Iqbal Maulfi Abdillah, Siti Nur Chasanah, Penggalih Mahardika Herlambang
{"title":"POTENSI ZAT NIGELLIN PADA JINTAN HITAM (NIGELLA SATIVA) TERHADAP ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME (ACE2) RECEPTOR SECARA IN SILICO","authors":"Iqbal Maulfi Abdillah, Siti Nur Chasanah, Penggalih Mahardika Herlambang","doi":"10.31942/mj.v1i1.21","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"SARS-COV-2 merupakan virus baru yang menyebabkan penyakit Corona Virus 2019 (COVID-19) dan menyebabkan krisis di berbagai sektor tak terkecuali kesehatan di dunia. Para peneliti telah mengungkap ACE-2 receptor merupakan pintu masuk virus ini sebelum replikasi. Nigella sativa memiliki banyak khasiat yang telah di kemukakan di berbagai literatur di antaranya antivirus, bronkodilator, antiinflamasi, antikoagulan, imunomodulator, antihistamin, antitusif, antioksidan, antipiretik dan aktivitas analgesik. Senyawa dari Nigella sativa diambil dari protein data bank dengan kode PDB 2NB2 sedangkan ACE 2 receptor dengan kode PDB 6VW1 yang telah di preparasi. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh Nigellin sebagai zat aktif dari Nigella sativa terhadap ACE-2 reseptor. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental secara in silico. Aplikasi yang digunakan adalah PyMOL untuk preparasi ligan, PyRx untuk docking, dan LigPlot untuk analisis residu asam amino. Untuk mengetahui interaksi ikatan dengan menggunakan parameter binding affinity score, hasil menunjukkan semakin kecil binding affinity score maka semakin berpotensi antara ligan-receptor untuk berinteraksi dan di dapatkan binding affinity score -17,4. Terdapat potensi dari Nigellin dengan ACE-2 reseptor. \n ","PeriodicalId":356029,"journal":{"name":"Medicomplementary Journal","volume":"5 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-01-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Medicomplementary Journal","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.31942/mj.v1i1.21","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
POTENSI ZAT NIGELLIN PADA JINTAN HITAM (NIGELLA SATIVA) TERHADAP ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME (ACE2) RECEPTOR SECARA IN SILICO
SARS-COV-2 merupakan virus baru yang menyebabkan penyakit Corona Virus 2019 (COVID-19) dan menyebabkan krisis di berbagai sektor tak terkecuali kesehatan di dunia. Para peneliti telah mengungkap ACE-2 receptor merupakan pintu masuk virus ini sebelum replikasi. Nigella sativa memiliki banyak khasiat yang telah di kemukakan di berbagai literatur di antaranya antivirus, bronkodilator, antiinflamasi, antikoagulan, imunomodulator, antihistamin, antitusif, antioksidan, antipiretik dan aktivitas analgesik. Senyawa dari Nigella sativa diambil dari protein data bank dengan kode PDB 2NB2 sedangkan ACE 2 receptor dengan kode PDB 6VW1 yang telah di preparasi. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh Nigellin sebagai zat aktif dari Nigella sativa terhadap ACE-2 reseptor. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental secara in silico. Aplikasi yang digunakan adalah PyMOL untuk preparasi ligan, PyRx untuk docking, dan LigPlot untuk analisis residu asam amino. Untuk mengetahui interaksi ikatan dengan menggunakan parameter binding affinity score, hasil menunjukkan semakin kecil binding affinity score maka semakin berpotensi antara ligan-receptor untuk berinteraksi dan di dapatkan binding affinity score -17,4. Terdapat potensi dari Nigellin dengan ACE-2 reseptor.