Incidência e caracterização molecular de badnavírus em bancos de germoplasma de inhame no Brasil

Summa Phytopathologica Pub Date : 2020-09-01 DOI:10.1590/0100-5405/206682

Jean Phellipe Marques do Nascimento, Mayara Oliveira de Lima, Georgia de Souza Peixinho, Mayra Machado de Medeiros Ferro, S. Silva, Elizabeth Ann Veasey, G. D. A. Lima, Iraildes Pereira Assunção

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Abstract

RESUMO Os badnavírus (família Caulimoviridae) possuem genoma de dsDNA semicircular encapsidado em partículas baciliformes. Dioscorea bacilliform virus (DBV) é um importante Badnavirus infectando várias espécies de Dioscorea (inhame) no hemisfério sul. No presente estudo, 235 amostras foliares de inhame foram coletadas em diferentes bancos de germoplasma mantidos pela Escola Superior de Agricultura Luiz (ESALQ/USP), Universidade Federal de Viçosa (UFV) e Universidade Federal do Recôncavo Baiano (UFRB). A incidência média de badnavírus nas amostras avaliadas foi de 75,3%. As análises moleculares e filogenéticas, realizadas a partir de 42 sequências nucleotídicas, da região da RT/RNaseH de badnavírus, revelaram a ocorrência do Dioscorea bacilliform AL virus (DBALV) e Dioscorea bacilliform SN virus (DBSNV) em diferentes espécies de inhame. Até o momento, somente o DBALV havia sido relatado em inhame no Brasil, estando restrito à região Nordeste. Portanto, este é o primeiro relato do DBSNV infectando a cultura do inhame, no país. Além das espécies espissomais, também foram detectadas sequências endógenas, com porcentagem de identidade de nucleotídeos variando entre 89% e 100% com endogenous Dioscorea bacilliform virus (eDBV), pertencentes aos grupos 9 e 12. Os resultados obtidos corroboram com a hipótese de que o DBALV e o DBSNV estão presentes em materiais propagativos de inhame e amplamente disseminados no Brasil.

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巴西山药种质库badnavvirus的发病率和分子特征

Badnavirus（Caulimoviridae科）具有半圆形的dsDNA基因组，包裹在细菌状颗粒中。薯蓣杆状病毒（DBV）是感染南半球几种薯蓣属植物的一种重要的Badnavirus。在本研究中，从Escola Superior de Agricultura Luiz（ESALQ/USP）、维索萨联邦大学（UFV）和Baiano联邦大学（UFRB）维护的不同种质库中收集了235个yam叶样本。在所评估的样本中，badnavirus的平均发病率为75.3%。通过对badnavirus RT/RNaseH区42个核苷酸序列的分子和系统发育分析，揭示了薯蓣杆状病毒AL（DBALV）和薯蓣杆状病毒SN（DBSNV）在不同品种中的发生。到目前为止，只有DBALV在巴西的亚马孙中被报道，仅限于东北地区。因此，这是巴西首次报道DBSNV感染yam培养物。除了espisomal物种外，还检测到内源性序列，与内源性薯蓣杆状病毒（eDBV）的核苷酸同一性百分比在89%至100%之间，属于第9组和第12组。结果证实了DBALV和DBSNV存在于yam繁殖材料中并在巴西广泛传播的假设。

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Summa Phytopathologica Agricultural and Biological Sciences-Plant Science

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期刊介绍： The Summa Phytopathologica is a publication of the São Paulo State Plant Pathology Association (APF), Botucatu SP. Summa Phytopathologica (SP) is dedicated to publishing technical and scientific articles that describe original research in the area of Plant Pathology that may contribute significantly to its progress. SP accepts papers written in Portuguese, English, or Spanish. Its abbreviated title, Summa Phytopathol., should be used in bibliographies, footnotes and bibliographical references and strips.