选定番茄栽培品种之间的遗传关系以及对某些病原体抗性水平的测定

Gülbanu Kiymaci, Ayse Ozgur Uncu, Ö. Türkmen
{"title":"选定番茄栽培品种之间的遗传关系以及对某些病原体抗性水平的测定","authors":"Gülbanu Kiymaci, Ayse Ozgur Uncu, Ö. Türkmen","doi":"10.29278/azd.1356756","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Amaç: Günümüzde, çevre dostu üretim tekniklerinin geliştirilmesi, verim ve kalitenin arttırılması ve yetiştiricilerin daha az maaliyetle üretim yapabilmeleri için hastalık ve zararlılara karşı direnç genlerini içeren hibrit çeşitler geliştirmek zorunluluk haline gelmiştir. Çalışma kapsamında agromorfolojik özellikleri bakımından ebeveyn olmaya uygun bir domates genotip koleksiyonu içinde genetik benzerlik ilişkilerinin ortaya konması ve bu genotiplerin Meloidogyne incognita, Tomato Mosaic Virus, Verticillium wilt, Tomato Spotted Wilt Virus, Tomato Yellow Leaf CurlingVirus Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici patojenlerine karşı dayanıklılık seviyelerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Materyal ve Yöntem: Çalışmada, genotipler arası akrabalık ilişkilerin belirlenmesi ve adı geçen patojenlere karşı dayanımlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmanın arazi aşaması Antalya'da bulunan SELKO şirketine ait olan AR-Ge serasında, moleküler çalışmalar ise Necmettin Erbakan Üniversitesi Fen Fakültesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Laboratuvarında yürütülmüştür. Araştırma Bulguları: Çalışmamızda 92 adet domates genotipinde toplam 137 adet SSR alleli elde edilmiştir. Çalışmada kullanılan SSR markörlerinin ortalama PIC değeri 0.49’dur. En yüksek PIC değeri olan markörün 0.496 değeri ile LE15 olduğu belirlenmiştir. Domates genotipleri arasındaki genetik çeşitlilik unweighted Neigbor-joining (NJ) yöntemi kullanılarak belirlenmiş ve dendrogramı oluşturulmuştur. Genetik çeşitlilik analizi sonucu çalışmaya dahil genotiplerin altı gruba ayrıldığı belirlenmiştir. Genotiplerin gruplara sayıca dağılımı A grubunda 14, B grubunda 13, C grubunda 17, D grubunda 17, E grubunda 13, F grubunda ise 17 genotip şeklinde gerçekleşmiştir. Uzaklık matrisi ve oluşturulan dendrogramı arasında, yüksek düzeyde korelasyon görülmektedir (r = 0.91). Ortalama benzemezlik değeri, 0,38 olarak belirlenmiştir. Sonuç: ESTSSR allel verileri ile gerçekleştirilen çeşitlilik analizi sonucunda oluşturulan NJ dendrogramı, genotiplerinin dört ana küme oluşturduğu ve genotiplerin altı grupta toplandığı belirlenmiştir. Ortalama benzemezlik değeri 0,38 olarak belirlenmiştir. Domates tarımında verimliliği olumsuz yönde etkileyen birçok abiyotik stres faktörü mevcuttur. Verimlilik için hastalık ve zararlılara karşı dayanıklılık alellerinesahip genotiplerin varlığı oldukça önemlidir. Çalışma sonucunda Meloidogyne incognita, Tomato Mosaic Virus, Verticillium wilt, Tomato Spotted Wilt Virus, Tomato Yellow Leaf Curling Virus, Fusarium oxysporum f. sp. patojenlerin tümüne birden 1,5,11, 26, 28, 40,53, 63, 66, 70, 79, 87 ve 88 nolu genotipler dayanıklı bulunmuştur.","PeriodicalId":7545,"journal":{"name":"Akademik Ziraat Dergisi","volume":"406 19","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-12-13","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Seçilmiş Domatesler Arasında Genetik İlişkiler ve Bazı Patojenlere Karşı Dayanım Düzeylerinin Belirlenmesi\",\"authors\":\"Gülbanu Kiymaci, Ayse Ozgur Uncu, Ö. Türkmen\",\"doi\":\"10.29278/azd.1356756\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Amaç: Günümüzde, çevre dostu üretim tekniklerinin geliştirilmesi, verim ve kalitenin arttırılması ve yetiştiricilerin daha az maaliyetle üretim yapabilmeleri için hastalık ve zararlılara karşı direnç genlerini içeren hibrit çeşitler geliştirmek zorunluluk haline gelmiştir. Çalışma kapsamında agromorfolojik özellikleri bakımından ebeveyn olmaya uygun bir domates genotip koleksiyonu içinde genetik benzerlik ilişkilerinin ortaya konması ve bu genotiplerin Meloidogyne incognita, Tomato Mosaic Virus, Verticillium wilt, Tomato Spotted Wilt Virus, Tomato Yellow Leaf CurlingVirus Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici patojenlerine karşı dayanıklılık seviyelerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Materyal ve Yöntem: Çalışmada, genotipler arası akrabalık ilişkilerin belirlenmesi ve adı geçen patojenlere karşı dayanımlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmanın arazi aşaması Antalya'da bulunan SELKO şirketine ait olan AR-Ge serasında, moleküler çalışmalar ise Necmettin Erbakan Üniversitesi Fen Fakültesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Laboratuvarında yürütülmüştür. Araştırma Bulguları: Çalışmamızda 92 adet domates genotipinde toplam 137 adet SSR alleli elde edilmiştir. Çalışmada kullanılan SSR markörlerinin ortalama PIC değeri 0.49’dur. En yüksek PIC değeri olan markörün 0.496 değeri ile LE15 olduğu belirlenmiştir. Domates genotipleri arasındaki genetik çeşitlilik unweighted Neigbor-joining (NJ) yöntemi kullanılarak belirlenmiş ve dendrogramı oluşturulmuştur. Genetik çeşitlilik analizi sonucu çalışmaya dahil genotiplerin altı gruba ayrıldığı belirlenmiştir. Genotiplerin gruplara sayıca dağılımı A grubunda 14, B grubunda 13, C grubunda 17, D grubunda 17, E grubunda 13, F grubunda ise 17 genotip şeklinde gerçekleşmiştir. Uzaklık matrisi ve oluşturulan dendrogramı arasında, yüksek düzeyde korelasyon görülmektedir (r = 0.91). Ortalama benzemezlik değeri, 0,38 olarak belirlenmiştir. Sonuç: ESTSSR allel verileri ile gerçekleştirilen çeşitlilik analizi sonucunda oluşturulan NJ dendrogramı, genotiplerinin dört ana küme oluşturduğu ve genotiplerin altı grupta toplandığı belirlenmiştir. Ortalama benzemezlik değeri 0,38 olarak belirlenmiştir. Domates tarımında verimliliği olumsuz yönde etkileyen birçok abiyotik stres faktörü mevcuttur. Verimlilik için hastalık ve zararlılara karşı dayanıklılık alellerinesahip genotiplerin varlığı oldukça önemlidir. Çalışma sonucunda Meloidogyne incognita, Tomato Mosaic Virus, Verticillium wilt, Tomato Spotted Wilt Virus, Tomato Yellow Leaf Curling Virus, Fusarium oxysporum f. sp. patojenlerin tümüne birden 1,5,11, 26, 28, 40,53, 63, 66, 70, 79, 87 ve 88 nolu genotipler dayanıklı bulunmuştur.\",\"PeriodicalId\":7545,\"journal\":{\"name\":\"Akademik Ziraat Dergisi\",\"volume\":\"406 19\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-12-13\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Akademik Ziraat Dergisi\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.29278/azd.1356756\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Akademik Ziraat Dergisi","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.29278/azd.1356756","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

目的:如今,为了开发环境友好型生产技术,提高产量和质量,使种植者以更低的成本进行生产,开发含有抗病虫害基因的杂交品种已成为一种必要。本研究的目的是确定适合作为亲本的番茄基因型在农业形态特征方面的遗传相似性关系,并确定这些基因型对Meloidogyne incognita、番茄花叶病毒、轮纹病、番茄斑萎病毒、番茄黄叶卷曲病毒、镰刀菌(Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici)等病原体的抗性水平。 材料与方法:本研究旨在确定基因型之间的亲缘关系,并确定它们对上述病原体的抗性。研究的实地阶段在安塔利亚 SELKO 公司的研发温室进行,分子研究在内克梅廷-埃尔巴坎大学理学院分子生物学和遗传学实验室进行。 研究结果:在我们的研究中,92 个番茄基因型共获得了 137 个 SSR 等位基因。研究中使用的 SSR 标记的平均 PIC 值为 0.49。PIC值最高的标记是LE15,为0.496。番茄基因型之间的遗传多样性是通过非加权新连接(NJ)方法确定的,并绘制了树枝图。遗传多样性分析结果表明,本研究中的基因型被分为六组。A 组有 14 个基因型,B 组有 13 个基因型,C 组有 17 个基因型,D 组有 17 个基因型,E 组有 13 个基因型,F 组有 17 个基因型。 距离矩阵与树枝图之间的相关性很高(r = 0.91)。平均差异值为 0.38。 结论利用ESTSSR等位基因数据进行多样性分析后绘制的 NJ 树枝图显示,基因型形成了四个主要聚类,基因型被分为六组。平均差异值为 0.38。有许多非生物胁迫因素对番茄栽培的产量产生负面影响。具有抗病虫害等位基因的基因型对生产率非常重要。研究结果表明,Meloidogyne incognita、番茄花叶病毒、轮纹病、番茄斑萎病毒、番茄黄叶卷曲病毒、Fusarium oxysporum f. sp.基因型 1、5、11、26、28、40、53、63、66、70、79、87 和 88 对所有病原体都具有抗性。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
查看原文
分享 分享
微信好友 朋友圈 QQ好友 复制链接
本刊更多论文
Seçilmiş Domatesler Arasında Genetik İlişkiler ve Bazı Patojenlere Karşı Dayanım Düzeylerinin Belirlenmesi
Amaç: Günümüzde, çevre dostu üretim tekniklerinin geliştirilmesi, verim ve kalitenin arttırılması ve yetiştiricilerin daha az maaliyetle üretim yapabilmeleri için hastalık ve zararlılara karşı direnç genlerini içeren hibrit çeşitler geliştirmek zorunluluk haline gelmiştir. Çalışma kapsamında agromorfolojik özellikleri bakımından ebeveyn olmaya uygun bir domates genotip koleksiyonu içinde genetik benzerlik ilişkilerinin ortaya konması ve bu genotiplerin Meloidogyne incognita, Tomato Mosaic Virus, Verticillium wilt, Tomato Spotted Wilt Virus, Tomato Yellow Leaf CurlingVirus Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici patojenlerine karşı dayanıklılık seviyelerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Materyal ve Yöntem: Çalışmada, genotipler arası akrabalık ilişkilerin belirlenmesi ve adı geçen patojenlere karşı dayanımlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmanın arazi aşaması Antalya'da bulunan SELKO şirketine ait olan AR-Ge serasında, moleküler çalışmalar ise Necmettin Erbakan Üniversitesi Fen Fakültesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Laboratuvarında yürütülmüştür. Araştırma Bulguları: Çalışmamızda 92 adet domates genotipinde toplam 137 adet SSR alleli elde edilmiştir. Çalışmada kullanılan SSR markörlerinin ortalama PIC değeri 0.49’dur. En yüksek PIC değeri olan markörün 0.496 değeri ile LE15 olduğu belirlenmiştir. Domates genotipleri arasındaki genetik çeşitlilik unweighted Neigbor-joining (NJ) yöntemi kullanılarak belirlenmiş ve dendrogramı oluşturulmuştur. Genetik çeşitlilik analizi sonucu çalışmaya dahil genotiplerin altı gruba ayrıldığı belirlenmiştir. Genotiplerin gruplara sayıca dağılımı A grubunda 14, B grubunda 13, C grubunda 17, D grubunda 17, E grubunda 13, F grubunda ise 17 genotip şeklinde gerçekleşmiştir. Uzaklık matrisi ve oluşturulan dendrogramı arasında, yüksek düzeyde korelasyon görülmektedir (r = 0.91). Ortalama benzemezlik değeri, 0,38 olarak belirlenmiştir. Sonuç: ESTSSR allel verileri ile gerçekleştirilen çeşitlilik analizi sonucunda oluşturulan NJ dendrogramı, genotiplerinin dört ana küme oluşturduğu ve genotiplerin altı grupta toplandığı belirlenmiştir. Ortalama benzemezlik değeri 0,38 olarak belirlenmiştir. Domates tarımında verimliliği olumsuz yönde etkileyen birçok abiyotik stres faktörü mevcuttur. Verimlilik için hastalık ve zararlılara karşı dayanıklılık alellerinesahip genotiplerin varlığı oldukça önemlidir. Çalışma sonucunda Meloidogyne incognita, Tomato Mosaic Virus, Verticillium wilt, Tomato Spotted Wilt Virus, Tomato Yellow Leaf Curling Virus, Fusarium oxysporum f. sp. patojenlerin tümüne birden 1,5,11, 26, 28, 40,53, 63, 66, 70, 79, 87 ve 88 nolu genotipler dayanıklı bulunmuştur.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
期刊最新文献
Goji Berry Yapraklarının Yonca Silajlarının Kimyasal Kompozisyon, Bazı Fermentasyon Özellikleri ve Nispi Yem Değeri Üzerine Etkisi Genetic, Yield and Quality Variations of Samsun Tobacco Are Still Continuing In Production Areas Seçilmiş Domatesler Arasında Genetik İlişkiler ve Bazı Patojenlere Karşı Dayanım Düzeylerinin Belirlenmesi Trabzon İli Şalpazarı İlçesinde Yetişen Çobanüzümü’nün (Vaccinium myrtillus L.) Pomolojik ve Morfolojik Özellikleri İzmir’den Alınan Hıyar mozaik virüsü (CMV) İzolatlarının Biyolojik ve Moleküler Tespiti
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
已复制链接
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
×
扫码分享
扫码分享
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1