结构变化中的隐藏历史

测序技术的进步已经使许多物种的全基因组可用，这提高了我们对自然变异和物种进化的理解（M. Schreiber et al.）。热纳Rev. 25, 563-577；2024)。在最近一期的《自然》杂志上，中国农业科学院作物科学研究所的焦承志及其同事报道了自20世纪50年代以来在中国不同时期发布的17个小麦品种的基因组组装。他们的分析将小麦基因组结构变异（SVs）与环境适应、迁徙和人类饮食偏好联系起来。这17个小麦品种代表了70年的育种历史，是根据它们对中国现代小麦育种和生产的贡献选出的。利用PacBio HiFi测序和Hi-C，研究人员获得了所有这些品种的染色体水平的高邻接组装。整合先前发表的四个基因组，他们进行了泛基因组分析，并确定了核心和不可或缺的基因家族。虽然当基因组数量(n)达到10个时，基因家族数量接近饱和，但即使在n = 21时，核苷酸结合富亮氨酸重复（NLR）基因也未达到饱和，这表明抗病基因具有更高的多样性，而这种多样性尚未在更大的种质中发现。