钠/溶质同调体的功能超家族

根据序列相似性定义了11个钠/溶质同向转运体家族，这些家族的蛋白质成员根据它们的溶质和阳离子特异性、它们的大小、它们的拓扑特征、它们的进化关系以及它们的相对序列保守程度和区域进行了表征。在某些情况下，特别是当位点特异性突变分析提供了特定蛋白质的功能信息时，相关家族成员的多重比对被提出，突变残基的保护程度被评估。11个家族中的几个签名序列被提出，以方便识别这些家族的新成员，因为他们被测序。系统发育树的构建揭示了每个家族成员之间的进化关系。其中一个家族属于前面定义的主要促进者超家族。其他10个家族之间或与其他已鉴定的转运蛋白家族之间没有足够的序列相似性来建立同源性。本研究旨在阐明11个功能相关转运蛋白不同家族之间的结构、功能和进化关系。