{"title":"SAGA COMPLEX ESSENTIAL FOR THE REGULATION OF GENES INVOLVED IN TREHALOSE METABOLISM","authors":"Tulay Turgut Genc","doi":"10.23902/trkjnat.1131400","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Saccharomyces cerevisiae maya hücreleri, olumsuz çevre koşullarında stres metaboliti olarak trehaloz biriktirir. Hücre içi trehaloz miktarının düzenlenmesinde trehalozun sentezi ve yıkımı önemlidir. Bu nedenle, TPS1 ve NTH1 gen ekspresyonları transkripsiyon ve translasyon sırasında sıkı bir şekilde düzenlenmektedir. Her iki genin promotor bölgesinde Stres Tepki Elementleri bulunduğundan stres koşullarında birlikte aktive olurlar. Ancak her iki genin promotor bölgesinde benzer düzenleyici elemanların bulunması bu genlerin transkripsiyon seviyesinde farklı bir regülasyona uğradıklarını göstermektedir. Çalışmamızda, besin açlığında TPS1 ve NTH1 genlerinin transkripsiyonel düzenlenmesinde SAGA kompleksinin rolü analiz edildi. Ayrıca yaban tip ve mutant maya hücrelerinde trehaloz seviyesi enzimatik olarak tespit edildi. TPS1 ve NTH1 genlerinin in silico promotor analizi sonucunda Msn2/4 transkripsiyon faktörlerinin bağlanması için gerekli olan STRE dizilerinin NTH1 promotorunda nükleozomlar tarafından kapatıldığı TPS1 promotorunda ise açıkta kaldıkları belirlendi. Ada1 proteininin yokluğunda, TPS1 geninde stres kaynaklı promotor aktivasyonu gözlenirken, NTH1 geninde promotor aktivasyonu gözlenmedi. Bu sonuçlara göre, Ada1 proteininin yokluğunda STRE dizilerini kaplayan nükleozomlar mobilize edilemediğinden Msn2/4 transkripsiyon faktörleri stres koşullarında promotora bağlanamayarak transkripsiyonu aktive edememiş olabilir. Ayrıca stres koşullarından bağımsız olarak, Ada1 proteininin yokluğunda maya hücrelerindeki trehaloz birikiminin azaldığı gözlendi.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"25 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.5000,"publicationDate":"2022-09-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Trakya University Journal of Natural Sciences","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.1131400","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"MULTIDISCIPLINARY SCIENCES","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Abstract
Saccharomyces cerevisiae maya hücreleri, olumsuz çevre koşullarında stres metaboliti olarak trehaloz biriktirir. Hücre içi trehaloz miktarının düzenlenmesinde trehalozun sentezi ve yıkımı önemlidir. Bu nedenle, TPS1 ve NTH1 gen ekspresyonları transkripsiyon ve translasyon sırasında sıkı bir şekilde düzenlenmektedir. Her iki genin promotor bölgesinde Stres Tepki Elementleri bulunduğundan stres koşullarında birlikte aktive olurlar. Ancak her iki genin promotor bölgesinde benzer düzenleyici elemanların bulunması bu genlerin transkripsiyon seviyesinde farklı bir regülasyona uğradıklarını göstermektedir. Çalışmamızda, besin açlığında TPS1 ve NTH1 genlerinin transkripsiyonel düzenlenmesinde SAGA kompleksinin rolü analiz edildi. Ayrıca yaban tip ve mutant maya hücrelerinde trehaloz seviyesi enzimatik olarak tespit edildi. TPS1 ve NTH1 genlerinin in silico promotor analizi sonucunda Msn2/4 transkripsiyon faktörlerinin bağlanması için gerekli olan STRE dizilerinin NTH1 promotorunda nükleozomlar tarafından kapatıldığı TPS1 promotorunda ise açıkta kaldıkları belirlendi. Ada1 proteininin yokluğunda, TPS1 geninde stres kaynaklı promotor aktivasyonu gözlenirken, NTH1 geninde promotor aktivasyonu gözlenmedi. Bu sonuçlara göre, Ada1 proteininin yokluğunda STRE dizilerini kaplayan nükleozomlar mobilize edilemediğinden Msn2/4 transkripsiyon faktörleri stres koşullarında promotora bağlanamayarak transkripsiyonu aktive edememiş olabilir. Ayrıca stres koşullarından bağımsız olarak, Ada1 proteininin yokluğunda maya hücrelerindeki trehaloz birikiminin azaldığı gözlendi.