Primer reporte de begomovirus infectando cultivos de ají (Capsicum spp.) en Colombia

IF 0.5 4区 生物学 Q4 PLANT SCIENCES Acta Biologica Colombiana Pub Date : 2019-09-01 DOI:10.15446/ABC.V24N3.79367
Juan Carlos Vaca-Vaca, J. Morales-Euse, Diana Marcela Rivera-Toro, K. López-López
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Abstract

Virus del género Begomovirus infectan cultivos de importancia económica en todo el mundo, incluyendo ají. A la fecha, en Colombia no hay reportes de la presencia de begomovirus infectando este cultivo, por lo que el objetivo de esta investigación fue identificar la presencia de virus de este género en ají empleando estrategias moleculares. Se colectaron 197 muestras de ají en diez municipios del Valle del Cauca. Se extrajo el DNA genómico total vegetal y mediante PCR se detectó la presencia de begomovirus. Para establecer la identidad molecular del virus se amplificaron fragmentos de 1,4 kb de muestras colectadas en Palmira y Vijes. Los fragmentos fueron clonados, secuenciados y analizados. Se encontró que el 85,7 % de las muestras de ají evaluadas fueron positivas para begomovirus. Los análisis de secuencia de los fragmentos virales de 1,4 kb arrojaron una identidad de 91,8 % entre ellos y los de secuencia de nucleótidos de los virus aislados en Vijes y Palmira mostró que éstos presentan los valores de identidad más altos (87,2 % y 86,6 %) con el virus de la distorsión de la hoja de maracuyá, un begomovirus aislado de maracuyá en Colombia. Estos análisis estarían indicando que este begomovirus aislado de ají podría ser una nueva especie. De acuerdo con la literatura, este es el primer reporte de un begomovirus infectando cultivos de ají en Colombia.Virus del género Begomovirus infectan cultivos de importancia económica en todo el mundo, incluyendo ají. A la fecha, en Colombia no hay reportes de la presencia de begomovirus infectando este cultivo, por lo que el objetivo de esta investigación fue identificar la presencia de virus de este género en ají empleando estrategias moleculares. Se colectaron 197 muestras de ají en diez municipios del Valle del Cauca. Se extrajo el DNA genómico total vegetal y mediante PCR se detectó la presencia de begomovirus. Para establecer la identidad molecular del virus se amplificaron fragmentos de 1,4 kb de muestras colectadas en Palmira y Vijes. Los fragmentos fueron clonados, secuenciados y analizados. Se encontró que el 85,7 % de las muestras de ají evaluadas fueron positivas para begomovirus. Los análisis de secuencia de los fragmentos virales de 1,4 kb arrojaron una identidad de 91,8 % entre ellos y los de secuencia de nucleótidos de los virus aislados en Vijes y Palmira mostró que éstos presentan los valores de identidad más altos (87,2 % y 86,6 %) con el virus de la distorsión de la hoja de maracuyá, un begomovirus aislado de maracuyá en Colombia. Estos análisis estarían indicando que este begomovirus aislado de ají podría ser una nueva especie. De acuerdo con la literatura, este es el primer reporte de un begomovirus infectando cultivos de ají en Colombia.
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哥伦比亚首次报告Begomovirus感染辣椒(辣椒属)作物
Begomovirus属病毒感染世界各地具有重要经济意义的作物,包括辣椒。目前,哥伦比亚还没有关于这种作物中存在begomovirus的报告,因此本研究的目的是利用分子策略确定辣椒中存在该属病毒。在考卡山谷的10个城市收集了197个辣椒样本。在本研究中,我们分析了不同种类的植物,并对其进行了鉴定。为了确定病毒的分子特性,扩增了从Palmira和Vijes采集的1.4 kb样本片段。对这些片段进行克隆、测序和分析。本研究的目的是评估辣椒样本中begomovirus阳性的程度。病毒的基因片段的序列分析1.4 kb投掷一个身份91,8 %与他们之间的核苷酸序列中分离的病毒Vijes身份和米拉表明这些值最高(720氯化%)与变形病毒maracuyámaracuyá,一个孤立的begomovirus表在哥伦比亚。这些分析表明,从辣椒中分离出来的begomovirus可能是一个新种。根据文献,这是哥伦比亚首次报道begomovirus感染辣椒作物。Begomovirus属病毒感染世界各地具有重要经济意义的作物,包括辣椒。目前,哥伦比亚还没有关于这种作物中存在begomovirus的报告,因此本研究的目的是利用分子策略确定辣椒中存在该属病毒。在考卡山谷的10个城市收集了197个辣椒样本。在本研究中,我们分析了不同种类的植物,并对其进行了鉴定。为了确定病毒的分子特性,扩增了从Palmira和Vijes采集的1.4 kb样本片段。对这些片段进行克隆、测序和分析。本研究的目的是评估辣椒样本中begomovirus阳性的程度。病毒的基因片段的序列分析1.4 kb投掷一个身份91,8 %与他们之间的核苷酸序列中分离的病毒Vijes身份和米拉表明这些值最高(720氯化%)与变形病毒maracuyámaracuyá,一个孤立的begomovirus表在哥伦比亚。这些分析表明,从辣椒中分离出来的begomovirus可能是一个新种。根据文献,这是哥伦比亚首次报道begomovirus感染辣椒作物。
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来源期刊
Acta Biologica Colombiana
Acta Biologica Colombiana Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences
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13 weeks
期刊介绍: The journal is published quarterly and divulges original and unpublished results of basic and applied research about biological subjects with special interest in Neotropical region. Manuscripts may be research articles, reviews, reflection articles or short notes. The Acta biol. Colomb Journal have a scientific and editorial board composed of expert researchers of in their areas of knowledge.
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