Rahmadina Putri, Mega Safithri, Husnawati Husnawati, Rini Kurniasih
{"title":"Penambatan Molekuler Senyawa Aktif Sirih Merah (Piper crocatum) pada Butirilkolinesterase sebagai Kandidat Antialzheimer","authors":"Rahmadina Putri, Mega Safithri, Husnawati Husnawati, Rini Kurniasih","doi":"10.20961/alchemy.19.1.59676.68-85","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Alzheimer adalah salah satu penyakit neurodegeneratif kronis dan menjadi penyakit yang sering dialami oleh orang lanjut usia. Perubahan yang terjadi dari penyakit Alzheimer, yakni penurunan fungsi kognitif, memori, dan perubahan perilaku secara permanen. Senyawa aktif pada daun sirih merah memiliki kesamaan kandungan dengan daun sirih hijau untuk menghambat butirilkolinesterase (BChE). Butirilkolinesterase adalah salah satu enzim yang berperan dalam penanganan penyakit Alzheimer dikaitkan dengan terbentuknya Alzheimer, yakni hipotesis kolinergik. Penelitian dilakukan menguji daya inhibisi senyawa aktif yang terkandung dalam daun sirih merah terhadap aktivitas butirilkolinesterase melalui pendekatan simulasi penambatan molekuler. Penelitian menggunakan dua metode, yakni penggabungan penapisan virtual dan penambatan molekuler sebagai tahapan awal pengembangan daun sirih merah terhadap aktivitas penghambatan butirilkolinesterase. Hasil dalam penelitian diperoleh, daya inhibisi terbaik ditemukan pada 1,2,3,4,5,6,7-heptazacycloicosane sebesar 0,4888 µM dan energi bebas pengikatan sebesar -8,6 kkal∙mol-1. Residu yang berperan dalam menghambat butirilkolinesterase, yakni pada pengikatan substrat oleh ligan uji, yakni Tyr-332 dan Trp-82. Hasil penelitian ini dapat dijadikan sebagai sumber referensi dalam menemukan alternatif pengobatan penyakit Alzheimer. Molecular Docking of the Active Compound of Red Betel (Piper crocatum) on Butyrylcholinesterase as an Antialzheimer's Candidate. Alzheimer's is a chronic neurodegenerative disease often experienced by the elderly. Changes that occur from Alzheimer's disease such as permanent decline in cognitive function, memory, and behavioral changes. The active compounds in red betel leaves have similar contents with green betel leaves to inhibit butyrylcholinesterase (BChE). Butyrylcholinesterase is an enzyme that may play an important role in the treatment of Alzheimer's disease associated with the formation of Alzheimer's, the cholinergic hypothesis. The study tested the inhibition power of the active compounds contained in red betel leaves against the activity of butyrylcholinesterase through a molecular docking simulation approach. The method in the study used the merger of virtual screening and molecular docking as the initial stage for the development of red betel leaves against the inhibitory activity of butyrylcholinesterase. The result in the study found the best inhibitiron power was found at 1,2,3,4,5,6,7-heptazacycloicosane of 0.4888 µM and binding free energy of -8.6 kkal∙mol-1. The residues that play a role in the inhibition of butyrylcholinesterase on substrate binding by test ligands were Tyr-332 and Trp-82. The research result can be used as a reference in finding alternative treatments for Alzheimer's disease. ","PeriodicalId":7926,"journal":{"name":"Alchemy: Jurnal Penelitian Kimia","volume":"16 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-03-23","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Alchemy: Jurnal Penelitian Kimia","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.20961/alchemy.19.1.59676.68-85","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Abstract
Alzheimer adalah salah satu penyakit neurodegeneratif kronis dan menjadi penyakit yang sering dialami oleh orang lanjut usia. Perubahan yang terjadi dari penyakit Alzheimer, yakni penurunan fungsi kognitif, memori, dan perubahan perilaku secara permanen. Senyawa aktif pada daun sirih merah memiliki kesamaan kandungan dengan daun sirih hijau untuk menghambat butirilkolinesterase (BChE). Butirilkolinesterase adalah salah satu enzim yang berperan dalam penanganan penyakit Alzheimer dikaitkan dengan terbentuknya Alzheimer, yakni hipotesis kolinergik. Penelitian dilakukan menguji daya inhibisi senyawa aktif yang terkandung dalam daun sirih merah terhadap aktivitas butirilkolinesterase melalui pendekatan simulasi penambatan molekuler. Penelitian menggunakan dua metode, yakni penggabungan penapisan virtual dan penambatan molekuler sebagai tahapan awal pengembangan daun sirih merah terhadap aktivitas penghambatan butirilkolinesterase. Hasil dalam penelitian diperoleh, daya inhibisi terbaik ditemukan pada 1,2,3,4,5,6,7-heptazacycloicosane sebesar 0,4888 µM dan energi bebas pengikatan sebesar -8,6 kkal∙mol-1. Residu yang berperan dalam menghambat butirilkolinesterase, yakni pada pengikatan substrat oleh ligan uji, yakni Tyr-332 dan Trp-82. Hasil penelitian ini dapat dijadikan sebagai sumber referensi dalam menemukan alternatif pengobatan penyakit Alzheimer. Molecular Docking of the Active Compound of Red Betel (Piper crocatum) on Butyrylcholinesterase as an Antialzheimer's Candidate. Alzheimer's is a chronic neurodegenerative disease often experienced by the elderly. Changes that occur from Alzheimer's disease such as permanent decline in cognitive function, memory, and behavioral changes. The active compounds in red betel leaves have similar contents with green betel leaves to inhibit butyrylcholinesterase (BChE). Butyrylcholinesterase is an enzyme that may play an important role in the treatment of Alzheimer's disease associated with the formation of Alzheimer's, the cholinergic hypothesis. The study tested the inhibition power of the active compounds contained in red betel leaves against the activity of butyrylcholinesterase through a molecular docking simulation approach. The method in the study used the merger of virtual screening and molecular docking as the initial stage for the development of red betel leaves against the inhibitory activity of butyrylcholinesterase. The result in the study found the best inhibitiron power was found at 1,2,3,4,5,6,7-heptazacycloicosane of 0.4888 µM and binding free energy of -8.6 kkal∙mol-1. The residues that play a role in the inhibition of butyrylcholinesterase on substrate binding by test ligands were Tyr-332 and Trp-82. The research result can be used as a reference in finding alternative treatments for Alzheimer's disease.
阿尔茨海默氏症是一种慢性神经退行性疾病,是老年人最常见的疾病之一。阿尔茨海默氏症的变化,即认知、记忆和行为的永久丧失。红槟榔叶中活跃的化合物与绿槟榔叶的含量相似,可以抑制白藜芦醇(BChE)。利氏菌酶是治疗阿尔茨海默氏症的一种酶,与早发性假设的形成有关。研究进行了测试,通过分子增强模拟方法测试红槟榔叶中含有的活性化合物抑制力。研究使用两种方法,即将虚氧和分子凝乳结合起来,作为红槟榔叶发育的第一步。对照研究中,结果发现,最好的抑制能力的大小1,2,3,4,5,6,7-heptazacycloicosane 0.4888µM和无约束力的能源相当于-8,6 kkal∙mol-1。残留物的作用是抑制颗粒碱质酶,也就是332和82的次级联结。本研究可作为替代治疗老年痴呆症的参考资料。美国抗阿尔茨海默氏症候选人候选人的红皮区分子对接。阿尔茨海默氏症是一种由老年人试验的慢性退行性疾病。阿尔茨海默氏症的症状就像认知功能、记忆和行为改变的永久性脱氧核糖核酸。红色上皮细胞中活跃的化合物与绿色上皮细胞对乙酰胆碱酶(BChE)的影响类似。但胆碱酶是一种酶,可以在阿尔茨海默氏症的治疗中扮演重要的角色。研究测试了被涂在红色上皮细胞中的活性化合物的抑制作用,使其在分子模拟中不受抑制。研究中的方法利用了红伯特利发展的虚拟筛选和分子的结合,从而抵消了乙酰胆碱酶酶酶的抑制作用。境论点study at best inhibitiron电源是找到1,2,3,4,5,6,7-heptazacycloicosane》找到了0。4888µM》和公关印象深刻(free energy。6 kkal∙mol-1。通过ligands测试在枕部抑制中发挥作用的残留是332和Trp-82。研究论点可以成为过去美国参考》找到另类treatments阿尔茨海默氏症的疾病。