首页 > 生命科学

Nature | 利用机器学习设计细胞特异性基因调控元件

BioArt 2024-11-30 09:00
文章摘要
本文介绍了MIT和Harvard的研究团队利用机器学习算法设计出具有高度细胞类型特异性的合成顺式调控元件（CREs）。研究通过构建深度学习模型Malinois，基于高通量平行报告基因测定数据，预测不同细胞类型中CRE序列的活性。随后，开发了CODA设计平台，通过优化算法生成数千个合成CRE序列，这些序列在细胞特异性上优于天然序列。体内实验验证了合成CRE在斑马鱼和小鼠模型中的目标细胞类型特异性表达。研究结果表明，深度学习驱动的CODA平台能够高效生成合成CREs，展现出优于天然CRE的细胞类型特异性，具有重要的基因治疗应用前景。
Nature | 利用机器学习设计细胞特异性基因调控元件
查看文献： Machine-guided design of cell-type-targeting cis-regulatory elements
查看期刊：Nature
阅读全文
本站注明稿件来源为其他媒体的文/图等稿件均为转载稿，本站转载出于非商业性的教育和科研之目的，并不意味着赞同其观点或证实其内容的真实性。如转载稿涉及版权等问题，请作者速来电或来函联系。
推荐文献
Science Bulletin Science Bulletin
How many trees are there in China?
DOI: 10.1016/j.scib.2025.02.001 Pub Date : 2025-04-15
IF 18.8 1区 综合性期刊 Q1
Science Bulletin
iScience iScience
Workshop report: Everyday environmental heritage is key to unlocking the social dimensions of One Health
DOI: 10.1016/j.isci.2025.112358 Pub Date : 2025-04-18
IF 4.6 2区 综合性期刊 Q1
iScience
Nature Nature
How India rewrote the rules of space travel when it launched its first satellite
DOI: 10.1038/d41586-025-01235-4 Pub Date : 2025-04-21
IF 64.8 1区 综合性期刊 Q1
Nature
最新文章
文献分享|Angew. Chem. Int. Ed.：构象锁定的肽-DNA纳米结构，用于基于CRISPR扩增活性的传感
文献分享|Angew. Chem. Int. Ed.：构象锁定的肽-DNA纳米结构，用于基于CRISPR扩增活性的传感
【引言】荧光探针（如分子信标）在生物分子检测中具有重要作用，其通过发夹状DNA结构分离荧光基团和淬灭基团的机制，显著推动了诊断技术的发展，广泛应用于癌症诊断、传染病监测和个性化医疗。并且，通过在发夹结
14小时前
Anesthesiology：遵义医科大学麻醉团队揭示介导七氟烷麻醉的新机制
Anesthesiology：遵义医科大学麻醉团队揭示介导七氟烷麻醉的新机制
1 （增补印刷）神经科学实用图书推荐——《鼠脑应用解剖学》【科学出版社】2 科研工具书《精神疾病啮齿类动物模型及行为学实验》 崔东红/徐林著 3 重磅新书推荐 |《奈特神经病学》（第3版）近日，遵义医
15小时前
【选品参考】细胞骨架染色试剂盒
【选品参考】细胞骨架染色试剂盒
细胞骨架作为维持细胞形态并调控细胞运动、分裂及信号转导的核心结构，其动态研究对揭示细胞生理与病理机制至关重要。EFL罗丹明标记鬼笔环肽（细胞骨架染色试剂盒）为TRITC（四甲基异硫氰酸罗丹明）标记的鬼
16小时前
Mol Syst Biol | 李晋/陈兴栋发现胃肠腺癌特异的超级增强子
Mol Syst Biol | 李晋/陈兴栋发现胃肠腺癌特异的超级增强子
癌基因的过度表达是癌症发生的主要原因之一，而人类基因组中非编码区域的变异，可以通过提高癌基因的转录水平，调控癌症的发生发展。胃肠腺癌是消化系统的一种主要癌症类型，也是全球范围内癌症相关死亡的首要原因。
16小时前
BioArt
Mol Cell | 新生RNA的快速折叠调控真核生物RNA的生物合成
Mol Cell | 新生RNA的快速折叠调控真核生物RNA的生物合成 16小时前
“中国细胞生物学学会2025年全国学术大会•珠海”分会场回顾之二
“中国细胞生物学学会2025年全国学术大会•珠海”分会场回顾之二 16小时前
Nat Commun丨邓蓉/朱孝峰/唐军合作鉴定B7H3蛋白发挥肿瘤免疫抑制功能的关键N-糖基化修饰位点并研制其靶向内化抗体
Nat Commun丨邓蓉/朱孝峰/唐军合作鉴定B7H3蛋白发挥肿瘤免疫抑制功能的关键N-糖基化修饰位点并研制其靶向内化抗体 16小时前
Sci Adv丨金俊等揭示老年人疫苗效力减弱的细胞分子机制
Sci Adv丨金俊等揭示老年人疫苗效力减弱的细胞分子机制 16小时前
Nature丨免疫系统的“精准进化”：B细胞如何在克隆爆发中维持抗体质量
Nature丨免疫系统的“精准进化”：B细胞如何在克隆爆发中维持抗体质量 16小时前
热门类别
综合性期刊 物理 法学 地球科学 历史学
相关文章
华东师范大学 Nat. Commun. ：首次完整揭示GeSe非常规面外（反）铁电机制 打破传统理论！院士合作，成就一篇Nature Chemistry！ 习近平文化思想引领文化传承发展的深刻内涵、时代价值与实践路径 屈超立：明清督抚制度的特点与作用 文献速递 | RNA表达增强调控技术的研究进展与机制解析
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号：481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们：info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务，方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1