Circadian rhythm and redox homeostasis candidate genes showed association with shallow elevation in Norway spruce

IF 4.2 3区生物学 Q1 PLANT SCIENCES Plant Biology Pub Date : 2024-04-03 DOI:10.1111/plb.13642

O. Caré, V. Chano, M. Erley, M. Rogge, O. Gailing

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昼夜节律和氧化还原平衡候选基因与挪威云杉的浅层海拔高度有关

对自然种群的地方适应性以及对不同外部刺激的反应进行遗传变异分析，是目前森林科学的一个热门话题，其目的是确定控制关键表型特征的遗传标记，以便将其纳入恢复和育种计划。在欧洲，主要树种之一是挪威云杉（Picea abies (L.) H.Karst.）。利用 MassARRAY® 平台，对来自北莱茵-威斯特法伦州（德国）的 568 棵云杉进行了基因分型，发现了 94 个与昼夜节律、生长节律和应激反应有关的单核苷酸多态性 (SNP)。所选标记与健康状况和升高的关联分析采用了三种不同的方法，其中至少有两种方法确定的标记被认为是高置信度关联 SNPs。虽然只有 5 个标记与健康状况有微弱关联，但有 32 个 SNP 与血糖升高相关，其中 6 个被认为是高置信度相关 SNP，至少有两种不同的关联方法表明了这一点。在这些基因中，硫氧还蛋白和伪反应调节因子 1（PRR1）参与氧化还原平衡和 ROS 解毒，转录因子 APETALA2-like 3（AP2L3）参与季节性顶端生长，RPS2-like 是抗病基因。其中一些基因在控制光依赖性反应和代谢过程方面的功能表明，它们具有适应当地光周期和同步昼夜节律的特征。这项研究为了解挪威云杉在浅海拔梯度上适应当地环境的遗传基础提供了新的视角。

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来源期刊

Plant Biology 生物-植物科学

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审稿时长

3 months

期刊介绍： Plant Biology is an international journal of broad scope bringing together the different subdisciplines, such as physiology, molecular biology, cell biology, development, genetics, systematics, ecology, evolution, ecophysiology, plant-microbe interactions, and mycology. Plant Biology publishes original problem-oriented full-length research papers, short research papers, and review articles. Discussion of hot topics and provocative opinion articles are published under the heading Acute Views. From a multidisciplinary perspective, Plant Biology will provide a platform for publication, information and debate, encompassing all areas which fall within the scope of plant science.