Yunus Başar, Semiha Yenigün, F. Gül, T. Ozen, Ibrahim Demirtas, M. Alma, S. Temel
{"title":"对Atriplex nitens Schkuhr粗提取物进行植物化学分析、分子对接和ADMET预测,以筛选抗氧化剂和脲酶抑制剂","authors":"Yunus Başar, Semiha Yenigün, F. Gül, T. Ozen, Ibrahim Demirtas, M. Alma, S. Temel","doi":"10.32571/ijct.1389719","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Dünyanın kurak ve yarı kurak bölgelerinde doğal olarak yetişen Atriplex nitens Schkuhr (ANS), kuraklığa ve tuzlu ortamlara karşı oldukça dayanıklı olup gıda ve hayvan yemi olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada ilk olarak ANS'nin elde edilen metanol ham ekstraktı üzerinde fitokimyasal analiz ile antioksidan ve üreaz inhibisyon aktiviteleri gerçekleştirilmiştir. LC-MS/MS sonuçlarına göre kateşin ve izokersitrin ana bileşikler olarak tespit edildi. Ekstraktın GC-MS/MS analizinde oleik asit metil ester (%31.71), palmitik asit metil ester (%25.87), linoleik asit metil ester (19.61) ve nonakozan (%6.81) tespit edildi. ANS ekstraktının posfomolibden indrgenme, DPPH֗ giderici ve üreaz inhibisyon aktiviteleri sırasıyla 67.27±23.83, 7.85±0.44 ve 6.58±0.48 µg/mL düzeyinde etkili bulunmuştur. Bu araştırmada öncelikle ANS ekstraktının biyolojik aktivitesi ve kimyasal bileşimi incelenmiştir. Bu bitkinin en bol bulunan iki bileşeni üzerinde moleküler yerleştirme ve ADMET tahmini gerçekleştirildi. İzokersitrin üreazının (MolDock skoru -121.42, bağlanma afinitesi -8.60 ve bağlanma sabiti 0.62 µM) üreaz ile etkileşiminin üreaz ile etkileşiminin daha yüksek olduğu belirlendi. Bu iki bileşenin toksisite açısından ihmal edilebilir bir potansiyeli vardır. Boiled Egg grafiği kateşin için önemli bir GIa'ya işaret etmektedir. Ancak izokersitrin BBB veya GLa geçirgenliği gösterdi. Moleküler etkileşimde isokersitrin en iyisidir, ADMET'te ise kateşin en iyisidir. Ana bileşen izokersitrinin mide hastalıkların karşı etkili olabileceği belirlendi ve BBB ile GLa sistemlerinde gözlemlenmemesi desteklendi.","PeriodicalId":267255,"journal":{"name":"International Journal of Chemistry and Technology","volume":"104 49","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-12-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Phytochemical profiling, molecular docking and ADMET prediction of crude extract of Atriplex nitens Schkuhr for the screening of antioxidant and urease inhibitory\",\"authors\":\"Yunus Başar, Semiha Yenigün, F. Gül, T. Ozen, Ibrahim Demirtas, M. Alma, S. Temel\",\"doi\":\"10.32571/ijct.1389719\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Dünyanın kurak ve yarı kurak bölgelerinde doğal olarak yetişen Atriplex nitens Schkuhr (ANS), kuraklığa ve tuzlu ortamlara karşı oldukça dayanıklı olup gıda ve hayvan yemi olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada ilk olarak ANS'nin elde edilen metanol ham ekstraktı üzerinde fitokimyasal analiz ile antioksidan ve üreaz inhibisyon aktiviteleri gerçekleştirilmiştir. LC-MS/MS sonuçlarına göre kateşin ve izokersitrin ana bileşikler olarak tespit edildi. Ekstraktın GC-MS/MS analizinde oleik asit metil ester (%31.71), palmitik asit metil ester (%25.87), linoleik asit metil ester (19.61) ve nonakozan (%6.81) tespit edildi. ANS ekstraktının posfomolibden indrgenme, DPPH֗ giderici ve üreaz inhibisyon aktiviteleri sırasıyla 67.27±23.83, 7.85±0.44 ve 6.58±0.48 µg/mL düzeyinde etkili bulunmuştur. Bu araştırmada öncelikle ANS ekstraktının biyolojik aktivitesi ve kimyasal bileşimi incelenmiştir. Bu bitkinin en bol bulunan iki bileşeni üzerinde moleküler yerleştirme ve ADMET tahmini gerçekleştirildi. İzokersitrin üreazının (MolDock skoru -121.42, bağlanma afinitesi -8.60 ve bağlanma sabiti 0.62 µM) üreaz ile etkileşiminin üreaz ile etkileşiminin daha yüksek olduğu belirlendi. Bu iki bileşenin toksisite açısından ihmal edilebilir bir potansiyeli vardır. Boiled Egg grafiği kateşin için önemli bir GIa'ya işaret etmektedir. Ancak izokersitrin BBB veya GLa geçirgenliği gösterdi. Moleküler etkileşimde isokersitrin en iyisidir, ADMET'te ise kateşin en iyisidir. Ana bileşen izokersitrinin mide hastalıkların karşı etkili olabileceği belirlendi ve BBB ile GLa sistemlerinde gözlemlenmemesi desteklendi.\",\"PeriodicalId\":267255,\"journal\":{\"name\":\"International Journal of Chemistry and Technology\",\"volume\":\"104 49\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-12-31\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"International Journal of Chemistry and Technology\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.32571/ijct.1389719\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"International Journal of Chemistry and Technology","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.32571/ijct.1389719","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
Phytochemical profiling, molecular docking and ADMET prediction of crude extract of Atriplex nitens Schkuhr for the screening of antioxidant and urease inhibitory
Dünyanın kurak ve yarı kurak bölgelerinde doğal olarak yetişen Atriplex nitens Schkuhr (ANS), kuraklığa ve tuzlu ortamlara karşı oldukça dayanıklı olup gıda ve hayvan yemi olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada ilk olarak ANS'nin elde edilen metanol ham ekstraktı üzerinde fitokimyasal analiz ile antioksidan ve üreaz inhibisyon aktiviteleri gerçekleştirilmiştir. LC-MS/MS sonuçlarına göre kateşin ve izokersitrin ana bileşikler olarak tespit edildi. Ekstraktın GC-MS/MS analizinde oleik asit metil ester (%31.71), palmitik asit metil ester (%25.87), linoleik asit metil ester (19.61) ve nonakozan (%6.81) tespit edildi. ANS ekstraktının posfomolibden indrgenme, DPPH֗ giderici ve üreaz inhibisyon aktiviteleri sırasıyla 67.27±23.83, 7.85±0.44 ve 6.58±0.48 µg/mL düzeyinde etkili bulunmuştur. Bu araştırmada öncelikle ANS ekstraktının biyolojik aktivitesi ve kimyasal bileşimi incelenmiştir. Bu bitkinin en bol bulunan iki bileşeni üzerinde moleküler yerleştirme ve ADMET tahmini gerçekleştirildi. İzokersitrin üreazının (MolDock skoru -121.42, bağlanma afinitesi -8.60 ve bağlanma sabiti 0.62 µM) üreaz ile etkileşiminin üreaz ile etkileşiminin daha yüksek olduğu belirlendi. Bu iki bileşenin toksisite açısından ihmal edilebilir bir potansiyeli vardır. Boiled Egg grafiği kateşin için önemli bir GIa'ya işaret etmektedir. Ancak izokersitrin BBB veya GLa geçirgenliği gösterdi. Moleküler etkileşimde isokersitrin en iyisidir, ADMET'te ise kateşin en iyisidir. Ana bileşen izokersitrinin mide hastalıkların karşı etkili olabileceği belirlendi ve BBB ile GLa sistemlerinde gözlemlenmemesi desteklendi.