用两种交叉验证方法预测牛的基因组活重

IF 0.3 Q4 AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY Ecosistemas y Recursos Agropecuarios Pub Date : 2024-02-19 DOI:10.19136/era.a11n1.3817
Francisco Joel Jahuey-Martínez, J. Magaña-Monforte, J. C. Segura-Correa, J. C. Martínez-González, R. J. Estrada-León, G. M. Parra-Bracamonte
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摘要

使用两种交叉验证方法估算了夏洛莱牛活重变量基因组估计值(GEBV)的预测准确性(PE)。采用 BLUP 模型和不同的基因组预测方法(GP):基于基因组的最佳线性无偏预测(GBLUP)、贝叶斯 C(BC)和单步贝叶斯回归(SSBR)。使用随机形成的验证组(VGs)和 GC 对 PD 进行了比较。结果表明,三种 PG 方法在 VG 中提供了相似的预测准确率,但预测准确率并不优于 BLUP。GBLUP 和 BLUP 对 PN 的预测准确率分别为 0.35 和 0.37,对 PD 的预测准确率分别为 0.30 和 0.41。结果表明,在所评估的情况下,PG 的预测准确率较低;因此,为了正确实施 PG,有必要增加动物数量并使用去回归遗传值作为响应变量。
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Predicción genómica de peso vivo con dos métodos de validación cruzada en ganado bovino
Se estimó la exactitud de la predicción (EP) de valores genómicos estimados (GEBV) para variables de peso vivo de ganado Charolais utilizando dos métodos de validación cruzada. Se ajustó un modelo BLUP y diferentes métodos de predicción genómica (PG) Genomic-based best linear unbiased prediction (GBLUP), Bayes C (BC) y Single-step Bayesian regression (SSBR). La EP fue comparada mediante grupos de validación (GV) formados aleatoriamente y mediante GC. Los resultados mostraron que los tres métodos de PG proporcionaron exactitudes de predicción similares entre los GV pero no exactitudes de predicción superiores a BLUP. La exactitud de predicción de GBLUP y BLUP fue 0.35 y 0.37 para PN, y de 0.30 y 0.41 para PD, respectivamente. Los resultados muestran bajas exactitudes de PG bajo los escenarios evaluados; por lo que para su correcta implementación es necesario incrementar el número de animales y usar valorees genéticos desregresados como variables de respuesta.
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