{"title":"Pankreas Kanseri hcrelerinde Tripartite Motif-Containing Protein 3 (TRIM3) Gen ekspresyonunAraştırılması","authors":"Muradiye Acar","doi":"10.35440/hutfd.1121746","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Amaç: Pankreas kanseri, tüm kanserler içinde en kötü prognoza sahip olanlar arasındadır. Tripartite Motif-Containing Protein 3 (TRIM3) geni tümör baskılayıcı bir gen olarak kanser hücrelerinin proliferasyonu, migrasyonu ve invazyonunu kontrol ederek tümör baskılayıcı olarak rol oynamaktadır. Bu çalışmanın amacı, AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 pankreas kanseri hücre hatlarındaki TRIM3 geninin mRNA seviyesindeki ekspresyonunu araştırmaktır.\n\nMateryal ve metod: AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 hücre hatları 37˚C’de %5 CO2 içeren ortamda kültüre edildi ve total RNA izolasyonu yapıldı. TRIM3 geni mRNA ekspresyon seviyesi Kantitatif Ters Transkripsiyon PCR (RT-qPCR) metodu ile incelendi. Relatif gen ekspresyon verilerinin analizi 2-∆∆CT metodu kullanılarak yapıldı.\n\nBulgular: Üç hücre hattında da TRIM3'ün mRNA ekspresyon seviyelerinin çok düşük olduğu tespit edildi. İlaveten kat değişimi hesaplandığında hücre hatları arasında istatistiksel fark gözlenmedi.\n\nSonuç: TRIM3 geni karsinogenez sürecinde tümör baskılayıcı gen olarak rol oynamaktadır ve kanser hücrelerinde TRIM3 ekspresyonunun azaldığı gösterilmiştir. Literatürdeki diğer kanser türleri ile uyumlu şekilde pankreas kanseri hücrelerinde TRIM3 mRNA ekspresyonunun çok düşük olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışma AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 pankreas kanseri hücre hatları ve TRIM3 arasındaki ilişkiyi araştıran tek çalışma olması sebebiyle bundan sonra yapılacak fonksiyonel çalışmalara ışık tutacaktır.","PeriodicalId":117847,"journal":{"name":"Harran Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi","volume":"39 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-12-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Pankreas Kanseri Hücrelerinde Tripartite Motif-Containing Protein 3 (TRIM3) Gen Ekspresyonunun Araştırılması\",\"authors\":\"Muradiye Acar\",\"doi\":\"10.35440/hutfd.1121746\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Amaç: Pankreas kanseri, tüm kanserler içinde en kötü prognoza sahip olanlar arasındadır. Tripartite Motif-Containing Protein 3 (TRIM3) geni tümör baskılayıcı bir gen olarak kanser hücrelerinin proliferasyonu, migrasyonu ve invazyonunu kontrol ederek tümör baskılayıcı olarak rol oynamaktadır. Bu çalışmanın amacı, AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 pankreas kanseri hücre hatlarındaki TRIM3 geninin mRNA seviyesindeki ekspresyonunu araştırmaktır.\\n\\nMateryal ve metod: AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 hücre hatları 37˚C’de %5 CO2 içeren ortamda kültüre edildi ve total RNA izolasyonu yapıldı. TRIM3 geni mRNA ekspresyon seviyesi Kantitatif Ters Transkripsiyon PCR (RT-qPCR) metodu ile incelendi. Relatif gen ekspresyon verilerinin analizi 2-∆∆CT metodu kullanılarak yapıldı.\\n\\nBulgular: Üç hücre hattında da TRIM3'ün mRNA ekspresyon seviyelerinin çok düşük olduğu tespit edildi. İlaveten kat değişimi hesaplandığında hücre hatları arasında istatistiksel fark gözlenmedi.\\n\\nSonuç: TRIM3 geni karsinogenez sürecinde tümör baskılayıcı gen olarak rol oynamaktadır ve kanser hücrelerinde TRIM3 ekspresyonunun azaldığı gösterilmiştir. Literatürdeki diğer kanser türleri ile uyumlu şekilde pankreas kanseri hücrelerinde TRIM3 mRNA ekspresyonunun çok düşük olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışma AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 pankreas kanseri hücre hatları ve TRIM3 arasındaki ilişkiyi araştıran tek çalışma olması sebebiyle bundan sonra yapılacak fonksiyonel çalışmalara ışık tutacaktır.\",\"PeriodicalId\":117847,\"journal\":{\"name\":\"Harran Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi\",\"volume\":\"39 1\",\"pages\":\"0\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2022-12-27\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Harran Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.35440/hutfd.1121746\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Harran Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.35440/hutfd.1121746","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
Pankreas Kanseri Hücrelerinde Tripartite Motif-Containing Protein 3 (TRIM3) Gen Ekspresyonunun Araştırılması
Amaç: Pankreas kanseri, tüm kanserler içinde en kötü prognoza sahip olanlar arasındadır. Tripartite Motif-Containing Protein 3 (TRIM3) geni tümör baskılayıcı bir gen olarak kanser hücrelerinin proliferasyonu, migrasyonu ve invazyonunu kontrol ederek tümör baskılayıcı olarak rol oynamaktadır. Bu çalışmanın amacı, AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 pankreas kanseri hücre hatlarındaki TRIM3 geninin mRNA seviyesindeki ekspresyonunu araştırmaktır.
Materyal ve metod: AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 hücre hatları 37˚C’de %5 CO2 içeren ortamda kültüre edildi ve total RNA izolasyonu yapıldı. TRIM3 geni mRNA ekspresyon seviyesi Kantitatif Ters Transkripsiyon PCR (RT-qPCR) metodu ile incelendi. Relatif gen ekspresyon verilerinin analizi 2-∆∆CT metodu kullanılarak yapıldı.
Bulgular: Üç hücre hattında da TRIM3'ün mRNA ekspresyon seviyelerinin çok düşük olduğu tespit edildi. İlaveten kat değişimi hesaplandığında hücre hatları arasında istatistiksel fark gözlenmedi.
Sonuç: TRIM3 geni karsinogenez sürecinde tümör baskılayıcı gen olarak rol oynamaktadır ve kanser hücrelerinde TRIM3 ekspresyonunun azaldığı gösterilmiştir. Literatürdeki diğer kanser türleri ile uyumlu şekilde pankreas kanseri hücrelerinde TRIM3 mRNA ekspresyonunun çok düşük olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışma AsPC1, BxPC-3 ve PANC-1 pankreas kanseri hücre hatları ve TRIM3 arasındaki ilişkiyi araştıran tek çalışma olması sebebiyle bundan sonra yapılacak fonksiyonel çalışmalara ışık tutacaktır.