Functional and positional genomics in beef cattle: current programs and potential progress

J. Hocquette, D. Boichard, I. Cassar-Malek, É. Laville, G. Renand, H. Levéziel, B. Picard
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Abstract

La genomique est une veritable revolution de la biologie aux nombreuses applications potentielles dans toutes les sciences de la vie. Par l'analyse simultanee d'un grand nombre de genes, de proteines et de metabolites, la genomique ouvre de nouvelles perspectives pour de nombreux programmes de recherche dont l'objectif est de mieux maitriser la qualite de la viande bovine (en particulier sa tendrete) par les facteurs genetiques ou physiologiques. En effet, la tendrete est un caractere complexe qui depend de l'interaction entre un grand nombre de genes associes a la matrice conjonctive, aux proprietes contractiles et metaboliques des fibres musculaires et aussi a la proteolyse post-mortem. Le sequencage complet du genome bovin et la disponibilite de puces de genotypage a haut debit favorisent la mise en evidence de marqueurs genetiques de la qualite de la viande et le developpement de la selection assistee par marqueurs et aussi de la selection genomique. De la meme facon, la transcriptomique et la proteomique ont facilite l'etude du developpement du muscle et de l'hypertrophie musculaire de meme que la mise en evidence de nouveaux marqueurs biologiques de la qualite de la viande bovine. Le developpement de la metabolomique est egalement en cours. En raison des progres dans les techniques de genomique, le nouveau front de science est maintenant le developpement du phenotypage a haut debit de meme que celui des approches de modelisation pour mieux predire la qualite de la viande bovine a partir des marqueurs genomiques deja identifies.
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