Phytophthora capsici'ye dayanıklı bazı biber genotiplerinin SRAP ve SSR belirteçlerle genetik farklılıklarının belirlenmesi

Abstract

Dunyada biber yetistiriciligini sinirlayan en onemli hastaliklardan birisi, kok bogazi yanikligidir. Bazi baska turlerde oldugu gibi Capsicum annuum L. turune ait farkli genotiplerde de etmene karsi dayaniklilik kaynaklari mevcuttur. Dayaniklilik duzeyi farkli biber genotiplerinin genetik iliskilerinin belirlenmesi, dayaniklilik ile ilgili gen/genlerin kultur cesitlerine aktarilmasi acisindan onemlidir. Bu calismada, P. capsici ’ye karsi dayaniklilik duzeyi ve orijini farkli 12 dayanikli ve 4 duyarli biber genotipin filogenetik iliskileri SRAP (Sequence Related Amplified Polymorphism) ve SSR (Simple SequenceRepeat) molekuler belirtecleriyle belirlenmistir. Bunun icin, 144 SRAP primer kombinasyonu ve 27 SSR primer cifti kullanilmistir. Otuz iki SRAP primeri herhangi bir PCR urunu vermemistir. Elli primer kombinasyonunda yalnizca monomorfik DNA banti olusurken 31 primer kombinasyonu polimorfizm saglamis toplam 254 DNA fragmenti elde edilmis, bunlarin, 99’u (%39) monomorfik, 155’i (%61) polimorfik DNAbandi olarak degerlendirilmistir. SRAP belirtecleri ile 16 biber genotipi birbirinden genetik olarak ayrilmistir. SSR primerinin 15’i monomorfik bant olusturmasina karsin 12 SSR primeri ile toplam 36 DNA bandi elde edilmis bunlarin 33'u (%93) polimorfik olmustur. SSR belirtec sistemi ile 16 biber genotipinin bazilari (PM-217 KM2-11, Perennial LS-279, PBC-178, Sera Demre, PBC 179 KMAE-12) birbirinden ayrilamamistir. SRAP ve SSR belirtec verileri birlikte degerlendirildiginde, genotiplerin genetik iliskisi, orijine gore kumelemesi daha bilgi verici olmustur. P. capsici ’ye karsi dayaniklilik genitoru olarak kullanilan CM 334'den, PM 702, Perennial, PM-217, Tayvan'da temin edilen PBC grubu (1364, 1365, 178, 179 ve 413) ile Kahramanmaras biber populasyonundan selekte edilen KM211genotipleri genetik olarak farkli gruplarda yer aldigi belirlenmistir.