И. С. Степанов, Елена Игоревна Васильева, Анна Соколенко, Евгений Имянитов
{"title":"在对俄罗斯乳腺癌患者的广泛研究中,TP53基因的遗传突变频率和光谱","authors":"И. С. Степанов, Елена Игоревна Васильева, Анна Соколенко, Евгений Имянитов","doi":"10.37469/0507-3758-2022-68-5-589-597","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Введение. Наиболее распространенной опухолевой локализацией при TP53-ассоциированном опухолевом синдроме (heritable TP53-related cancer syndrome ― hTP53rc), который ранее назывался «синдром Ли-Фраумени» ― является рак молочной железы (РМЖ). Синдром характеризуется возникновением наследственной мутации в гене TP53. В настоящем исследовании демонстрируется относительно высокая встречаемость hTP53rc в структуре наследственных опухолей молочной железы, а также представлен корректный алгоритм диагностики TP53-ассоциированных РМЖ в российской популяции.\nЦель исследования. Изучение частоты и спектра наследственных мутаций в гене TP53 у пациенток с РМЖ.\nМатериалы и методы. Проведено исследование 1726 образцов от пациенток с РМЖ при помощи секвенирования нового поколения (next generation sequencing ― NGS) для обнаружения наследственных мутаций в генах TP53, BRCA1/2. Особенностью этого исследования служила возможность использования «обогащенной» выборки ― из нее были исключены все образцы от пациенток с любыми мутациями в генах BRCA1/2 при помощи особого алгоритма. В генах CHEK2, NBS1, BLM были дополнительно исследованы методом ПЦР наиболее часто встречающиеся в популяции мутации: CHEK2 del5395 (del ex9-10), CHEK2 c.444+1G>A [IVS2+1G>A], CHEK2 1100delC, NBS1 657del5, BLM p.Q548X [c.1642C>T] в образцах от 1322 пациенток из 1726. Такая методика была применена для возможности обнаружения носительства двойных мутаций и могла бы позволить оценить особенности клинических проявлений таких ситуаций в случае их обнаружения. Применение алгоритма на основе секвенирования нового поколения с исследованием нескольких генов позволило исключить образцы с мутациями и сформировать итоговую выборку, по которой оценивалась встречаемость hTP53rc.\nРезультаты. Частота hTP53rc в сформированной выборке составила 10/1494, т е. 0,67%.\nЗаключение. Распространенность hTP53rc в российской популяции, очевидно, оценена недостаточно. Вклад hTP53rc в структуру наследственных РМЖ целесообразно учитывать.","PeriodicalId":20495,"journal":{"name":"Problems in oncology","volume":"18 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-10-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Частота и спектр наследственных мутаций в гене TP53 в обширном исследовании российских пациенток с раком молочной железы\",\"authors\":\"И. С. Степанов, Елена Игоревна Васильева, Анна Соколенко, Евгений Имянитов\",\"doi\":\"10.37469/0507-3758-2022-68-5-589-597\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Введение. Наиболее распространенной опухолевой локализацией при TP53-ассоциированном опухолевом синдроме (heritable TP53-related cancer syndrome ― hTP53rc), который ранее назывался «синдром Ли-Фраумени» ― является рак молочной железы (РМЖ). Синдром характеризуется возникновением наследственной мутации в гене TP53. В настоящем исследовании демонстрируется относительно высокая встречаемость hTP53rc в структуре наследственных опухолей молочной железы, а также представлен корректный алгоритм диагностики TP53-ассоциированных РМЖ в российской популяции.\\nЦель исследования. Изучение частоты и спектра наследственных мутаций в гене TP53 у пациенток с РМЖ.\\nМатериалы и методы. Проведено исследование 1726 образцов от пациенток с РМЖ при помощи секвенирования нового поколения (next generation sequencing ― NGS) для обнаружения наследственных мутаций в генах TP53, BRCA1/2. Особенностью этого исследования служила возможность использования «обогащенной» выборки ― из нее были исключены все образцы от пациенток с любыми мутациями в генах BRCA1/2 при помощи особого алгоритма. В генах CHEK2, NBS1, BLM были дополнительно исследованы методом ПЦР наиболее часто встречающиеся в популяции мутации: CHEK2 del5395 (del ex9-10), CHEK2 c.444+1G>A [IVS2+1G>A], CHEK2 1100delC, NBS1 657del5, BLM p.Q548X [c.1642C>T] в образцах от 1322 пациенток из 1726. Такая методика была применена для возможности обнаружения носительства двойных мутаций и могла бы позволить оценить особенности клинических проявлений таких ситуаций в случае их обнаружения. Применение алгоритма на основе секвенирования нового поколения с исследованием нескольких генов позволило исключить образцы с мутациями и сформировать итоговую выборку, по которой оценивалась встречаемость hTP53rc.\\nРезультаты. Частота hTP53rc в сформированной выборке составила 10/1494, т е. 0,67%.\\nЗаключение. Распространенность hTP53rc в российской популяции, очевидно, оценена недостаточно. Вклад hTP53rc в структуру наследственных РМЖ целесообразно учитывать.\",\"PeriodicalId\":20495,\"journal\":{\"name\":\"Problems in oncology\",\"volume\":\"18 1\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2022-10-27\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Problems in oncology\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.37469/0507-3758-2022-68-5-589-597\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Problems in oncology","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.37469/0507-3758-2022-68-5-589-597","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
Частота и спектр наследственных мутаций в гене TP53 в обширном исследовании российских пациенток с раком молочной железы
Введение. Наиболее распространенной опухолевой локализацией при TP53-ассоциированном опухолевом синдроме (heritable TP53-related cancer syndrome ― hTP53rc), который ранее назывался «синдром Ли-Фраумени» ― является рак молочной железы (РМЖ). Синдром характеризуется возникновением наследственной мутации в гене TP53. В настоящем исследовании демонстрируется относительно высокая встречаемость hTP53rc в структуре наследственных опухолей молочной железы, а также представлен корректный алгоритм диагностики TP53-ассоциированных РМЖ в российской популяции.
Цель исследования. Изучение частоты и спектра наследственных мутаций в гене TP53 у пациенток с РМЖ.
Материалы и методы. Проведено исследование 1726 образцов от пациенток с РМЖ при помощи секвенирования нового поколения (next generation sequencing ― NGS) для обнаружения наследственных мутаций в генах TP53, BRCA1/2. Особенностью этого исследования служила возможность использования «обогащенной» выборки ― из нее были исключены все образцы от пациенток с любыми мутациями в генах BRCA1/2 при помощи особого алгоритма. В генах CHEK2, NBS1, BLM были дополнительно исследованы методом ПЦР наиболее часто встречающиеся в популяции мутации: CHEK2 del5395 (del ex9-10), CHEK2 c.444+1G>A [IVS2+1G>A], CHEK2 1100delC, NBS1 657del5, BLM p.Q548X [c.1642C>T] в образцах от 1322 пациенток из 1726. Такая методика была применена для возможности обнаружения носительства двойных мутаций и могла бы позволить оценить особенности клинических проявлений таких ситуаций в случае их обнаружения. Применение алгоритма на основе секвенирования нового поколения с исследованием нескольких генов позволило исключить образцы с мутациями и сформировать итоговую выборку, по которой оценивалась встречаемость hTP53rc.
Результаты. Частота hTP53rc в сформированной выборке составила 10/1494, т е. 0,67%.
Заключение. Распространенность hTP53rc в российской популяции, очевидно, оценена недостаточно. Вклад hTP53rc в структуру наследственных РМЖ целесообразно учитывать.