Hae-Ran Kim, Sung‐Ju Jung, Sung-hyun Kim, Jeong-Seon Park, Hee-Taek Ceong, Soonhee Han
{"title":"Data Mining for Scuticociliatosis Outbreak Patterns in Cultured Olive Flounder Paralichthys olivaceus in Jeju, Korea","authors":"Hae-Ran Kim, Sung‐Ju Jung, Sung-hyun Kim, Jeong-Seon Park, Hee-Taek Ceong, Soonhee Han","doi":"10.5657/KFAS.2020.0740","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"제주도 내 넙치 양식장에서는 다양한 질병이 발생하고 있고, 최근에는 수온과 상관없이 연중 다양한 병원체의 혼합 감염 형 태의 질병이 발생하고 있다. 신종 질병에 대한 대비책 마련과 신속한 진단 치료제 개발을 위해서는 국내외 주요 병원체의 특 성, 유전정보, 역학적 정보 등 관련 정보가 체계적으로 수집되어 빅데이터로 관리될 필요성이 대두되고 있다(Kim et al., 2006; Cho et al., 2008; Kim et al., 2010; Cho et al., 2019). 보건 의료 분야에서는 의료 빅데이터에 근거하여 연관규칙 마이닝 기법 을 이용한 질병과 증상과의 관계 추론 연구(Tai and Chiu, 2009; Choi et al., 2010; Park et al., 2016), 질병 간의 연관성(Lee et al., 2010; Sabthami et al., 2016; Kim, 2018)을 파악하는 연구 등이 활발히 진행되고 있지만 수산 양식 분야에서는 데이터 기 반의 연구가 미비한 실정이다. 수산질병진단전문연구소 피쉬 케어(www.fishcare.kr)는 제주지역 양식 어류 진단을 위해 사 육수온, 어류의 체장, 체중, 임상증상, 소견, 병원체 진단, 현미경 관찰 정보들을 상세히 기록하여 2015년부터 축적해 오고 있었 다. 본 연구의 시발점은 이 축적된 질병진단 데이터로부터 내재 되어 있는 의미 있는 패턴을 발견하고자 하는 것이었다. 제주지 역 양식 넙치의 여러 질병 중에서 스쿠티카증이 가장 문제되는 질병 중 하나로 보고되고 있다(Jin et al., 2003; Jin et al., 2015). 원인체인 스쿠티카충은 현미경 관찰로 바로 확인이 가능하며 질병의 증상이 다른 세균과 바이러스성 질병과 확연히 구분되 는 장점이 있어 새로운 분석법을 적용하고 분석한 결과가 타당 한지를 판단하기에 적절한 병원체로 생각되어 스쿠티카증을 질 데이터 마이닝을 이용한 제주 양식 넙치(Paralichthys olivaceus)의 스쿠 티카증 발생 패턴 분석 김해란·정성주·김성현·박정선·정희택·한순희*","PeriodicalId":17917,"journal":{"name":"Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences","volume":"12 1","pages":"740-751"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2020-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.5657/KFAS.2020.0740","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
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Abstract
제주도 내 넙치 양식장에서는 다양한 질병이 발생하고 있고, 최근에는 수온과 상관없이 연중 다양한 병원체의 혼합 감염 형 태의 질병이 발생하고 있다. 신종 질병에 대한 대비책 마련과 신속한 진단 치료제 개발을 위해서는 국내외 주요 병원체의 특 성, 유전정보, 역학적 정보 등 관련 정보가 체계적으로 수집되어 빅데이터로 관리될 필요성이 대두되고 있다(Kim et al., 2006; Cho et al., 2008; Kim et al., 2010; Cho et al., 2019). 보건 의료 분야에서는 의료 빅데이터에 근거하여 연관규칙 마이닝 기법 을 이용한 질병과 증상과의 관계 추론 연구(Tai and Chiu, 2009; Choi et al., 2010; Park et al., 2016), 질병 간의 연관성(Lee et al., 2010; Sabthami et al., 2016; Kim, 2018)을 파악하는 연구 등이 활발히 진행되고 있지만 수산 양식 분야에서는 데이터 기 반의 연구가 미비한 실정이다. 수산질병진단전문연구소 피쉬 케어(www.fishcare.kr)는 제주지역 양식 어류 진단을 위해 사 육수온, 어류의 체장, 체중, 임상증상, 소견, 병원체 진단, 현미경 관찰 정보들을 상세히 기록하여 2015년부터 축적해 오고 있었 다. 본 연구의 시발점은 이 축적된 질병진단 데이터로부터 내재 되어 있는 의미 있는 패턴을 발견하고자 하는 것이었다. 제주지 역 양식 넙치의 여러 질병 중에서 스쿠티카증이 가장 문제되는 질병 중 하나로 보고되고 있다(Jin et al., 2003; Jin et al., 2015). 원인체인 스쿠티카충은 현미경 관찰로 바로 확인이 가능하며 질병의 증상이 다른 세균과 바이러스성 질병과 확연히 구분되 는 장점이 있어 새로운 분석법을 적용하고 분석한 결과가 타당 한지를 판단하기에 적절한 병원체로 생각되어 스쿠티카증을 질 데이터 마이닝을 이용한 제주 양식 넙치(Paralichthys olivaceus)의 스쿠 티카증 발생 패턴 분석 김해란·정성주·김성현·박정선·정희택·한순희*
济州岛内的比目鱼养殖场正在发生多种疾病,最近与水温无关,每年都发生多种病原体的混合感染型疾病。为了制定新型疾病的应对策略和迅速开发诊断治疗剂,有必要系统地收集国内外主要病原体的特性、遗传信息、力学信息等相关信息,进行大数据管理(Kim et al., 2006;cho et al ., 2008;kim et al ., 2010;cho et al ., 2019)。在保健医疗领域,根据医疗大数据,利用相关规则挖掘技术研究疾病与症状的关系推理(Tai and Chiu, 2009;choi et al ., 2010;Park et al., 2016),疾病相关性(Lee et al., 2010;sabthami et al ., 2016;虽然掌握Kim, 2018)的研究等进行得很活跃,但是在水产养殖领域数据基础的研究却不完善。水产疾病诊断专门研究所fishcare (www.fishcare.kr)从2015年开始为济州地区养殖鱼类的诊断,详细记录了四高浓度、鱼类的体长、体重、临床症状、诊断、病原体诊断和显微镜观察等信息。本研究的出发点是想从这些累积的疾病诊断数据中发现内在的有意义的模式。在济州地区养殖偏口鱼的多种疾病中,斯库提卡症被认为是最严重的疾病之一(Jin et al., 2003;jin et al ., 2015)。原因连锁斯库蒂卡线虫是用显微镜观察就是确认可能的,疾病的症状和其他细菌病毒性疾病和明显的优点,适用新的分析法,分析的结果来判断是否妥当的病原体被视为适合卡库蒂斯证会利用数据系统济州养殖比目鱼(paralichthys olivaceus)的斯库蒂卡症发生模式分析金海兰、郑成周、金成贤、朴政善、郑熙泽、韩顺姬