使用微卫星标记表征和分析桑树(Morus spp)品种的遗传变异。

Julián David Trochez, I. Paz, Martha Almanza, X. Ruiz
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Se evaluaron parámetros de diversidad y estructura genética y, adicionalmente, se determinaron relaciones genéticas mediante un Análisis de Clúster.  Resultados y conclusiones: fueron detectados 49 alelos, con un PIC medio de 0,57, indicando el empleo de marcadores polimórficos e informativos. El análisis de estructura poblacional con método bayesiano (STRUCTURE v 2.3.4) y el de agrupamiento (Neighbor-joining, PCoA) indicaron tres grupos poblacionales discretos, con una diferenciación genética significativa del 22% (AMOVA-Fst; p<0,001). 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摘要

背景:遗传多样性分析是保护和充分利用动植物遗传资源的基础,也是制定选育和改良战略以获得有前途材料的关键。知识差距:关于哥伦比亚桑树属植物遗传变异特征和分析的研究报告很少,因此有必要开展相关研究,以便提供信息,改进和优化现有种质的管理、使用和保护,促进恢复和利用这些遗传资源的潜力。 目的:该研究旨在使用微卫星标记对高加索蚕桑项目收集的桑属植物进行基因定性。方法:使用 10 个荧光标记微卫星对保存在考卡大学雷乔亚植物研究中心的 36 个桑树样本进行了评估。评估了多样性和遗传结构参数,并通过聚类分析确定了遗传关系。 结果与结论:共检测到 49 个等位基因,平均 PIC 为 0.57,表明使用了多态性和信息量丰富的标记。用贝叶斯方法(STRUCTURE v 2.3.4)和聚类分析(Neighbour-joining,PCoA)进行的种群结构分析表明,有三个离散的种群群体,遗传差异显著,达 22%(AMOVA-Fst;P<0.001)。值得注意的是,发现了 19 种不同的基因型,这表明存在大量重复材料,应进行评估,以消除基因库中的多余资源。
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Caracterización y análisis de la variabilidad genética de accesiones de morera (Morus spp) empleando marcadores microsatélites
Contextualización: el análisis de diversidad genética es fundamental para conservar y aprovechar adecuadamente los recursos genéticos, tanto vegetales como animales, además trascendental para el desarrollo de estrategias de selección y mejoramiento para la obtención de materiales promisorios. Vacío de conocimiento: los estudios de caracterización y análisis de la variabilidad genética reportados para morera Morus spp en Colombia son pocos, por lo que es necesario su desarrollo a fin de proporcionar información que permita depurar y optimizar, tanto el manejo como el uso y la conservación del germoplasma disponible, aportando a la recuperación y aprovechamiento del potencial de estos recursos genéticos.  Propósito: la investigación se orientó a caracterizar genéticamente la colección de morera Morus spp del proyecto de sericultura caucana empleando marcadores microsatélites. Metodología: se evaluaron 36 accesiones pertenecientes a la colección de morera conservada en el Centro de Estudios Vegetales de La Rejoya, Universidad del Cauca, utilizando 10 microsatélites marcados con fluorescencia. Se evaluaron parámetros de diversidad y estructura genética y, adicionalmente, se determinaron relaciones genéticas mediante un Análisis de Clúster.  Resultados y conclusiones: fueron detectados 49 alelos, con un PIC medio de 0,57, indicando el empleo de marcadores polimórficos e informativos. El análisis de estructura poblacional con método bayesiano (STRUCTURE v 2.3.4) y el de agrupamiento (Neighbor-joining, PCoA) indicaron tres grupos poblacionales discretos, con una diferenciación genética significativa del 22% (AMOVA-Fst; p<0,001). Destacó el hallazgo de 19 genotipos diferentes, sugiriendo la presencia de un alto número de materiales duplicados que deberán ser evaluados para posible eliminación de recursos redundantes en el banco de germoplasma.
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