14个水稻品种(Oryza sativa L.)与起源系的形态农艺和分子比较

IF 0.5 4区 生物学 Q4 PLANT SCIENCES Acta Biologica Colombiana Pub Date : 2021-09-21 DOI:10.15446/abc.v27n1.84269
Lenin Alonso Rodriguez-Betancourth, Constanza Quintero, Juan Cuásquer, E. Graterol, Mario García Davila, Maribel Cruz-Gallego
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摘要

为了确定拉丁美洲14个水稻品种及其各自起源系之间的形态-农艺和质量差异以及遗传多样性,建立了一项研究(随机整群,28种基因型,3次重复,2次播种),测量了25个形态-农艺和谷物质量变量。分子分析是通过排列96个对籼稻具有高分辨能力的SNP型标记进行的。统计分析是结合两种作物的数据进行的,因为它们之间没有统计差异。此外,还使用Gower指数将分子数据与形态-农艺和质量数据进行了联合分析,以生成相似性矩阵。SAS方案独立和共同分析了农艺和分子数据。结果表明,在14个品种中,有8个品种与其起源系分组,有一个品种与其祖先的姐妹系分组。当单独或联合进行数据分析时,结果是一致的。鉴于品种内部发现的广泛多样性,没有一个是100%纯合子,无法建立它们的独特遗传图谱,因此必须对品种进行纯化,以建立它们的遗传指纹。
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Comparación morfo-agronómica y molecular de catorce variedades de arroz (Oryza sativa L.) con las líneas que dieron su origen
Con el objetivo de determinar las diferencias morfo-agronómicas y de calidad, y la diversidad genética entre 14 variedades de arroz de América Latina con sus respectivas líneas de origen, se estableció un estudio (Bloques completos al azar, con 28 genotipos, tres repeticiones y dos siembras en el tiempo), en el cual se midieron 25 variables morfo-agronómicas y de calidad de grano. El análisis molecular se hizo mediante un arreglo de 96 marcadores tipo SNP de alta capacidad de discriminación para arroces Indica. El análisis estadístico se hizo combinando los datos de las dos siembras porque no hubo diferencias estadísticas entre ellas. Además, se analizaron en conjunto los datos moleculares con los morfo-agronómicos y de calidad, usando el índice de Gower para generar una matriz de similitud. Mediante el programa SAS se analizaron los datos agronómicos y moleculares tanto en forma independiente como en conjunto. Los resultados mostraron que, de las 14 variedades, ocho se agruparon con su línea de origen y hubo una variedad que se agrupó con una línea hermana de su ancestro. Los resultados fueron consistentes cuando el análisis de datos se hizo independientemente o combinado. Dada la amplia diversidad encontrada dentro de las variedades y que ninguna fue homocigota al 100 % no se pudieron establecer los perfiles genéticos distintivos de ellas, por lo que se debe hacer la purificación de las variedades para establecer su huella genética.
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Acta Biologica Colombiana
Acta Biologica Colombiana Agricultural and Biological Sciences-General Agricultural and Biological Sciences
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