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​Nat Commun丨刘琦、张军、黄行许联合开发领域内首个基因编辑AI大模型，赋能新型基因编辑系统的de-novo识别

BioArt 2024-11-23 00:00
文章摘要
刘琦、张军、黄行许教授团队联合开发了领域内首个用于识别具备自加工功能的Cas12蛋白的AI大模型CHOOSER。该模型基于蛋白质语言模型，能够挖掘及预测pre-crRNA自加工功能的Cas酶。通过CHOOSER，研究人员发现了11种新的Casλ同源蛋白，并验证了其中一种EphcCasλ蛋白的pre-crRNA处理活性和DNase活性，显示出其在基因编辑和CRISPR病原体检测中的潜力。CHOOSER的成功应用展示了在缺乏真实结构信息的情况下，蛋白质LLM生成的表征可用于识别和筛选具有特定功能的CRISPR-Cas系统，为基因编辑工具的de-novo识别提供了新的策略。
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查看文献： Discovering CRISPR-Cas system with self-processing pre-crRNA capability by foundation models
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