G. Aytoğu, K. Yesilbag, E. B. Toker, Berfin Kadiroğlu, Özer Ateş, P. Tuncer-Göktuna
{"title":"First isolation and characterization of Bovine Herpesvirus 1.2b (BoHV-1.2b ) strain from respiratory tract of cattle in Turkey","authors":"G. Aytoğu, K. Yesilbag, E. B. Toker, Berfin Kadiroğlu, Özer Ateş, P. Tuncer-Göktuna","doi":"10.30782/jrvm.1082913","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLP) tekniği kullanılarak tüm genomun analizinde Bovine Herpesviruses-1 (BoHV-1) suşlarını BoHV-1.1, 1.2a, 1.2b olmak üzere üç alt tipte sınıflandırılmaktadır. Bu alt tipler klinik bulgular göre de değerlendirilmektedir ancak bu yönde henüz net bir ilişkilendirme yapılmamıştır. Çoğunlukla BoHV-1.2b, genital hastalık bulgularıyla ilişkilendirilmektedir. Bu çalışmada solunum yolu hastalığından alınan nazal sürüntü örneğinde BoHV-1 izolatı elde edilmiştir. Bu çalışmada ayrıca, genomun UL44 (Glikoprotein C) bölgesini hedefleyen filogenetik analiz ve UL39 - US3 bölgelerini hedefleyen, yeni geliştirilen bir multipleks PCR analizini takiben Hind III enzimi kullanılarak uygulanan RFLP ile alt tiplendirme gerçekleştirilmiştir. Aynı zamanda izolasyon başarısı iki farklı devamlı hücre hattında karşılaştırılmıştır. SFT-R hücre hattı, BoHV-1 saha örneklerinin izolasyonunda MDBK hücre hattına nazaran daha duyarlı bulunmuştur. Elde edilen izolat (ID:8640), BoHV-1.2b olarak sınıflandırılırken, Cooper suşundan serolojik olarak ayırt edilemediği değerlendirildi. Mevcut çalışma, BoHV-1.2b'nin Türkiye'deki ilk izolasyonunu bildirmesinin yanı sıra klinik solunum yolu hastalığından nadir tespit edilen BoHV-1.2b izolasyonunu bildirmektedir. Sonuçlar ayrıca kolay ve hızlı alt tipleme için PCR tabanlı RFLP analizinin etkinliğini gösteren veriler içermektedir. Ancak BoHV-1 saha izolatlarının genetik çeşitliliğine bağlı olarak bu teknik üzerine daha fazla araştırma yapılmasına ihtiyaç duyulmaktadır.","PeriodicalId":13839,"journal":{"name":"International Journal of Applied Research in Veterinary Medicine","volume":"133 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-07-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"International Journal of Applied Research in Veterinary Medicine","FirstCategoryId":"97","ListUrlMain":"https://doi.org/10.30782/jrvm.1082913","RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"Veterinary","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Abstract
Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLP) tekniği kullanılarak tüm genomun analizinde Bovine Herpesviruses-1 (BoHV-1) suşlarını BoHV-1.1, 1.2a, 1.2b olmak üzere üç alt tipte sınıflandırılmaktadır. Bu alt tipler klinik bulgular göre de değerlendirilmektedir ancak bu yönde henüz net bir ilişkilendirme yapılmamıştır. Çoğunlukla BoHV-1.2b, genital hastalık bulgularıyla ilişkilendirilmektedir. Bu çalışmada solunum yolu hastalığından alınan nazal sürüntü örneğinde BoHV-1 izolatı elde edilmiştir. Bu çalışmada ayrıca, genomun UL44 (Glikoprotein C) bölgesini hedefleyen filogenetik analiz ve UL39 - US3 bölgelerini hedefleyen, yeni geliştirilen bir multipleks PCR analizini takiben Hind III enzimi kullanılarak uygulanan RFLP ile alt tiplendirme gerçekleştirilmiştir. Aynı zamanda izolasyon başarısı iki farklı devamlı hücre hattında karşılaştırılmıştır. SFT-R hücre hattı, BoHV-1 saha örneklerinin izolasyonunda MDBK hücre hattına nazaran daha duyarlı bulunmuştur. Elde edilen izolat (ID:8640), BoHV-1.2b olarak sınıflandırılırken, Cooper suşundan serolojik olarak ayırt edilemediği değerlendirildi. Mevcut çalışma, BoHV-1.2b'nin Türkiye'deki ilk izolasyonunu bildirmesinin yanı sıra klinik solunum yolu hastalığından nadir tespit edilen BoHV-1.2b izolasyonunu bildirmektedir. Sonuçlar ayrıca kolay ve hızlı alt tipleme için PCR tabanlı RFLP analizinin etkinliğini gösteren veriler içermektedir. Ancak BoHV-1 saha izolatlarının genetik çeşitliliğine bağlı olarak bu teknik üzerine daha fazla araştırma yapılmasına ihtiyaç duyulmaktadır.
期刊介绍:
The International Journal of Applied Research in Veterinary Medicine promotes excellence in the clinical practice of veterinary medicine by disseminating fundamental scientific, diagnostic, and treatment knowledge gained from prospective and retrospective research in a timely manner. The Journal fulfills its mission through rapid peer review of each submitted article, and publication of all articles within 90 days of acceptance. All published articles meet the standards of Balance, Independence, Objectivity and Scientific Rigor.