Background Researches have revealed a connection between CAD (coronary artery disease) and genetics, with various biochemical tests established to evaluate its severity. The incorporation of bioinformatics has advanced biomedical research and improved data management efficiency. The current study's objective was to identify risk factors in terms of Single Nucleotide Polymorphisms, associated with CAD in an Indian Asian population, utilizing a combined approach Methods The present study was completed in two phases: First phase was a literature search for susceptible SNPs and Second comprised of a cross sectional study. In first phase, using bioinformatic techniques like PubMed parser and Natural Language Processing (NLP) and manual search, we tried to find out susceptible polymorphisms to CAD. In second step, Global Screening Array (GSA) (Illumina) was performed in extracted DNA samples of 97cases and 36 controls. Different biochemical tests like Hemogram, Lipids, Fasting Blood Sugar (FBS), LFT, KFT, Vitamin D and HbA1C were also done as per standard protocol. Results In literature search from 134 studies conducted across several continents and various populations with more a million cases and controls, we could retrieve a comprehensive dataset of 261 susceptible SNPs with pooled Odd’s ratio of 1.196. On observing 261susceptible SNPs in our GSA results, we could find 5 SNPs with significant p value including rs187238 of IL-18 gene at chromosome 11, rs731236 and rs2228570 of VDR gene at chromosome 12, rs11556218 of gene IL16 at chromosome 15 and rs5882 of CETP gene at chromosome 16. The earlier studies had reported association of these with several disease conditions and for CAD, pathways related to endothelial damage, susceptibility of vitamin D receptor (VDR) polymorphisms and lowering HDL-cholesterol and ultimately causing CAD. But among Indian population, all only rs5882 has been studied in CAD cases and that too has not shown any association. The polymorphisms regarding VDR gene are also novel in Indian population, further biochemical co-relation done in both cases and controls revealed more percentage of Vitamin D deficient in healthy controls. Conclusion To conclude, a set of 261 susceptible SNPs for CAD was gathered and out of which association of 5 SNPs in the Indian Asian population was observed. Further, this pool can be validated in different ethnic groups and may provide a valuable screening tool to separate the vulnerable high-risk population where primary prevention strategies can be implemented. We could find, the Vitamin D deficiency may be key reason for developing the disease and further, an alarming condition for seemingly healthy population.
{"title":"Multi analytical approach to find out the risk factors in terms of single nucleotide polymorphisms in patients with coronary artery disease in Indian Asian Population","authors":"Pamila Dua, Kh Reeta, Bhawana Prasher, Sandeep Seth, S. Maulik, Mitali Mukerji, Sangeeta Khanna, Archana Vats","doi":"10.58354/jvc.104s.2023.801","DOIUrl":"https://doi.org/10.58354/jvc.104s.2023.801","url":null,"abstract":"Background \u0000Researches have revealed a connection between CAD (coronary artery disease) and genetics, with various biochemical tests established to evaluate its severity. The incorporation of bioinformatics has advanced biomedical research and improved data management efficiency. The current study's objective was to identify risk factors in terms of Single Nucleotide Polymorphisms, associated with CAD in an Indian Asian population, utilizing a combined approach \u0000Methods \u0000The present study was completed in two phases: First phase was a literature search for susceptible SNPs and Second comprised of a cross sectional study. In first phase, using bioinformatic techniques like PubMed parser and Natural Language Processing (NLP) and manual search, we tried to find out susceptible polymorphisms to CAD. In second step, Global Screening Array (GSA) (Illumina) was performed in extracted DNA samples of 97cases and 36 controls. Different biochemical tests like Hemogram, Lipids, Fasting Blood Sugar (FBS), LFT, KFT, Vitamin D and HbA1C were also done as per standard protocol. \u0000Results \u0000In literature search from 134 studies conducted across several continents and various populations with more a million cases and controls, we could retrieve a comprehensive dataset of 261 susceptible SNPs with pooled Odd’s ratio of 1.196. \u0000On observing 261susceptible SNPs in our GSA results, we could find 5 SNPs with significant p value including rs187238 of IL-18 gene at chromosome 11, rs731236 and rs2228570 of VDR gene at chromosome 12, rs11556218 of gene IL16 at chromosome 15 and rs5882 of CETP gene at chromosome 16. The earlier studies had reported association of these with several disease conditions and for CAD, pathways related to endothelial damage, susceptibility of vitamin D receptor (VDR) polymorphisms and lowering HDL-cholesterol and ultimately causing CAD. But among Indian population, all only rs5882 has been studied in CAD cases and that too has not shown any association. The polymorphisms regarding VDR gene are also novel in Indian population, further biochemical co-relation done in both cases and controls revealed more percentage of Vitamin D deficient in healthy controls. \u0000Conclusion \u0000To conclude, a set of 261 susceptible SNPs for CAD was gathered and out of which association of 5 SNPs in the Indian Asian population was observed. Further, this pool can be validated in different ethnic groups and may provide a valuable screening tool to separate the vulnerable high-risk population where primary prevention strategies can be implemented. We could find, the Vitamin D deficiency may be key reason for developing the disease and further, an alarming condition for seemingly healthy population.","PeriodicalId":514885,"journal":{"name":"Tạp chí Tim mạch học Việt Nam","volume":"9 3","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-04-08","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140729107","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Suy tim là vấn đề sức khỏe toàn cầu gây ảnh hưởng đến hơn 64 triệu người và là nguyên nhân hàng đầu khiến bệnh nhân phải nhập viện tại Hoa Kì và châu Âu. Nếu như trước đây, suy tim thường được coi là vùng đất khô cằn của tim mạch với tiên lượng tồi ngang với một số bệnh ung thư. Nhưng chỉ trong vài năm trở về đây, với những bước tiến lớn như sự ra đời của các thuốc mới và dụng cụ hỗ trợ tim đã giúp tạo nên một cuộc cách mạng trong lĩnh vực điều trị suy tim. Năm 2023, mặc dù số lượng các nghiên cứu “bom tấn” đã bắt đầu có xu hướng giảm sút nhưng bù lại, có nhiều tiến bộ khác trong tim mạch có liên quan đến suy tim.
{"title":"Những cập nhật về điều trị suy tim năm 2023","authors":"Tuấn Đạt Phan, Phi Điệp Hoàng, Ngọc Quang Nguyễn, Mạnh Hùng Phạm, Doãn Lợi Đỗ","doi":"10.58354/jvc.107s(1).2024.763","DOIUrl":"https://doi.org/10.58354/jvc.107s(1).2024.763","url":null,"abstract":"Suy tim là vấn đề sức khỏe toàn cầu gây ảnh hưởng đến hơn 64 triệu người và là nguyên nhân hàng đầu khiến bệnh nhân phải nhập viện tại Hoa Kì và châu Âu. Nếu như trước đây, suy tim thường được coi là vùng đất khô cằn của tim mạch với tiên lượng tồi ngang với một số bệnh ung thư. Nhưng chỉ trong vài năm trở về đây, với những bước tiến lớn như sự ra đời của các thuốc mới và dụng cụ hỗ trợ tim đã giúp tạo nên một cuộc cách mạng trong lĩnh vực điều trị suy tim. Năm 2023, mặc dù số lượng các nghiên cứu “bom tấn” đã bắt đầu có xu hướng giảm sút nhưng bù lại, có nhiều tiến bộ khác trong tim mạch có liên quan đến suy tim.","PeriodicalId":514885,"journal":{"name":"Tạp chí Tim mạch học Việt Nam","volume":"69 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-01-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139611428","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2024-01-20DOI: 10.58354/jvc.107s(1).2024.764
Đức Hạnh Văn, Thị Huyền Diệu Bùi, Thị Diệu Thùy Trương, Vĩnh Hà Bùi, Mạnh Hùng Phạm, L. Nguyễn
Phân tầng nguy cơ bệnh lý tim mạch giúp bác sĩ thực hành lâm sàng đưa ra các mục tiêu điều trị cụ thể cho từng cá thể người bệnh. Cập nhật nguy cơ bệnh lý tim mạch do xơ vữa trong vòng 10 năm cho người bệnh đái tháo đường typ 2 và nguy cơ bệnh lý tim mạch toàn bộ trong vòng 10 năm và 30 năm thông qua thang điểm SCORE2-Diabetes và công cụ PREVENT hứa hẹn giúp ích nhiều trong sàng lọc, đánh giá nguy cơ, xác định mức độ bệnh lý tim mạch cũng như đưa ra các biện pháp dự phòng và điều trị. Việc thiếu các bằng chứng chứng minh hiệu quả trong cải thiện biến cố tim mạch đặc biệt là đột quỵ của thuốc chẹn beta giao cảm đòi hỏi việc sử dụng thuốc này cần tuân theo các hướng dẫn điều trị hiện hành để mang lại hiệu quả tốt nhất cho người bệnh tăng huyết áp. Nhiều khía cạnh trong dự phòng bệnh tim mạch đặc biệt là lĩnh vực điều trị rối loạn lipid máu có các nghiên cứu có giá trị được báo cáo trong năm 2023 là tiền đề để có chiến lược hiệu quả hơn trong cải thiện biến cố tim mạch trong các năm tiếp theo.
您可以在您的网站上选择您需要的时间。2 型糖尿病患者在 10 到 30 个月内会被诊断为 SCORE2-。Diabetes và công cụ PREVENT hứa hẹn giúp ích nhiều trong sàng lọn phương、在这里,您会发现,它是一个非常实用的工具,它可以帮助您提高您的生活质量。您的意思是,如果您在您的電腦上安裝了這個功能,您就可以在您的電腦上使用它。您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站,您可以在此向您的朋友們介紹我們的網站。通过汉字可以了解脂质的性质。从 2023 年到现在,我们一直在努力。
{"title":"Một số điểm nổi bật trong lĩnh vực dự phòng bệnh lý tim mạch năm 2023","authors":"Đức Hạnh Văn, Thị Huyền Diệu Bùi, Thị Diệu Thùy Trương, Vĩnh Hà Bùi, Mạnh Hùng Phạm, L. Nguyễn","doi":"10.58354/jvc.107s(1).2024.764","DOIUrl":"https://doi.org/10.58354/jvc.107s(1).2024.764","url":null,"abstract":"Phân tầng nguy cơ bệnh lý tim mạch giúp bác sĩ thực hành lâm sàng đưa ra các mục tiêu điều trị cụ thể cho từng cá thể người bệnh. Cập nhật nguy cơ bệnh lý tim mạch do xơ vữa trong vòng 10 năm cho người bệnh đái tháo đường typ 2 và nguy cơ bệnh lý tim mạch toàn bộ trong vòng 10 năm và 30 năm thông qua thang điểm SCORE2-Diabetes và công cụ PREVENT hứa hẹn giúp ích nhiều trong sàng lọc, đánh giá nguy cơ, xác định mức độ bệnh lý tim mạch cũng như đưa ra các biện pháp dự phòng và điều trị. Việc thiếu các bằng chứng chứng minh hiệu quả trong cải thiện biến cố tim mạch đặc biệt là đột quỵ của thuốc chẹn beta giao cảm đòi hỏi việc sử dụng thuốc này cần tuân theo các hướng dẫn điều trị hiện hành để mang lại hiệu quả tốt nhất cho người bệnh tăng huyết áp. Nhiều khía cạnh trong dự phòng bệnh tim mạch đặc biệt là lĩnh vực điều trị rối loạn lipid máu có các nghiên cứu có giá trị được báo cáo trong năm 2023 là tiền đề để có chiến lược hiệu quả hơn trong cải thiện biến cố tim mạch trong các năm tiếp theo.","PeriodicalId":514885,"journal":{"name":"Tạp chí Tim mạch học Việt Nam","volume":"35 16","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-01-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139610326","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}