西瓜RxaM1基因多态性的鉴定及其与血管细菌病抗性的关系

IF 0.5 4区 生物学 Q4 PLANT SCIENCES Acta Biologica Colombiana Pub Date : 2020-05-01 DOI:10.15446/ABC.V25N2.77564
A. Barrera, J. Soto-Sedano, Camilo Ernesto López Carrascal
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摘要

木薯(Manihot esculenta Crantz)是热带地区的一种重要作物,为全世界近10亿人提供了食物。最重要的细菌性疾病是轴突黄单胞菌引起的血管细菌病。manihotis (Xam)。最近发现了一种名为RXAM1的耐药基因,该基因编码一种具有细胞外LRR(富亮氨酸重复)结构域和细胞质STK(丝氨酸苏氨酸激酶)结构域的蛋白质。RXAM1与QTL结合,解释了13%的Xam菌株CIO136的抗性。本研究评价了10个不同木薯品种对XamCIO136菌株的感染反应,发现TMS60444、SG10735、MCOL1522、MCOL1505和MCOL2215菌株易感,CM6438-14、CM523-7和MBRA902菌株具有抗性。在同一组品种中发现了RXAM1基因的单核苷酸多态性。品种SG10735、CM6438-14、TMS6044和MBRA685的多态性水平最高,而品种CM523-7、CM2177-2和MCOL1522的多态性水平较低,统计分析表明表型与多态性之间没有显著关联。这项研究代表了将等位基因变异与血管细菌病反应表型联系起来的初步努力。
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Identificación de polimorfismos en el gen RXAM1 de yuca y su asociación con la resistencia a la bacteriosis vascular
La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo importante en regiones del trópico que proporciona alimento para cerca de 1000 millones de personas en todo el mundo. La enfermedad bacteriana más importante es la bacteriosis vascular causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Recientemente se logró identificar un gen de resistencia denominado RXAM1, el cual codifica para una proteína que posee un dominio LRR (Leucine-Rich Repeat) extracelular y un dominio STK (Serine Threonine Kinase) citoplasmático. RXAM1 colocaliza con un QTL que explica el 13 % de la resistencia a la cepa CIO136 de Xam. En este trabajo se evaluó la respuesta a la infección con la cepa XamCIO136 en diez diferentes variedades de yuca lo cual permitió identificar que las variedades TMS60444, SG10735, MCOL1522, MCOL1505 y MCOL2215 fueron susceptibles, mientras que CM6438-14, CM523-7 y MBRA902 se comportaron como resistentes. Así mismo se identificaron polimorfismos tipo SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) en el gen RXAM1 en el mismo grupo de variedades. Las variedades SG10735, CM6438-14, TMS6044 y MBRA685 presentaron el mayor nivel de polimorfismos, mientras que las variedades CM523-7, CM2177-2 y MCOL1522 fueron menos polimórficas para este gen. Los análisis estadísticos no permitieron identificar una asociación significativa entre el fenotipo y los polimorfismos identificados. Este estudio representa un primer esfuerzo con miras a asociar variantes alélicas con el fenotipo de respuesta a la bacteriosis vascular.
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来源期刊
Acta Biologica Colombiana
Acta Biologica Colombiana Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences
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期刊介绍: The journal is published quarterly and divulges original and unpublished results of basic and applied research about biological subjects with special interest in Neotropical region. Manuscripts may be research articles, reviews, reflection articles or short notes. The Acta biol. Colomb Journal have a scientific and editorial board composed of expert researchers of in their areas of knowledge.
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