Sodyum azid (NaN3) ile muamele edilen arpa mutantlarının genetik çeşitliliğinin ISSR markörler ile belirlenmesi

Abstract

Sodyum azid (NaN3) ozellikle nokta mutasyon calismalarinda yogun olarak kullanilan kimyasal bir mutajendir. Bu calismada, Finola alti sirali arpa cesidi, kimyasal bir mutajen olan sodyum azid ile muamele edilerek 14 adet mutant arpa hatti elde edilmistir. Elde edilen hatlar arasindaki genetik farklilik, 5 adet basit tekrarli diziler arasi polimorfizm (Inter Simple Sequence Repeat, ISSR) markoru yardimiyla belirlenmistir. Elde edilen sonuclara gore 5 ISSR markorunden 24 adet bant elde edilmis ve bu bantlardan 18 adet polimorfik allel belirlenmis ve ortalama polimorfizm orani %76.33 olarak saptanmistir. Ortalama allel sayisi 4.8 olup, 6 bant ile UBC-808 en fazla bant ureten primer olurken, en az bant ureten primerler ise 4’er bant ile UBC-820 ve UBC-825 primerleri olmustur. Kullanilan markorlere ait ortalama polimorfizm bilgi icerigi (PIC) 0.83 olarak hesaplanmis ve PIC degeri 0.78 ile 0.86 araliginda degismistir. Markor verileri dendrogramda 2 ana grup olusturmustur. Birinci kumede Fnl-4, Fnl-8, Fnl-10, Fnl-11 ve Fnl-12 mutantlari yer alirken, ikinci kumede ise Finola cesidi ile birlikte diger mutant hatlar yer almaktadir. Temel bilesenler analizi, Finola cesidi ve mutant hatlardan Fnl-5, Fnl-13 ve Fnl-14 hatlarinin birbirine benzemekle birlikte, bazi alleller bakimindan farkli olduklarini ortaya koymustur.