Genome Information and the Repetitive Sequences in Candida albicans

Nippon Ishinkin Gakkai Zasshi Pub Date : 1997-10-30 DOI:10.3314/JJMM.38.279

Y. Nakagawa

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Abstract

Candida albicansで頻繁に観察される染色体サイズの多型現象の研究が発端となって,反復配列RPSが発見された.RPSはゲノム内に60-80コピー存在し,いくつかの染色体では複数のRPSが直列に配置している.多数のRPSをゲノムDNAよりクローン化し,塩基配列を決定したところ,多くの興味ある事実が得られた.RPSには172bpからなる内部反復配列altが存在し,この配列の繰り返しの多様性がRPSのサイズ,塩基配列の多様性を生み出していることが明らかになった.RPSの解析を進める過程で,RPSに隣接した領域が,RPS同様に各染色体に存在していることがわかってきた.ノーザン分析の結果より,この領域がRNAに転写されていることがわかった.そこで,cDNAライブラリよりクローン化して配列決定を行ったところ,機能すると予想されるORFが存在しなかったことから,この領域がRNA分子として働いていることが想像された.最近になって,RPSに隣接する新規反復配列を発見し,これらの反復配列群がまとまって染色体の構成や機能に必須の役割を果たしていると考えている.C.albicansをめぐる以上のようなゲノム,遺伝子に関する情報は,インターネット上に蓄積され,研究者が共有できる情報としてますます充実しつつある.

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白色念珠菌基因组信息与重复序列

candidaalbicans中频繁观察到的染色体尺寸多态性现象的研究作为发端，发现了重复序列RPS。RPS在基因组中存在60-80个拷贝，在一些染色体中多个RPS串联排列。。将多个RPS通过基因组DNA进行克隆，确定碱基序列，得到了很多有趣的事实。在RPS中存在172bp的内部重复序列alt，该序列重复的多样性决定了RPS的大小;在对RPS进行分析的过程中，发现与RPS相邻的区域与RPS一样存在于各染色体中。根据核验分析结果，该区域为RNA通过cDNA库进行克隆并进行测序，结果发现预想中发挥作用的ORF并不存在，由此可以想象该区域作为RNA分子发挥作用。被。最近发现了与RPS相邻的新重复序列，认为这些重复序列群在染色体的构成和功能中发挥着必需的作用。关于围绕c.l bicans的上述基因组和基因所收集的信息在互联网上积累，作为研究人员能够共享的信息越来越充实。

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The 50th Anniversary Educational Symposium of the Japanese Society for Medical Mycolgy Clinico-Pathological Conference Mystery of Fermanted-Foods 1996 Epidemiological Survey of Dermatophytoses in Japan. Molecular Biological Approach to Morphological Differentiation in Candida albicans