卡内基梅隆大学提出SurfPro模型,通过表面特征进行蛋白质设计
智药邦
2024-07-01 09:00
文章摘要
卡内基梅隆大学的研究团队提出了一种名为SurfPro的新型蛋白质设计方法,该方法通过蛋白质的连续表面特征来设计具有特定生化特性和功能的蛋白质序列。SurfPro模型包括一个分层编码器和一个自回归解码器,能够逐步模拟蛋白质表面的几何形状和生化特征,并生成相应的氨基酸序列。实验结果显示,SurfPro在蛋白质设计方面表现卓越,有效验证了通过表面特征进行蛋白质设计的可行性。此外,该研究还强调了疏水性和电荷特征在蛋白质设计中的重要性,并展示了SurfPro在生成具有高蛋白质-蛋白质结合亲和力的功能结合物方面的潜力。
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