Dewi Ratih Tirto Sari, Heny Yusuf, Laily Sifaiyah, Nur Dina Camelia, Yohanes Bare
{"title":"Kajian Farmakoinformatika Senyawa Brazilin dan 3-O-Methyl Brazilin Caesalpinia sappan Sebagai Terapi Demam Berdarah Dengue","authors":"Dewi Ratih Tirto Sari, Heny Yusuf, Laily Sifaiyah, Nur Dina Camelia, Yohanes Bare","doi":"10.15575/ak.v9i1.17613","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Demam berdarah Dengue (DBD) merupakan penyakit tropis yang diakibatkan oleh gigitan nyamuk yang terinfeksi oleh virus DENV. Beberapa tanaman herbal dapat digunakan untuk mengatasi demam berdarah baik upaya preventif maupun kuratif. Kayu secang merupakan salah satu tanaman herbal kayu yang memiliki berbagai aktivitas biologis, utamanya sebagai immunomodulator dan antivirus. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi aktivitas brazilin dan 3-O-methyl brazilin sebagai obat terapi demam berdarah melalui kajian komputasi. Pendekatan molecular docking digunakan dalam studi penelitian ini. Senyawa brazilin dan 3-O-methyl brazilin diunduh dari database PubChem dan diinteraksikan dengan protein non- structural-5 (NS-5) yang didapatkan dari database PDB. Pemodelan docking dilakukan dengan Molegro virtual Docker versi 5.0 dan dianalisis dengan PyMol 2.2 dan Discovery studio versi 21.1.1. Hasil interaksi menunjukkan bahwa brazilin dan 3-O-methyl brazilin berikatan dengan protein NS-5 di sisi aktif guanosine triphosphate dan daerah RNA dependent RNA polymerase (RdRP). Pengikatan kedua senyawa aktif ini menyebabkan tidak terjadinya replikasi virus DENV pada sel inang dan berpotensi sebagai penghambat infeksi DENV. Berdasarkan analisis in silico, disimpulkan bahwa brazilin dan 3-O-methyl brazilin berpotensi sebagai agen terapi demam berdarah, studi in vitro perlu dilakukan untuk pembuktian lebih lanjut. ","PeriodicalId":34816,"journal":{"name":"AlKimiya Jurnal Ilmu Kimia dan Terapan","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-07-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"AlKimiya Jurnal Ilmu Kimia dan Terapan","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.15575/ak.v9i1.17613","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Abstract
Demam berdarah Dengue (DBD) merupakan penyakit tropis yang diakibatkan oleh gigitan nyamuk yang terinfeksi oleh virus DENV. Beberapa tanaman herbal dapat digunakan untuk mengatasi demam berdarah baik upaya preventif maupun kuratif. Kayu secang merupakan salah satu tanaman herbal kayu yang memiliki berbagai aktivitas biologis, utamanya sebagai immunomodulator dan antivirus. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi aktivitas brazilin dan 3-O-methyl brazilin sebagai obat terapi demam berdarah melalui kajian komputasi. Pendekatan molecular docking digunakan dalam studi penelitian ini. Senyawa brazilin dan 3-O-methyl brazilin diunduh dari database PubChem dan diinteraksikan dengan protein non- structural-5 (NS-5) yang didapatkan dari database PDB. Pemodelan docking dilakukan dengan Molegro virtual Docker versi 5.0 dan dianalisis dengan PyMol 2.2 dan Discovery studio versi 21.1.1. Hasil interaksi menunjukkan bahwa brazilin dan 3-O-methyl brazilin berikatan dengan protein NS-5 di sisi aktif guanosine triphosphate dan daerah RNA dependent RNA polymerase (RdRP). Pengikatan kedua senyawa aktif ini menyebabkan tidak terjadinya replikasi virus DENV pada sel inang dan berpotensi sebagai penghambat infeksi DENV. Berdasarkan analisis in silico, disimpulkan bahwa brazilin dan 3-O-methyl brazilin berpotensi sebagai agen terapi demam berdarah, studi in vitro perlu dilakukan untuk pembuktian lebih lanjut.
登革热是一种热带疾病,由被丹麦病毒感染的蚊子叮咬引起。一些草药可以用于预防和治疗登革热。竹节草是一种具有多种生物活动的植物,主要以免疫调节剂和杀毒软件的形式出现。该研究的目的是确定巴西林的活动和3- o -甲基巴西磷脂作为一种通过计算治疗登革热的药物。分子对接方法在这项研究中使用。brazilin和3-O-methyl brazilin的化合物从PubChem数据库下载,与来自gdp数据库的非结构蛋白进行关联。建模坞采用了虚拟的Docker死角5.0版本,分析了PyMol 2.2和dis1.1版本的发现号工作室。相互作用的结果表明,巴西琳和3- o -甲基乙基与南方子反素蛋白结合在一起。这两种活性化合物的结合阻止了宿主细胞中复制DENV病毒,并有可能抑制DENV感染。根据对silico的分析,我们得出结论,巴西磷脂和3- o -甲基巴西磷脂是一种潜在的登革热治疗药物,因此需要进行体外研究来进一步证明。