{"title":"Multigene Panel Testing in Turkish Hereditary Cancer Syndrome Patients.","authors":"Esra Arslan Ates, Ayberk Turkyilmaz, Ceren Alavanda, Ozlem Yildirim, Ahmet Ilter Guney","doi":"10.4274/MMJ.galenos.2022.22556","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<p><strong>Objective: </strong>Hereditary cancer syndromes (HCSs) are a heterogenous group of disorders caused by germline pathogenic variations in various genes that function in cell growth and proliferation. This study aimed to describe the germline variations in patients with hereditary cancer using multigene panels.</p><p><strong>Methods: </strong>The molecular and clinical findings of 218 patients with HCS were evaluated. In addition, 25 HCS-related genes were sequenced using a multigene panel, and variations were classified according to the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) criteria. In total, 218 HCS patients predominantly with breast, colorectal, ovarian, gastric, and endometrium cancers were included.</p><p><strong>Results: </strong>Pathogenic variations in 12 distinct genes were detected in 36 of 218 (16.5%) cases. In this study, the most affected gene was the ATM gene, in which pathogenic variations were detected in 8 of 218 cases, followed by CHEK2 (3.2%), MUTYH (3.2%), BRIP1 (1.8%), BARD1 (0.9%), TP53 (0.9%), PALB2 (0.4%), MLH1 (0.4%), MSH2 (0.4%), PMS2 (0.4%), RAD50 (0.4%), and RAD51C (0.4%).</p><p><strong>Conclusions: </strong>This study contributes to genotype-phenotype correlation in HCSs and expands the variation spectrum by introducing three novel pathogenic variations. The wide spectrum of the gene pathogenic variations detected and the presence of multiple gene defects in the same patient make the multigene panel testing a valuable tool in detecting the hereditary forms of cancer and providing effective genetic counseling and family specific screening strategies.</p><p><strong>Amaç: </strong>Herediter kanser sendromları (HCS) hücre büyümesi ve proliferasyonunda görevli genlerde saptanan germline mutasyonlardan kaynaklanan heterojen bir grup hastalıktır. Bu çalışmada kalıtımsal kanser sendrom ön tanısıyla değerlendirilen olgularda çoklu gen paneli ile germ hattı varyasyonlarının değerlendirilmesi planlanmıştır.</p><p><strong>Yöntemler: </strong>Kalıtımsal kanser sendromu düşünülen 218 olgudan periferik kandan DNA izolasyonu sonrası HCS ile ilişkili 25 gen multigen panel kullanılarak dizilendi ve varyasyonlar American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) kriterlerine göre değerlendirildi.</p><p><strong>Bulgular: </strong>Meme, kolorektal, over, gastrik ve endometriyum kanseri başta olmak üzere toplam 218 herediter kanser sendromlu olgu değerlendirildi. Tüm çalışma grubu incelendiğinde en sık ATM gen varyasyonları (8/218, %3,6) tespit edildi ve bunu sıklık sırasına göre CHEK2 (%3,2), MUTYH (%3,2), BRIP1 (%1,8), BARD1 (%0,9), TP53 (%0,9), PALB2 (%0,4), MLH1 (%0,4), MSH2 (%0,4), PMS2 (%0,4), RAD50 (%0,4), RAD51C (%0,4) varyasyonları takip etmekteydi.</p><p><strong>Sonuçlar: </strong>Bu çalışmada farklı kanser türlerinde kalıtımsal kansere yol açan genler analiz edilmiş ve fenotiple ilişkisi değerlendirilmiştir. Ayrıca bu çalışmada ilk kez saptanan üç yeni varyasyon ile literatüre katkı sağlanmaktadır. Patojenik varyasyon tespit edilen genlerin geniş dağılımı ve aynı hastada birden fazla genetik varyasyonun varlığı düşünüldüğünde, uygun genetik danışma ve aileye özgü tarama planlaması yapmak için çoklu gen taraması kalıtımsal kanser hastalarının değerlendirilmesinde hızlı ve etkin bir yöntem olarak görünmektedir.</p>","PeriodicalId":37427,"journal":{"name":"Medeniyet medical journal","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.1000,"publicationDate":"2022-06-23","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/pmc/oa_pdf/23/29/medj-37-150.PMC9234359.pdf","citationCount":"3","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Medeniyet medical journal","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.4274/MMJ.galenos.2022.22556","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q2","JCRName":"MEDICINE, GENERAL & INTERNAL","Score":null,"Total":0}
引用次数: 3
Abstract
Objective: Hereditary cancer syndromes (HCSs) are a heterogenous group of disorders caused by germline pathogenic variations in various genes that function in cell growth and proliferation. This study aimed to describe the germline variations in patients with hereditary cancer using multigene panels.
Methods: The molecular and clinical findings of 218 patients with HCS were evaluated. In addition, 25 HCS-related genes were sequenced using a multigene panel, and variations were classified according to the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) criteria. In total, 218 HCS patients predominantly with breast, colorectal, ovarian, gastric, and endometrium cancers were included.
Results: Pathogenic variations in 12 distinct genes were detected in 36 of 218 (16.5%) cases. In this study, the most affected gene was the ATM gene, in which pathogenic variations were detected in 8 of 218 cases, followed by CHEK2 (3.2%), MUTYH (3.2%), BRIP1 (1.8%), BARD1 (0.9%), TP53 (0.9%), PALB2 (0.4%), MLH1 (0.4%), MSH2 (0.4%), PMS2 (0.4%), RAD50 (0.4%), and RAD51C (0.4%).
Conclusions: This study contributes to genotype-phenotype correlation in HCSs and expands the variation spectrum by introducing three novel pathogenic variations. The wide spectrum of the gene pathogenic variations detected and the presence of multiple gene defects in the same patient make the multigene panel testing a valuable tool in detecting the hereditary forms of cancer and providing effective genetic counseling and family specific screening strategies.
Amaç: Herediter kanser sendromları (HCS) hücre büyümesi ve proliferasyonunda görevli genlerde saptanan germline mutasyonlardan kaynaklanan heterojen bir grup hastalıktır. Bu çalışmada kalıtımsal kanser sendrom ön tanısıyla değerlendirilen olgularda çoklu gen paneli ile germ hattı varyasyonlarının değerlendirilmesi planlanmıştır.
Yöntemler: Kalıtımsal kanser sendromu düşünülen 218 olgudan periferik kandan DNA izolasyonu sonrası HCS ile ilişkili 25 gen multigen panel kullanılarak dizilendi ve varyasyonlar American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) kriterlerine göre değerlendirildi.
Bulgular: Meme, kolorektal, over, gastrik ve endometriyum kanseri başta olmak üzere toplam 218 herediter kanser sendromlu olgu değerlendirildi. Tüm çalışma grubu incelendiğinde en sık ATM gen varyasyonları (8/218, %3,6) tespit edildi ve bunu sıklık sırasına göre CHEK2 (%3,2), MUTYH (%3,2), BRIP1 (%1,8), BARD1 (%0,9), TP53 (%0,9), PALB2 (%0,4), MLH1 (%0,4), MSH2 (%0,4), PMS2 (%0,4), RAD50 (%0,4), RAD51C (%0,4) varyasyonları takip etmekteydi.
Sonuçlar: Bu çalışmada farklı kanser türlerinde kalıtımsal kansere yol açan genler analiz edilmiş ve fenotiple ilişkisi değerlendirilmiştir. Ayrıca bu çalışmada ilk kez saptanan üç yeni varyasyon ile literatüre katkı sağlanmaktadır. Patojenik varyasyon tespit edilen genlerin geniş dağılımı ve aynı hastada birden fazla genetik varyasyonun varlığı düşünüldüğünde, uygun genetik danışma ve aileye özgü tarama planlaması yapmak için çoklu gen taraması kalıtımsal kanser hastalarının değerlendirilmesinde hızlı ve etkin bir yöntem olarak görünmektedir.
目的:遗传性癌症综合征(hcs)是一组异质性疾病，由多种参与细胞生长和增殖的基因的种系致病变异引起。本研究旨在利用多基因面板描述遗传性癌症患者的种系变异。方法:对218例HCS患者的分子和临床表现进行评价。此外，使用多基因面板对25个hcs相关基因进行测序，并根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的标准对变异进行分类。共纳入218例HCS患者，主要为乳腺癌、结肠直肠癌、卵巢癌、胃癌和子宫内膜癌。结果:218例中有36例(16.5%)检测到12种不同基因的致病变异。在本研究中，受影响最大的基因是ATM基因，218例中有8例检测到致病变异，其次是CHEK2(3.2%)、MUTYH(3.2%)、BRIP1(1.8%)、BARD1(0.9%)、TP53(0.9%)、PALB2(0.4%)、MLH1(0.4%)、MSH2(0.4%)、PMS2(0.4%)、RAD50(0.4%)和RAD51C(0.4%)。结论:本研究通过引入三种新的致病变异扩大了hcs的基因型-表型相关性。在同一患者中检测到的基因致病变异的广谱性和多基因缺陷的存在使多基因面板检测成为检测遗传形式癌症和提供有效的遗传咨询和家庭特定筛查策略的有价值的工具。Amaç:遗传因子kanser sendromlarn (HCS) h cre b y mesi - ve prolifererasyonda görevli genlerde saptanan种系mutasyonlardan kaynaklanan异源性bir组hastalıktır。但是çalışmada kalıtımsal kanser sendfrom ön tanısıyla değerlendirilen olgularda。Yöntemler: Kalıtımsal kanser sendromu d n len 218 olgudan periferik kandan DNA izolasyonu sonrasyi HCS ile ili kili 25 gen多gen panel kullanılarak dizilendi ve varyasyonlar美国医学遗传与基因组学学院(ACMG) kriterlerine göre değerlendirildi。bulbulial: Meme, kolorektal, over, gastrik，子宫内膜癌(子宫内膜癌)(子宫内膜癌)(子宫内膜癌)(子宫内膜癌)değerlendirildi(子宫内膜癌)。t m çalışma grubu incelendiğinde en sık ATM gen varyasyonlaryi (8/ 21.8， %3,6) tespit edildi ve bunu sıklık sırasına göre CHEK2 (%3,2)， MUTYH (%3,2)， BRIP1 (%1,8)， BARD1 (%0,9)， TP53 (%0,9)， PALB2 (%0,4)， MLH1 (%0,4)， MSH2 (%0,4)， PMS2 (%0,4)， RAD50 (%0,4)， RAD51C (%0,4) varyasyonlaryi takip etmekteydi。sonu: Bu çalışmada farklir kanser trlerinde kalıtımsal kansere yol apran genler分析edilmiil - il kisi değerlendirilmiştir。Ayrıca但是çalışmada ilk kez saptanan üç yeni varyasyon ile literat re katkyi sağlanmaktadır。Patojenik varyasyon tespit edilen genlerin genişdağılımıve艾茵·ıhastada birden fazla genetik varyasyonun varlığıduşunulduğ波形的,uygun genetik丹ış马ve aileye ozgu tarama planlamasıyapmak icin coklu创taraması粗铁ıtımsal堪萨斯州hastalarınıdeğerlendirilmesinde hızlıve etkin bir yontem olarak gorunmektedir。
期刊介绍：
The Medeniyet Medical Journal (Medeniyet Med J) is an open access, peer-reviewed, and scientific journal of Istanbul Medeniyet University Faculty of Medicine on various academic disciplines in medicine, which is published in English four times a year, in March, June, September, and December by a group of academics. Medeniyet Medical Journal is the continuation of Göztepe Medical Journal (ISSN: 1300-526X) which was started publishing in 1985. It changed the name as Medeniyet Medical Journal in 2015. Submission and publication are free of charge. No fees are asked from the authors for evaluation or publication process. All published articles are available online in the journal website (www.medeniyetmedicaljournal.org) without any fee. The journal publishes intradisciplinary or interdisciplinary clinical, experimental, and basic researches as well as original case reports, reviews, invited reviews, or letters to the editor, Being published since 1985, the Medeniyet Med J recognizes that the best science should lead to better lives based on the fact that the medicine should serve to the needs of society, and knowledge should transform society. The journal aims to address current issues at both national and international levels, start debates, and exert an influence on decision-makers all over the world by integrating science in everyday life. Medeniyet Med J is committed to serve the public and influence people’s lives in a positive way by making science widely accessible. Believing that the only goal is improving lives, and research has an impact on people’s lives, we select the best research papers in line with this goal.
京公网安备 11010802042870号
京ICP备2023020795号-1
分享
求助内容：
应助结果提醒方式：
扫码关注我们
