表型和基因型表征临床分离的鹤草杆菌的抗菌药耐药性

IF 3 4区 医学 Q2 INFECTIOUS DISEASES Brazilian Journal of Infectious Diseases Pub Date : 2024-11-01 DOI:10.1016/j.bjid.2024.104404
José Carlos Caldeira, Louisy Sanches dos Santos, Ana Luíza de Mattos-Guaraldi, Lincoln de Oliveira Sant'Anna, Mariana da Cruz Mota, Julianna Giordano Botelho Olivella, Paula Marcele Afonso Pereira-Ribeiro
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Contudo, um estudo recente reportou o isolamento desta espécie em amostras de urina de pacientes do sexo feminino com doença renal e de cisto sebáceo em paciente do sexo masculino. Uma vez que neste estudo não houve a investigação da susceptibilidade aos antimicrobianos, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar fenotipicamente e geneticamente a resistência antimicrobiana (RAM) nestas cepas.</div></div><div><h3>Materiais e métodos</h3><div>Cepas de C. hesseae isoladas de urina (n = 4) e de cisto sebáceo (n = 1) tiveram seus perfis de susceptibilidade determinados de acordo com o Brazilian Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing- BrCAST (2024). Em seguida, os genomas das cepas em estudo, recuperados do banco de dados do NCBI (National Center for Biotechnology Information), foram analisados com auxílio da ferramenta ResFinder. Por fim, mutações associadas à RAM foram investigadas usando o ClustalW.</div></div><div><h3>Resultados</h3><div>Todas as cepas foram sensíveis à vancomicina, tetraciclina, rifampicina, linezolida e moxifloxacino. Algumas foram resistentes ao ciprofloxaxino (n = 2) e à penicilina (n = 1), enquanto a maioria foi resistente à clindamicina (n = 4). Nenhum gene relacionado à resistência a β-lactâmicos foi encontrado. O gene ermX, relacionado à resistência a macrolídeos, lincosamidas e estreptogramina B, foi detectado em 3 das cepas resistentes à clindamicina. Uma mutação no gene da girase A foi encontrada em uma das cepas resistentes ao ciprofloxacino. Conclusões: O isolamento de cepas de C. hesseae resistentes a antimicrobianos em amostras clínicas reforça a importância de se determinar os perfis de susceptibilidade dos isolados clínicos desta espécie, particularmente quando oriundas de pacientes imunocomprometidos, nos quais a infecção precisa ser considerada. Novos estudos buscando confirmar o potencial patogênico desta espécie e compreender a aquisição da RAM pelos isolados, são necessários para planejar condutas terapêuticas mais eficazes.</div></div><div><h3>Palavras-chave</h3><div>Corynebacterium, Infecções Oportunistas, Resistência a Fármacos Antimicrobianos.</div></div><div><h3>Conflitos de interesse</h3><div>Não houve conflito de interesse.</div></div><div><h3>Ética e financiamentos: Declarações de interesse</h3><div>Nenhum.</div></div>","PeriodicalId":56327,"journal":{"name":"Brazilian Journal of Infectious Diseases","volume":"28 ","pages":"Article 104404"},"PeriodicalIF":3.0000,"publicationDate":"2024-11-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"CARACTERIZAÇÃO FENOTÍPICA E GENOTÍPICA DA RESISTÊNCIA ANTIMICROBIANA EM ISOLADOS CLÍNICOS DE CORYNEBACTERIUM HESSEAE\",\"authors\":\"José Carlos Caldeira,&nbsp;Louisy Sanches dos Santos,&nbsp;Ana Luíza de Mattos-Guaraldi,&nbsp;Lincoln de Oliveira Sant'Anna,&nbsp;Mariana da Cruz Mota,&nbsp;Julianna Giordano Botelho Olivella,&nbsp;Paula Marcele Afonso Pereira-Ribeiro\",\"doi\":\"10.1016/j.bjid.2024.104404\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"<div><h3>Introdução/objetivos</h3><div>O gênero Corynebacterium compreende, até o momento, 165 espécies de bacilos Gram-positivos irregulares. 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Uma vez que neste estudo não houve a investigação da susceptibilidade aos antimicrobianos, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar fenotipicamente e geneticamente a resistência antimicrobiana (RAM) nestas cepas.</div></div><div><h3>Materiais e métodos</h3><div>Cepas de C. hesseae isoladas de urina (n = 4) e de cisto sebáceo (n = 1) tiveram seus perfis de susceptibilidade determinados de acordo com o Brazilian Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing- BrCAST (2024). Em seguida, os genomas das cepas em estudo, recuperados do banco de dados do NCBI (National Center for Biotechnology Information), foram analisados com auxílio da ferramenta ResFinder. Por fim, mutações associadas à RAM foram investigadas usando o ClustalW.</div></div><div><h3>Resultados</h3><div>Todas as cepas foram sensíveis à vancomicina, tetraciclina, rifampicina, linezolida e moxifloxacino. Algumas foram resistentes ao ciprofloxaxino (n = 2) e à penicilina (n = 1), enquanto a maioria foi resistente à clindamicina (n = 4). Nenhum gene relacionado à resistência a β-lactâmicos foi encontrado. O gene ermX, relacionado à resistência a macrolídeos, lincosamidas e estreptogramina B, foi detectado em 3 das cepas resistentes à clindamicina. Uma mutação no gene da girase A foi encontrada em uma das cepas resistentes ao ciprofloxacino. Conclusões: O isolamento de cepas de C. hesseae resistentes a antimicrobianos em amostras clínicas reforça a importância de se determinar os perfis de susceptibilidade dos isolados clínicos desta espécie, particularmente quando oriundas de pacientes imunocomprometidos, nos quais a infecção precisa ser considerada. Novos estudos buscando confirmar o potencial patogênico desta espécie e compreender a aquisição da RAM pelos isolados, são necessários para planejar condutas terapêuticas mais eficazes.</div></div><div><h3>Palavras-chave</h3><div>Corynebacterium, Infecções Oportunistas, Resistência a Fármacos Antimicrobianos.</div></div><div><h3>Conflitos de interesse</h3><div>Não houve conflito de interesse.</div></div><div><h3>Ética e financiamentos: Declarações de interesse</h3><div>Nenhum.</div></div>\",\"PeriodicalId\":56327,\"journal\":{\"name\":\"Brazilian Journal of Infectious Diseases\",\"volume\":\"28 \",\"pages\":\"Article 104404\"},\"PeriodicalIF\":3.0000,\"publicationDate\":\"2024-11-01\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Brazilian Journal of Infectious Diseases\",\"FirstCategoryId\":\"3\",\"ListUrlMain\":\"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1413867024006871\",\"RegionNum\":4,\"RegionCategory\":\"医学\",\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"Q2\",\"JCRName\":\"INFECTIOUS DISEASES\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Brazilian Journal of Infectious Diseases","FirstCategoryId":"3","ListUrlMain":"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1413867024006871","RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q2","JCRName":"INFECTIOUS DISEASES","Score":null,"Total":0}
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摘要

引言/目的迄今为止,棒状杆菌属由 165 种不规则革兰氏阳性杆菌组成。除了分布在环境中的菌种外,该属还包藏着典型的病原体,如白喉的主要病原体白喉棒状杆菌(Corynebacterium diphtheriae)。它还滋生最终会导致感染的共生菌种,尤其是在长期住院或免疫力低下的人身上。最近,健康女性的泌尿微生物组中发现了一种名为 Corynebacterium hesseae 的细菌。不过,最近的一项研究报告称,在患有肾病的女性患者的尿液样本中和一名男性患者的皮脂腺囊肿中分离出了这一菌种。材料与方法根据巴西抗菌药敏感性检测委员会(BrCAST)(2024 年)的规定,对从尿液(4 株)和皮脂腺囊肿(1 株)中分离出的 C. hesseae 菌株进行了敏感性鉴定。接着,使用 ResFinder 工具分析了从 NCBI(美国国家生物技术信息中心)数据库获取的研究菌株基因组。结果所有菌株都对万古霉素、四环素、利福平、利奈唑胺和莫西沙星敏感。一些菌株对环丙沙星(2 株)和青霉素(1 株)耐药,而大多数菌株对克林霉素(4 株)耐药。没有发现与抗β-内酰胺类药物有关的基因。在 3 株对克林霉素耐药的菌株中检测到了与对大环内酯类、林可霉素类和链霉素 B 耐药有关的 ermX 基因。在一株对环丙沙星耐药的菌株中发现了回旋酶 A 基因突变。结论:在临床样本中分离出对抗菌素耐药的鹤虱菌株,进一步说明了确定该菌种临床分离株的药敏谱的重要性,特别是当这些分离株来自免疫力低下的患者时,需要考虑这些患者的感染情况。为了规划更有效的治疗方法,有必要开展进一步研究,以确认该菌种的致病潜力,并了解分离株获得 AMR 的情况:无利益冲突。
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CARACTERIZAÇÃO FENOTÍPICA E GENOTÍPICA DA RESISTÊNCIA ANTIMICROBIANA EM ISOLADOS CLÍNICOS DE CORYNEBACTERIUM HESSEAE

Introdução/objetivos

O gênero Corynebacterium compreende, até o momento, 165 espécies de bacilos Gram-positivos irregulares. Além de espécies distribuídas no ambiente, este gênero abriga patógenos clássicos, como Corynebacterium diphtheriae, o principal agente etiológico da difteria. Abriga também espécies comensais que eventualmente causam infecções, sobretudo em indivíduos com longos períodos de hospitalização ou imunocomprometidos. Recentemente, Corynebacterium hesseae foi descrita como parte do microbioma urinário de mulheres saudáveis. Contudo, um estudo recente reportou o isolamento desta espécie em amostras de urina de pacientes do sexo feminino com doença renal e de cisto sebáceo em paciente do sexo masculino. Uma vez que neste estudo não houve a investigação da susceptibilidade aos antimicrobianos, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar fenotipicamente e geneticamente a resistência antimicrobiana (RAM) nestas cepas.

Materiais e métodos

Cepas de C. hesseae isoladas de urina (n = 4) e de cisto sebáceo (n = 1) tiveram seus perfis de susceptibilidade determinados de acordo com o Brazilian Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing- BrCAST (2024). Em seguida, os genomas das cepas em estudo, recuperados do banco de dados do NCBI (National Center for Biotechnology Information), foram analisados com auxílio da ferramenta ResFinder. Por fim, mutações associadas à RAM foram investigadas usando o ClustalW.

Resultados

Todas as cepas foram sensíveis à vancomicina, tetraciclina, rifampicina, linezolida e moxifloxacino. Algumas foram resistentes ao ciprofloxaxino (n = 2) e à penicilina (n = 1), enquanto a maioria foi resistente à clindamicina (n = 4). Nenhum gene relacionado à resistência a β-lactâmicos foi encontrado. O gene ermX, relacionado à resistência a macrolídeos, lincosamidas e estreptogramina B, foi detectado em 3 das cepas resistentes à clindamicina. Uma mutação no gene da girase A foi encontrada em uma das cepas resistentes ao ciprofloxacino. Conclusões: O isolamento de cepas de C. hesseae resistentes a antimicrobianos em amostras clínicas reforça a importância de se determinar os perfis de susceptibilidade dos isolados clínicos desta espécie, particularmente quando oriundas de pacientes imunocomprometidos, nos quais a infecção precisa ser considerada. Novos estudos buscando confirmar o potencial patogênico desta espécie e compreender a aquisição da RAM pelos isolados, são necessários para planejar condutas terapêuticas mais eficazes.

Palavras-chave

Corynebacterium, Infecções Oportunistas, Resistência a Fármacos Antimicrobianos.

Conflitos de interesse

Não houve conflito de interesse.

Ética e financiamentos: Declarações de interesse

Nenhum.
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期刊介绍: The Brazilian Journal of Infectious Diseases is the official publication of the Brazilian Society of Infectious Diseases (SBI). It aims to publish relevant articles in the broadest sense on all aspects of microbiology, infectious diseases and immune response to infectious agents. The BJID is a bimonthly publication and one of the most influential journals in its field in Brazil and Latin America with a high impact factor, since its inception it has garnered a growing share of the publishing market.
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Distribution of group B streptococci serotypes on women nasopharynx. High prevalence of 19A pneumococcal serotype carriage during the COVID-19 pandemic in Brazil. Survival after liver transplantation from hepatitis B-core positive donors at a quaternary care hospital in Brazil Perceived levels of social stigma following HIV notification: Insights from Brazilian blood centers Vaccination with outer membrane vesicles from Neisseria Meningitidis and SBa15, SBa16 mesoporous silica associated with SARS-CoV-2 induces protective humoral and cellular response against COVID-19 in mice
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