APORTES Y DIFICULTADES DE LA METAGENÓMICA DE SUELOS Y SU IMPACTO EN LA AGRICULTURA.

IF 0.5 4区 生物学 Q4 PLANT SCIENCES Acta Biologica Colombiana Pub Date : 2021-05-28 DOI:10.15446/abc.v26n3.85760
América Paulina Rivera-Urbalejo, Daniel Vázquez, José Luis Fernández Vázquez, María Rosete Enríquez, Catherine Cesa-Luna, Y. E. Morales-García, Jesús Muñoz Rojas, Veronica Quintero Hernández
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Abstract

Los microorganismos son de gran interés porque colonizan todo tipo de ambiente, sin embargo, uno de los problemas al que nos enfrentamos para conocer su diversidad biológica es que no todos los microorganismos son cultivables. El desarrollo de nuevas tecnologías como la generación de vectores de clonación aunado al desarrollo de técnicas de secuenciación de alto rendimiento ha favorecido el surgimiento de una nueva herramienta llamada metagenómica, la cual nos permite estudiar genomas de comunidades enteras de microorganismos. Debido a que ningún ambiente es idéntico a otro, es importante mencionar que dependiendo del tipo de muestra a analizar será el tipo de reto al cual nos enfrentaremos al trabajar con metagenómica, en el caso específico del suelo existen diversas variantes como la contaminación del suelo con metales pesados o diversos compuestos químicos que podrían limitar los estudios. Sin embargo, pese a las limitaciones que el mismo ambiente presenta, la metagenómica ha permitido tanto el descubrimiento de nuevos genes como la caracterización de las comunidades microbianas que influyen positivamente en el desarrollo de plantas, lo cual en un futuro podría generar un gran impacto en la agricultura. En este artículo se realizó una revisión de diversas investigaciones que han empleado metagenómica, reportadas en las bases de datos de PudMed y Google Schoolar, con el objetivo de examinar los beneficios y limitaciones de las diversas metodologías empleadas en el tratamiento del ADN metagenómico de suelo y el impacto de la metagenómica en la agricultura.
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微生物非常有趣,因为它们在各种环境中定居,然而,我们在了解其生物多样性方面面临的问题之一是,并非所有微生物都是可培养的。新技术的发展,如克隆载体的产生,加上高效测序技术的发展,促进了一种名为元基因组学的新工具的出现,这使我们能够研究整个微生物群落的基因组。由于没有一种环境与另一种环境相同,重要的是要指出,根据要分析的样本类型,这将是我们在进行元基因组学工作时面临的挑战类型,在土壤的具体情况下,存在各种变体,如重金属污染土壤或各种可能限制研究的化合物。然而,尽管同一环境存在限制,但元基因组学使发现新基因和表征对植物发育产生积极影响的微生物群落成为可能,这在未来可能对农业产生重大影响。本文回顾了Pudmed和Google Scholar数据库中报告的各种使用元基因组学的研究,目的是审查用于处理土壤元基因组DNA的各种方法的益处和局限性以及元基因组学对农业的影响。
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来源期刊
Acta Biologica Colombiana
Acta Biologica Colombiana Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences
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审稿时长
13 weeks
期刊介绍: The journal is published quarterly and divulges original and unpublished results of basic and applied research about biological subjects with special interest in Neotropical region. Manuscripts may be research articles, reviews, reflection articles or short notes. The Acta biol. Colomb Journal have a scientific and editorial board composed of expert researchers of in their areas of knowledge.
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