A macro-array-based screening approach to identify transcriptional factors involved in the nitrogen-related root plasticity response of Arabidopsis thaliana

Abstract

Utilisation de macro-arrays pour identifier des facteurs de transcription impliques dans la reponse de plasticite racinaire a l'azote chez Arabidopsis thaliana. Des plantes d'Arabidopsis thaliana sont cultivees dans des boites de Petri verticales, sur un milieu gelose ou l'azote est apporte sous forme de KNO 3 0,1, 0,5 ou 10 mM, ou de KNO 3 0,5 mM additionne de glutamine ou d'asparagine 5 mM. Le traitement KNO 3 10 mM correspond aux plus faibles nombre et longueur de racines laterales. Leur developpement est inhibe a Un stade posterieur a l'initiation des primordia et anterieur a leur emergence. Des membranes Nylon (macro-arrays) contenant 126 EST de facteurs de transcription potentiels sont construites afin d'identifier des genes regulateurs impliques dans cette reponse d'architecture racinaire. L'analyse des profils d'expression dans les racines et les parties aeriennes de plantes cultivees sur les differentes sources d'azote indiquent que les genes repondant aux traitements sont peu nombreux, et que la plus forte variation est obtenue lorsque l'on compare les traitements KNO 3 10 mM et KNO 3 0,5 mM.