通过硅策略鉴定已知抗SARS-CoV-2活性化合物的可能分子识别模式

Larissa De Mattos Oliveira, Nadson De Jesus Nogueira
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摘要

COVID-19是一种由SARS-CoV-2病毒引起的疾病,是造成大流行的原因,已经造成480多万人死亡。虽然已经有有效的疫苗来控制这种疾病,但仍然需要开发针对SARS-CoV-2的特定药物。一些体外研究指出了有希望对抗病毒的分子,但没有阐明调节生物反应的分子识别模式。因此,本研究的目的是确定以前研究过的抑制剂的可能分子识别模式。利用Autodock vina©软件进行分子偶联研究,选择结果最好的分子进行分子间相互作用分析。互动研究发现,复杂的工作,每天(M - pro和六氯酚、Pl pro和osajin,蛋白S oxiclozanida和Nsp15 niclosamida)匹配结果的研究文献,因此结果有助于未来研究的分子动力学和体内试验的治疗方法来控制发展COVID -19。
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Identificação do possível padrão de reconhecimento molecular de compostos com atividade conhecida frente ao SARS-CoV-2 através de estratégias in silico
A COVID-19 é uma doença provocada pelo vírus SARS-CoV-2 e é responsável por uma pandemia já ocasionou mais de 4,8 milhões de óbitos. Apesar de já existirem vacinas eficazes no controle à doença, ainda há a necessidade de desenvolver medicamentos específicos contra o SARS-CoV-2. Alguns estudos in vitro apontam moléculas promissoras para o combate ao vírus, no entanto, não esclarecem os padrões de reconhecimento molecular para a modulação da resposta biológica. Assim, o objetivo desse trabalho foi identificar o possível padrão de reconhecimento molecular de inibidores previamente estudados. Os estudos de acoplamento molecular foram realizados com o programa Autodock vina©, sendo escolhidas as moléculas com melhores resultados para a realização da análise das interações intermoleculares. As interações encontradas nesse trabalho para os complexos estudados (M-pro e hexaclorofeno, Pl-pro e osajin, proteína S e oxiclozanida e Nsp15 com a niclosamida) coincidiram com resultados apresentados na literatura e, portanto, os resultados obtidos contribuem para futuros estudos de dinâmica molecular e testes in vivo para o desenvolvimento de abordagens terapêuticas para controle da COVID-19.
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