique du greffon afin d’identifier sa place dans sa prise en charge du CLAD.