实时聚合酶链反应(qPCR)与熔化曲线耦合的验证,作为诊断耐多药结核病的替代工具

Brayan Mercado Michel, Aneth Vasquez Michel
{"title":"实时聚合酶链反应(qPCR)与熔化曲线耦合的验证,作为诊断耐多药结核病的替代工具","authors":"Brayan Mercado Michel, Aneth Vasquez Michel","doi":"10.53287/vbgg9961cx41z","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"La tuberculosis es una enfermedad infecto-contagiosa, causada por diversas especies del Complejo Mycobacterium tuberculosis, actualmente se estima que un tercio de la población mundial se encuentra afectada por lo que representa una amenaza para la salud pública, principalmente por el surgimiento de cepas Multidrogorresistentes (TB-MDR). En Bolivia se reportaron 7.538 personas enfermas con Tuberculosis, los últimos datos sobre TB-MDR indican un aumento de 0,2% por año, el año 2019 se registró un 3,1% de TB-MDR. Actualmente en nuestro país se emplean métodos moleculares para la identificación de este agente infeccioso; no obstante, existen muy pocos o ningún trabajo acerca de la aplicación de métodos moleculares para la detección precisa y efectiva de cepas TB-MDR que otorguen validez a los resultados emitidos. Este trabajo resuelve el cuestionamiento de, si la PCR en tiempo real (RT-qPCR) acoplada a curvas melting es una herramienta de diagnóstico alternativo aplicable, para la identificación de Tuberculosis Multidrogorresistente. Materiales y Métodos: Se trabajó con 74 cepas de Mycobaterium tuberculosis fenotípicamente identificadas por cultivo (método de las proporciones, Canetti Rist) como gold standar. El material genético para las pruebas moleculares se obtuvo por el método de columnas, se utilizaron dos controles primarios para la determinación de resistencia a los fármacos Isoniacida y Rifampicina, tanto los controles como las muestras se procesaron por RT-qPCR acoplada a curvas melting, mediante cambios de temperatura de disociación. Resultados: Loa parámetros de test diagnóstico de la prueba demostraron sensibilidad: 67.4%, especificidad: 83.3%, Exactitud: 73.97%, VPP: 85.3%, VPN: 64.1% para Isoniacida. Mientras que para Rifampicina: Sensibilidad: 97%, especificidad: 20%, exactitud: 58.9%, VPP: 55.4% y VPN: 87.5%. Conclusión: El método evaluado para la determinación de resistencia a Isoniacida presenta un equilibrio entre sensibilidad y especificidad, por lo que representa una alternativa diagnóstica confiable, mientras que para resistencia a Rifampicina presenta una alta sensibilidad que es muy útil para países endémicos como el nuestro.","PeriodicalId":136577,"journal":{"name":"REVISTA CON-CIENCIA","volume":"30 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-08-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Validación de la Reacción en Cadena de la Polimerasa En Tiempo Real (qPCR) acoplada a curvas melting como herramienta alternativa para el diagnóstico de Tuberculosis Mutidrogorresistente\",\"authors\":\"Brayan Mercado Michel, Aneth Vasquez Michel\",\"doi\":\"10.53287/vbgg9961cx41z\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"La tuberculosis es una enfermedad infecto-contagiosa, causada por diversas especies del Complejo Mycobacterium tuberculosis, actualmente se estima que un tercio de la población mundial se encuentra afectada por lo que representa una amenaza para la salud pública, principalmente por el surgimiento de cepas Multidrogorresistentes (TB-MDR). 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摘要

结核是一种复合infecto-contagiosa,由若干种结核分枝杆菌,目前据估计,全球三分之一的人口受到比公共卫生威胁,主要由Multidrogorresistentes菌株的出现(mdr - tb)。玻利维亚报告有7538人患有结核病,最新的耐多药结核数据显示每年增长0.2%,2019年记录的耐多药结核病例为3.1%。目前,我国采用分子方法鉴定这种传染性病原体;然而,很少或没有工作存在关于分子检测方法和更加有效地给予有效发行结果广泛耐药结核菌株。这个工作解决问题,如果实时PCR (RT-qPCR) acoplada曲线适用替代melting是一种诊断工具,以查明Multidrogorresistente结核病。材料和方法:曾与74结核菌的Mycobaterium fenotípicamente所确定的种植比例,method (Canetti Rist)作为gold standar。获得了遗传物质的分子检测方法列,主要采用了两个控件来抵抗决心药物异烟肼和利福平,无论是控制人口样本RT-qPCR acoplada通过温度的变化曲线melting,宰割。结果:异烟酸诊断试验参数灵敏度为67.4%,特异性为83.3%,准确度为73.97%,ppv为85.3%,npv为64.1%。而利::97%的灵敏度、特异性:20%,准确性:58.9%,VPP 55.4%和VPN: 87.5%。结论:该方法在敏感性和特异性之间取得了平衡,是一种可靠的诊断方法,而利福平耐药方法具有较高的敏感性,对我国等流行国家非常有用。
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Validación de la Reacción en Cadena de la Polimerasa En Tiempo Real (qPCR) acoplada a curvas melting como herramienta alternativa para el diagnóstico de Tuberculosis Mutidrogorresistente
La tuberculosis es una enfermedad infecto-contagiosa, causada por diversas especies del Complejo Mycobacterium tuberculosis, actualmente se estima que un tercio de la población mundial se encuentra afectada por lo que representa una amenaza para la salud pública, principalmente por el surgimiento de cepas Multidrogorresistentes (TB-MDR). En Bolivia se reportaron 7.538 personas enfermas con Tuberculosis, los últimos datos sobre TB-MDR indican un aumento de 0,2% por año, el año 2019 se registró un 3,1% de TB-MDR. Actualmente en nuestro país se emplean métodos moleculares para la identificación de este agente infeccioso; no obstante, existen muy pocos o ningún trabajo acerca de la aplicación de métodos moleculares para la detección precisa y efectiva de cepas TB-MDR que otorguen validez a los resultados emitidos. Este trabajo resuelve el cuestionamiento de, si la PCR en tiempo real (RT-qPCR) acoplada a curvas melting es una herramienta de diagnóstico alternativo aplicable, para la identificación de Tuberculosis Multidrogorresistente. Materiales y Métodos: Se trabajó con 74 cepas de Mycobaterium tuberculosis fenotípicamente identificadas por cultivo (método de las proporciones, Canetti Rist) como gold standar. El material genético para las pruebas moleculares se obtuvo por el método de columnas, se utilizaron dos controles primarios para la determinación de resistencia a los fármacos Isoniacida y Rifampicina, tanto los controles como las muestras se procesaron por RT-qPCR acoplada a curvas melting, mediante cambios de temperatura de disociación. Resultados: Loa parámetros de test diagnóstico de la prueba demostraron sensibilidad: 67.4%, especificidad: 83.3%, Exactitud: 73.97%, VPP: 85.3%, VPN: 64.1% para Isoniacida. Mientras que para Rifampicina: Sensibilidad: 97%, especificidad: 20%, exactitud: 58.9%, VPP: 55.4% y VPN: 87.5%. Conclusión: El método evaluado para la determinación de resistencia a Isoniacida presenta un equilibrio entre sensibilidad y especificidad, por lo que representa una alternativa diagnóstica confiable, mientras que para resistencia a Rifampicina presenta una alta sensibilidad que es muy útil para países endémicos como el nuestro.
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