Correlation analysis of four KRTAP gene polymorphisms and cashmere fiber diameters in two cashmere goat breeds

Abstract

Abstract Fiber diameter, a quantitative trait, is controlled by minor effect polygenes. Keratin-associated proteins (KRTAPs) are an important part of hair, and their rich polymorphisms facilitate the mining of cashmere trait molecular markers. In this study, Jiangnan and Tibetan cashmere goats were taken as the research object; multiplex PCR and exome sequencing technology were used to identify the exon regional polymorphisms of cashmere goats KRTAP15-1, KRTAP13.1, KRTAP27-1, and KRTAP24-1. The effects of mutation sites on the fiber diameter of cashmere were analyzed by least square method. The results showed that there were 28 mutation sites in the four KRTAP genes in Jiangnan cashmere goats and Tibetan cashmere goat populations. Among them, the KRTAP13.1, KRTAP27-1, and KRTAP24-1 gene polymorphisms were found to be significantly related to the fiber diameter of Jiangnan cashmere goats. The exploration of molecular markers in this study will help to improve the fiber diameter of the down, while the identification of gene polymorphisms will provide original data for the utilization and protection of germplasm resources of cashmere goats. Le diamètre de la fibre, une caractéristique quantitative, est contrôlé par des polygènes à effet mineur. Les protéines associées à la kératine (KRTAPs — «keratin-associated proteins») sont parties importantes des poils, et leurs polymorphismes riches facilitent le minage des marqueurs moléculaires des caractéristiques du cachemire. Dans cette étude, les chèvres à cachemire de Jiangnan et du Tibet ont été utilisées comme objets de recherche. La PCR multiplexe et la technologie de séquençage d’exons ont été utilisées afin de déterminer les polymorphismes régionaux des exons des chèvres à cachemire KRTAP15-1, KRTAP13.1, KRTAP27-1, et KRTAP24-1. Les effets des sites de mutation sur le diamètre de la fibre du cachemire ont été analysés par la méthode des moindres carrés. Les résultats ont montré qu’il y avait 28 sites de mutation dans les quatre gènes KRTAP dans les populations de chèvres à cachemire de Jiangnan et du Tibet. Parmi ceux-ci, les polymorphismes de gènes KRTAP13.1, KRTAP27-1, et KRTAP24-1 se sont avérés reliés de façon significative au diamètre de la fibre des chèvres à cachemire de Jiangnan. L’exploration des marqueurs moléculaires dans cette étude aidera à améliorer le diamètre de la fibre du duvet, tandis que l’identification des polymorphismes des gènes offrira des données originales pour l’utilisation et la protection des ressources du patrimoine génétique des chèvres à cachemire. [Traduit par la Rédaction]