利用药物信息学方法揭示绿葛地、扁豆和芝麻的抗糖尿病和药理特性

B. Kepel, Fatimawali Fatimawali, T. Tallei, Marko Jeremia Kalalo
{"title":"利用药物信息学方法揭示绿葛地、扁豆和芝麻的抗糖尿病和药理特性","authors":"B. Kepel, Fatimawali Fatimawali, T. Tallei, Marko Jeremia Kalalo","doi":"10.21082/jlittri.v28n1.2022.21-34","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Diabetes mellitus is characterized by a deficiency in insulin secretion, insulin action, or both, resulting in a chronic hyperglycemic condition. Recent studies showed that bioactive compounds from plants possess great anti-diabetic activity with less unfavorable side effects. Therefore, our study aims to evaluate several bioactive compounds from Green Gedi, Leilem, and Sesewanua against alpha-amylase and aldose reductase using a molecular docking approach and to assess their pharmacological properties. We used GC-MS to identify bioactive compounds from three species of Indonesian medicinal plants. Identified bioactive compounds along with bioactive compounds from the literature search were used as ligands targeting alpha-amylase and aldose reductase as protein targets using PyRx. The pharmacological evaluations were performed with SwissADME, ADMETlab, and PASS online. We found that ligands used in this study vary in pharmacological properties and had binding energy ranging from -3.7 kcal/mol to -10.8 kcal/mol and -4.5 kJ/mol to -11.3 kJ/mol against alpha-amylase and aldose reductase, respectively. To conclude, bioactive compounds in these plants have great anti-diabetic potential due to their pharmacological properties, binding energy, and interactions against alpha-amylase and aldose reductase.Keywords: bioactive compounds, medicinal plants, molecular docking, pharmacological properties AbstrakDiabetes melitus dicirikan dengan kurangnya sekresi maupun kerja hormon insulin yang menyebabkan kondisi hiperglikemik kronis. Penelitian terdahulu menunjukkan potensi dari senyawa bioaktif dari tanaman yang memiliki aktivitas antidiates dengan tingkat efek samping yang rendah. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi beberapa senyawa bioaktif dari Gedi Hijau, Leilem, and Sesewanua terhadap alfa amilase dan aldos reductase menggunakan penambatan molekuler dan mengukur sifat farmakologinya. GC-MS digunakan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif dari beberapa tanaman Indonesia. Penelusuran literatur juga dilakukan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif yang berpotensi sebagai antidiabetes. Senyawa bioaktif yang teridentifikasi digunakan sebagai ligan dengan menargetkan alfa amilase dan aldos reduktase sebagai protein target dengan menggunakan PyRx. Evaluasi sifat farmakologi dilakukan dengan menggunakan SwissADME, ADMETlab, dan PASS online. Senyawa-senyawa bioaktif yang teridentifikasi menunjukkan sifat farmakologi yang bervariasi dan memiliki energi ikatan terhadap alfa amilase sebesar -3.7 kcal/mol sampai -10.8 kcal/mol dan terhadap aldos reduktase sebesar -4.5 kJ/mol sampai -11.3 kJ/mol. Senyawa bioaktif dari tanaman tersebut menunjukkan potensi antidiabetes yang baik berdasarkan sifat farmakologi, energi ikatan dan interaksi terhadap alfa amilase dan aldos reduktase.Kata kunci : penambatan molekuler, senyawa bioaktif, sifat farmakologi, tanaman obat ","PeriodicalId":17774,"journal":{"name":"Jurnal Penelitian Tanaman Industri","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-08-07","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":"{\"title\":\"UNRAVELING ANTI-DIABETIC AND PHARMACOLOGICAL PROPERTIES OF GREEN GEDI, LEILEM, AND SESEWANUA USING A PHARMACOINFORMATICS APPROACH\",\"authors\":\"B. Kepel, Fatimawali Fatimawali, T. Tallei, Marko Jeremia Kalalo\",\"doi\":\"10.21082/jlittri.v28n1.2022.21-34\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Diabetes mellitus is characterized by a deficiency in insulin secretion, insulin action, or both, resulting in a chronic hyperglycemic condition. Recent studies showed that bioactive compounds from plants possess great anti-diabetic activity with less unfavorable side effects. Therefore, our study aims to evaluate several bioactive compounds from Green Gedi, Leilem, and Sesewanua against alpha-amylase and aldose reductase using a molecular docking approach and to assess their pharmacological properties. We used GC-MS to identify bioactive compounds from three species of Indonesian medicinal plants. Identified bioactive compounds along with bioactive compounds from the literature search were used as ligands targeting alpha-amylase and aldose reductase as protein targets using PyRx. The pharmacological evaluations were performed with SwissADME, ADMETlab, and PASS online. We found that ligands used in this study vary in pharmacological properties and had binding energy ranging from -3.7 kcal/mol to -10.8 kcal/mol and -4.5 kJ/mol to -11.3 kJ/mol against alpha-amylase and aldose reductase, respectively. To conclude, bioactive compounds in these plants have great anti-diabetic potential due to their pharmacological properties, binding energy, and interactions against alpha-amylase and aldose reductase.Keywords: bioactive compounds, medicinal plants, molecular docking, pharmacological properties AbstrakDiabetes melitus dicirikan dengan kurangnya sekresi maupun kerja hormon insulin yang menyebabkan kondisi hiperglikemik kronis. Penelitian terdahulu menunjukkan potensi dari senyawa bioaktif dari tanaman yang memiliki aktivitas antidiates dengan tingkat efek samping yang rendah. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi beberapa senyawa bioaktif dari Gedi Hijau, Leilem, and Sesewanua terhadap alfa amilase dan aldos reductase menggunakan penambatan molekuler dan mengukur sifat farmakologinya. GC-MS digunakan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif dari beberapa tanaman Indonesia. Penelusuran literatur juga dilakukan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif yang berpotensi sebagai antidiabetes. Senyawa bioaktif yang teridentifikasi digunakan sebagai ligan dengan menargetkan alfa amilase dan aldos reduktase sebagai protein target dengan menggunakan PyRx. Evaluasi sifat farmakologi dilakukan dengan menggunakan SwissADME, ADMETlab, dan PASS online. Senyawa-senyawa bioaktif yang teridentifikasi menunjukkan sifat farmakologi yang bervariasi dan memiliki energi ikatan terhadap alfa amilase sebesar -3.7 kcal/mol sampai -10.8 kcal/mol dan terhadap aldos reduktase sebesar -4.5 kJ/mol sampai -11.3 kJ/mol. Senyawa bioaktif dari tanaman tersebut menunjukkan potensi antidiabetes yang baik berdasarkan sifat farmakologi, energi ikatan dan interaksi terhadap alfa amilase dan aldos reduktase.Kata kunci : penambatan molekuler, senyawa bioaktif, sifat farmakologi, tanaman obat \",\"PeriodicalId\":17774,\"journal\":{\"name\":\"Jurnal Penelitian Tanaman Industri\",\"volume\":null,\"pages\":null},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2022-08-07\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"1\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Jurnal Penelitian Tanaman Industri\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.21082/jlittri.v28n1.2022.21-34\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jurnal Penelitian Tanaman Industri","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.21082/jlittri.v28n1.2022.21-34","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1

摘要

糖尿病的特点是胰岛素分泌、胰岛素作用或两者都缺乏,导致慢性高血糖状态。近年来的研究表明,植物活性化合物具有较强的抗糖尿病活性,且副作用小。因此,本研究旨在利用分子对接的方法对绿葛地、莱姆和芝麻瓜中几种抗α -淀粉酶和醛糖还原酶的生物活性化合物进行评价,并对其药理特性进行评估。采用气相色谱-质谱法对印度尼西亚三种药用植物的活性成分进行了鉴定。利用PyRx将已鉴定的生物活性化合物和文献检索的生物活性化合物作为靶向α -淀粉酶和醛糖还原酶的配体作为蛋白质靶点。使用SwissADME、ADMETlab和PASS在线进行药理学评估。我们发现,本研究中使用的配体具有不同的药理学性质,对α -淀粉酶和醛糖还原酶的结合能分别为-3.7 kcal/mol至-10.8 kcal/mol和-4.5 kJ/mol至-11.3 kJ/mol。综上所述,这些植物中的生物活性化合物由于其药理特性、结合能以及对α -淀粉酶和醛糖还原酶的相互作用而具有很大的抗糖尿病潜力。【关键词】生物活性化合物,药用植物,分子对接,药理特性【摘要】糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病,糖尿病Penelitian terdahulu menunjukkan potential dari senyawa bioaktif dari tanaman yang memoriliki aktivitas antidiates dengan tingka efek samping yang rendah。Gedi Hijau, Leilem和Sesewanua研究了alfa淀粉酶和aldos还原酶在孟山那克酶和孟山那克酶中的作用。digunakan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif dari beberaman Indonesia。penelurian文献juga dilakukan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif yang berpotential sebagai降糖药。Senyawa bioaktif yang鉴定了kasi digunakan、sebagai、dengan menargetan、alfa淀粉酶和aldos还原酶sebagai蛋白靶蛋白dengan menggunakan PyRx。瑞士adme, ADMETlab, dan PASS在线。Senyawa-senyawa -senyawa bioaktif yang teridentiidentii menunjukkan sifat farmakology yang bervarias - memiliki - energy - tanhadap - α淀粉酶sebesar -3.7 kcal/mol sampai -10.8 kcal/mol tanhadap醛还原酶sebesar -4.5 kJ/mol sampai -11.3 kJ/mol。Senyawa bioaktif dari tanaman terase, menunjukkan potential降糖药yang baik, dasarkan simakologology, energikatan和interakase - hafa淀粉酶和aldos还原酶。Kata kunci: penambatan分子,senyawa生物因子,sifat农学,tanaman obat
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
查看原文
分享 分享
微信好友 朋友圈 QQ好友 复制链接
本刊更多论文
UNRAVELING ANTI-DIABETIC AND PHARMACOLOGICAL PROPERTIES OF GREEN GEDI, LEILEM, AND SESEWANUA USING A PHARMACOINFORMATICS APPROACH
Diabetes mellitus is characterized by a deficiency in insulin secretion, insulin action, or both, resulting in a chronic hyperglycemic condition. Recent studies showed that bioactive compounds from plants possess great anti-diabetic activity with less unfavorable side effects. Therefore, our study aims to evaluate several bioactive compounds from Green Gedi, Leilem, and Sesewanua against alpha-amylase and aldose reductase using a molecular docking approach and to assess their pharmacological properties. We used GC-MS to identify bioactive compounds from three species of Indonesian medicinal plants. Identified bioactive compounds along with bioactive compounds from the literature search were used as ligands targeting alpha-amylase and aldose reductase as protein targets using PyRx. The pharmacological evaluations were performed with SwissADME, ADMETlab, and PASS online. We found that ligands used in this study vary in pharmacological properties and had binding energy ranging from -3.7 kcal/mol to -10.8 kcal/mol and -4.5 kJ/mol to -11.3 kJ/mol against alpha-amylase and aldose reductase, respectively. To conclude, bioactive compounds in these plants have great anti-diabetic potential due to their pharmacological properties, binding energy, and interactions against alpha-amylase and aldose reductase.Keywords: bioactive compounds, medicinal plants, molecular docking, pharmacological properties AbstrakDiabetes melitus dicirikan dengan kurangnya sekresi maupun kerja hormon insulin yang menyebabkan kondisi hiperglikemik kronis. Penelitian terdahulu menunjukkan potensi dari senyawa bioaktif dari tanaman yang memiliki aktivitas antidiates dengan tingkat efek samping yang rendah. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi beberapa senyawa bioaktif dari Gedi Hijau, Leilem, and Sesewanua terhadap alfa amilase dan aldos reductase menggunakan penambatan molekuler dan mengukur sifat farmakologinya. GC-MS digunakan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif dari beberapa tanaman Indonesia. Penelusuran literatur juga dilakukan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif yang berpotensi sebagai antidiabetes. Senyawa bioaktif yang teridentifikasi digunakan sebagai ligan dengan menargetkan alfa amilase dan aldos reduktase sebagai protein target dengan menggunakan PyRx. Evaluasi sifat farmakologi dilakukan dengan menggunakan SwissADME, ADMETlab, dan PASS online. Senyawa-senyawa bioaktif yang teridentifikasi menunjukkan sifat farmakologi yang bervariasi dan memiliki energi ikatan terhadap alfa amilase sebesar -3.7 kcal/mol sampai -10.8 kcal/mol dan terhadap aldos reduktase sebesar -4.5 kJ/mol sampai -11.3 kJ/mol. Senyawa bioaktif dari tanaman tersebut menunjukkan potensi antidiabetes yang baik berdasarkan sifat farmakologi, energi ikatan dan interaksi terhadap alfa amilase dan aldos reduktase.Kata kunci : penambatan molekuler, senyawa bioaktif, sifat farmakologi, tanaman obat 
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
期刊最新文献
STRATEGI PENINGKATAN KINERJA PERKEBUNAN KELAPA RAKYAT MELALUI INTEGRASI VERTIKAL RANTAI PASOK DENGAN INDUSTRI PENGOLAHAN DI GORONTALO / Strategy for Improving Performance of Coconut Smallholders through Vertical Integration of Supply Chain with Processing The Effectiveness of Tuba Root Formula (Derris elliptica BENTH.) to SUPPRESS H. antonii SIGN. Population, Pest of Estate Crops / Efektivitas Formula Akar Tuba (Derris elliptica BENTH.) untuk Menekan Populasi H. antonii SIGN, Hama Tanaman Perkebunan RESPONSE OF LEMONGRASS CLONES TO ORGANIC FERTILIZER / RESPON KLON SERAI DAPUR TERHADAP PUPUK ORGANIK UNRAVELING ANTI-DIABETIC AND PHARMACOLOGICAL PROPERTIES OF GREEN GEDI, LEILEM, AND SESEWANUA USING A PHARMACOINFORMATICS APPROACH PENGARUH KOMBINASI PERANGKAP HORMON DAN PEMBUNGKUSAN BUAH KAKAO TERHADAP Conopomorpha cramerella Snellen DAN SERANGGA LAIN / Pheromone Trap and Cocoa Pod Wrapping Combination Effect to Conopomorpha cramerella Snellen and Other Insects
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
已复制链接
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
×
扫码分享
扫码分享
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1