Diversidad Génetica de poblaciones de guanábana (Annona muricata L.) en Nayarit, México mediante marcadores SSR y SRAP.

IF 0.5 4区 生物学 Q4 PLANT SCIENCES Acta Biologica Colombiana Pub Date : 2021-09-27 DOI:10.15446/abc.v27n1.88241
Rosalba Lira-Ortiz, M. Cortés-Cruz, G. G. López-Guzmán, Yolotzin Apatzingán Palomino-Hermosillo, Isaac Sandoval-Padilla, V. A. Ochoa-Jiménez, Leticia Mónica Sánchez-Herrera, R. Balois-Morales, Guillermo Berumen-Varela
{"title":"Diversidad Génetica de poblaciones de guanábana (Annona muricata L.) en Nayarit, México mediante marcadores SSR y SRAP.","authors":"Rosalba Lira-Ortiz, M. Cortés-Cruz, G. G. López-Guzmán, Yolotzin Apatzingán Palomino-Hermosillo, Isaac Sandoval-Padilla, V. A. Ochoa-Jiménez, Leticia Mónica Sánchez-Herrera, R. Balois-Morales, Guillermo Berumen-Varela","doi":"10.15446/abc.v27n1.88241","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"La guanábana (Annona muricata) es un cultivo de importancia económica para Nayarit, México. Los frutos han tenido una excelente aceptación en el mercado regional, dificultando su comercialización a lugares lejanos porque la producción es altamente perecedera, aunado a que los árboles de los huertos de guanábana son en su mayoría ecotipos o fenotipos sin ningún plan de mejoramiento genético. Debido a  la falta de variedades comerciales y de un banco de germoplasma, es importante conocer la diversidad genética para identificar y seleccionar genotipos; una de las herramientas para este propósito es el uso de marcadores moleculares. El objetivo de esta investigación fue analizar la diversidad genética de guanábana de las principales zonas productoras de Nayarit. Se extrajo ADN genómico de hojas de guanábana, las cuales fueron recolectadas de 11 huertos (poblaciones)  de las siguientes zonas: Compostela (cinco poblaciones), Tepic (tres poblaciones) y San Blas (tres poblaciones). Posteriormente, se realizó un análisis mediante marcadores moleculares SSR y SRAP. Los resultados indicaron que los SSR no mostraron polimorfismo entre las poblaciones. Por otro lado, en los marcadores SRAP se obtuvieron 116 loci polimórficos con un promedio de porcentaje de loci polimórfico (P) entre las zonas productoras de 29,55 %. Asimismo, se realizó un AMOVA, el cual mostró que el mayor porcentaje de varianza se encuentra dentro de las poblaciones. Además, los análisis de agrupamiento demostraron la formación de tres grupos independientes. Por tanto, se obtuvo una alta homocigocidad y baja diversidad genética de guanábana entre las zonas y poblaciones estudiadas.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.5000,"publicationDate":"2021-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Acta Biologica Colombiana","FirstCategoryId":"99","ListUrlMain":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n1.88241","RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"PLANT SCIENCES","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

La guanábana (Annona muricata) es un cultivo de importancia económica para Nayarit, México. Los frutos han tenido una excelente aceptación en el mercado regional, dificultando su comercialización a lugares lejanos porque la producción es altamente perecedera, aunado a que los árboles de los huertos de guanábana son en su mayoría ecotipos o fenotipos sin ningún plan de mejoramiento genético. Debido a  la falta de variedades comerciales y de un banco de germoplasma, es importante conocer la diversidad genética para identificar y seleccionar genotipos; una de las herramientas para este propósito es el uso de marcadores moleculares. El objetivo de esta investigación fue analizar la diversidad genética de guanábana de las principales zonas productoras de Nayarit. Se extrajo ADN genómico de hojas de guanábana, las cuales fueron recolectadas de 11 huertos (poblaciones)  de las siguientes zonas: Compostela (cinco poblaciones), Tepic (tres poblaciones) y San Blas (tres poblaciones). Posteriormente, se realizó un análisis mediante marcadores moleculares SSR y SRAP. Los resultados indicaron que los SSR no mostraron polimorfismo entre las poblaciones. Por otro lado, en los marcadores SRAP se obtuvieron 116 loci polimórficos con un promedio de porcentaje de loci polimórfico (P) entre las zonas productoras de 29,55 %. Asimismo, se realizó un AMOVA, el cual mostró que el mayor porcentaje de varianza se encuentra dentro de las poblaciones. Además, los análisis de agrupamiento demostraron la formación de tres grupos independientes. Por tanto, se obtuvo una alta homocigocidad y baja diversidad genética de guanábana entre las zonas y poblaciones estudiadas.
查看原文
分享 分享
微信好友 朋友圈 QQ好友 复制链接
本刊更多论文
瓜纳巴纳(Annona muricata L.)种群的遗传多样性。通过SSR和SRAP标记在墨西哥纳亚里特。
番石榴(Annona muricata)是墨西哥纳亚里特的一种重要经济作物。水果在区域市场上得到了很好的接受,很难销售到遥远的地方,因为生产非常易腐,再加上瓜纳巴纳果园的树木大多是生态型或表型,没有任何遗传改良计划。由于缺乏商业品种和种质库,了解遗传多样性对于识别和选择基因型很重要;为此目的的工具之一是使用分子标记。这项研究的目的是分析纳亚里特主要产区番石榴的遗传多样性。从番石榴叶中提取基因组DNA,从以下地区的11个果园(种群)中采集:孔波斯特拉(5个种群)、特皮克(3个种群)和圣布拉斯(3个种群)。随后,利用SSR和SRAP分子标记进行了分析。结果表明,SSR在群体之间没有表现出多态性。另一方面,在SRAP标记中获得了116个多态性位点,生产区之间的多态性位点平均百分比为29.55%。此外,还进行了一次AMOVA,这表明方差的最大百分比在人群中。此外,聚类分析还显示了三个独立组的形成。因此,在所研究的地区和群体中,冠状病毒的纯合度高,遗传多样性低。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 去求助
来源期刊
Acta Biologica Colombiana
Acta Biologica Colombiana Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences
CiteScore
1.60
自引率
0.00%
发文量
21
审稿时长
13 weeks
期刊介绍: The journal is published quarterly and divulges original and unpublished results of basic and applied research about biological subjects with special interest in Neotropical region. Manuscripts may be research articles, reviews, reflection articles or short notes. The Acta biol. Colomb Journal have a scientific and editorial board composed of expert researchers of in their areas of knowledge.
期刊最新文献
BIOLOGICAL ACTIVITIES AND CHEMICAL COMPOSITION OF Rubia tinctorum (L) ROOT AND AERIAL PART EXTRACTS THEREOF. FISHES (Actinopteri, Characiformes) FROM THE TAPYTA RESERVE WITH THREE NEW ADDITIONS TO THE PARAGUAYAN ICHTHYOFAUNA DEPREDACIÓN EN NIDOS ARTIFICIALES DE AVES EN UN GRADIENTE DE INTERVENCIÓN ANTRÓPICA EN LA AMAZONIA COLOMBIANA EL CRÁNEO DE Caiman crocodilus fuscus: VARIACIONES ALOMÉTRICAS Y ONTOGENÉTICAS DETECCIÓN MOLECULAR DE BEGOMOVIRUS AISLADOS DE ARVENSES ASOCIADAS AL CULTIVO DE AJÍ (Capsicum spp.) EN EL VALLE DEL CAUCA, COLOMBIA
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
已复制链接
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
×
扫码分享
扫码分享
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1