Олена О. Пилипенко, Олексій Ю. Воскобойнік, Людмила К. Святенко, Сергій І. Коваленко, Сергій І. Оковитий
{"title":"SESESESE2-(3-R-1-3-R-1,2,2,4-三唑-5-基-5-基)任何宁宁宁宁","authors":"Олена О. Пилипенко, Олексій Ю. Воскобойнік, Людмила К. Святенко, Сергій І. Коваленко, Сергій І. Оковитий","doi":"10.15421/jchemtech.v31i2.284813","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Дана робота присвячена in silico дослідженню 2-(3-R-1H-1,2,4-триазол-5-іл)анілінів як потенційних інгібіторів EGFR (pецептор епідермального фактора росту) та RET (перебудований під час трансфекції), які відіграють значну роль у регуляції фізіологічного циклу недрібноклітинного раку легень. Для дослідження було використано загальноприйняту програму для проведення молекулярного докінгу AutoDock Vina. Сім досліджуваних сполук та два стандартних препарати (вандетаніб та гефітиніб) були зістиковані з кристалографічними структурами білків EGFR та RET. Встановлено, що серед нових досліджуваних речовин найбільшу аффіність до EGFR та RET має 2-(3-(індоліл-2)-1H-1,2,4-триазол-5-іл)анілін (а5) з найвищою енергією зв'язування -9.7 та -8.7 ккал/моль, відповідно. Візуалізація молекулярного докінгу зазначеної сполуки з використанням програми Discovery Studio показала, що для неї характерне подібне до стандартних лігандів розміщення у активних центрах ензимів, стабільні водневі зв'язки та π-стекінгові взаємодії, які забезпечуються наявністю у молекулі індольного та анілінового фрагментів. Отже, нами виявлено новий ефективний ліганд, який можна використовувати як «базову» молекулу для подальшого фрагмент-орієнтованого дизайну з використанням методології молекулярної гібридизації (методи злиття, з’єднання або нарощування фрагментів) або структурної модифікації шляхом введення «фармакофорних» груп до молекули. Підсумовуючи наведені вище результати скринінгу, можна сказати, що 2-(3-R-1H-1,2,4-триазол-5-іл)аніліни потребують подальшого детального вивчення з точки зору ефективних інгібіторів тирозинкіназ для пошуку перспективних протипухлинних агентів для лікування недрібноклітинного раку легень.","PeriodicalId":41282,"journal":{"name":"Journal of Chemistry and Technologies","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.5000,"publicationDate":"2023-07-25","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"ПОШУК НОВИХ ІНГІБІТОРІВ ТИРОЗИНКІНАЗИ СЕРЕД 2-(3-R-1H-1,2,4-ТРИАЗОЛ-5-ІЛ)АНІЛІНІВ ЯК ПОТЕНЦІЙНИХ ПРОТИПУХЛИННИХ АГЕНТІВ З ВИКОРИСТАННЯМ МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКІНГУ\",\"authors\":\"Олена О. Пилипенко, Олексій Ю. Воскобойнік, Людмила К. Святенко, Сергій І. Коваленко, Сергій І. Оковитий\",\"doi\":\"10.15421/jchemtech.v31i2.284813\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Дана робота присвячена in silico дослідженню 2-(3-R-1H-1,2,4-триазол-5-іл)анілінів як потенційних інгібіторів EGFR (pецептор епідермального фактора росту) та RET (перебудований під час трансфекції), які відіграють значну роль у регуляції фізіологічного циклу недрібноклітинного раку легень. Для дослідження було використано загальноприйняту програму для проведення молекулярного докінгу AutoDock Vina. Сім досліджуваних сполук та два стандартних препарати (вандетаніб та гефітиніб) були зістиковані з кристалографічними структурами білків EGFR та RET. Встановлено, що серед нових досліджуваних речовин найбільшу аффіність до EGFR та RET має 2-(3-(індоліл-2)-1H-1,2,4-триазол-5-іл)анілін (а5) з найвищою енергією зв'язування -9.7 та -8.7 ккал/моль, відповідно. Візуалізація молекулярного докінгу зазначеної сполуки з використанням програми Discovery Studio показала, що для неї характерне подібне до стандартних лігандів розміщення у активних центрах ензимів, стабільні водневі зв'язки та π-стекінгові взаємодії, які забезпечуються наявністю у молекулі індольного та анілінового фрагментів. Отже, нами виявлено новий ефективний ліганд, який можна використовувати як «базову» молекулу для подальшого фрагмент-орієнтованого дизайну з використанням методології молекулярної гібридизації (методи злиття, з’єднання або нарощування фрагментів) або структурної модифікації шляхом введення «фармакофорних» груп до молекули. Підсумовуючи наведені вище результати скринінгу, можна сказати, що 2-(3-R-1H-1,2,4-триазол-5-іл)аніліни потребують подальшого детального вивчення з точки зору ефективних інгібіторів тирозинкіназ для пошуку перспективних протипухлинних агентів для лікування недрібноклітинного раку легень.\",\"PeriodicalId\":41282,\"journal\":{\"name\":\"Journal of Chemistry and Technologies\",\"volume\":\" \",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.5000,\"publicationDate\":\"2023-07-25\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Journal of Chemistry and Technologies\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.15421/jchemtech.v31i2.284813\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"Q4\",\"JCRName\":\"CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Journal of Chemistry and Technologies","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.15421/jchemtech.v31i2.284813","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY","Score":null,"Total":0}
ПОШУК НОВИХ ІНГІБІТОРІВ ТИРОЗИНКІНАЗИ СЕРЕД 2-(3-R-1H-1,2,4-ТРИАЗОЛ-5-ІЛ)АНІЛІНІВ ЯК ПОТЕНЦІЙНИХ ПРОТИПУХЛИННИХ АГЕНТІВ З ВИКОРИСТАННЯМ МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКІНГУ
Дана робота присвячена in silico дослідженню 2-(3-R-1H-1,2,4-триазол-5-іл)анілінів як потенційних інгібіторів EGFR (pецептор епідермального фактора росту) та RET (перебудований під час трансфекції), які відіграють значну роль у регуляції фізіологічного циклу недрібноклітинного раку легень. Для дослідження було використано загальноприйняту програму для проведення молекулярного докінгу AutoDock Vina. Сім досліджуваних сполук та два стандартних препарати (вандетаніб та гефітиніб) були зістиковані з кристалографічними структурами білків EGFR та RET. Встановлено, що серед нових досліджуваних речовин найбільшу аффіність до EGFR та RET має 2-(3-(індоліл-2)-1H-1,2,4-триазол-5-іл)анілін (а5) з найвищою енергією зв'язування -9.7 та -8.7 ккал/моль, відповідно. Візуалізація молекулярного докінгу зазначеної сполуки з використанням програми Discovery Studio показала, що для неї характерне подібне до стандартних лігандів розміщення у активних центрах ензимів, стабільні водневі зв'язки та π-стекінгові взаємодії, які забезпечуються наявністю у молекулі індольного та анілінового фрагментів. Отже, нами виявлено новий ефективний ліганд, який можна використовувати як «базову» молекулу для подальшого фрагмент-орієнтованого дизайну з використанням методології молекулярної гібридизації (методи злиття, з’єднання або нарощування фрагментів) або структурної модифікації шляхом введення «фармакофорних» груп до молекули. Підсумовуючи наведені вище результати скринінгу, можна сказати, що 2-(3-R-1H-1,2,4-триазол-5-іл)аніліни потребують подальшого детального вивчення з точки зору ефективних інгібіторів тирозинкіназ для пошуку перспективних протипухлинних агентів для лікування недрібноклітинного раку легень.