Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.231153
M. Souza, L. M. Magny, F. C. Guedes, C. Silveira
A pandemia de COVID-19 deixou evidente a alta demanda por sistemas computacionais que agilizem a indicação de novos fármacos. Nesse sentido, compreender o comportamento dinâmico de complexos biomoleculares é algo fundamental. No entanto, a preparação de tais simulações é de grande complexidade, e seus inúmeros detalhes nem sempre são suficientemente destacados, comprometendo sua reprodutibilidade. Propõe-se aqui a ferramenta web ProtCool – um gerador de protocolos, focado na integração entre ancoragem e dinâmica molecular de complexos proteína-ligantes. Será demonstrado seu uso na simulação da interação entre acetilcolinesterase e galantamina, usada no tratamento do Alzheimer.
{"title":"ProtCool 2.0: um gerador de protocolo para ancoragem e simulações de dinâmica molecular em complexos proteína-ligante em versão web","authors":"M. Souza, L. M. Magny, F. C. Guedes, C. Silveira","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.231153","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.231153","url":null,"abstract":"A pandemia de COVID-19 deixou evidente a alta demanda por sistemas computacionais que agilizem a indicação de novos fármacos. Nesse sentido, compreender o comportamento dinâmico de complexos biomoleculares é algo fundamental. No entanto, a preparação de tais simulações é de grande complexidade, e seus inúmeros detalhes nem sempre são suficientemente destacados, comprometendo sua reprodutibilidade. Propõe-se aqui a ferramenta web ProtCool – um gerador de protocolos, focado na integração entre ancoragem e dinâmica molecular de complexos proteína-ligantes. Será demonstrado seu uso na simulação da interação entre acetilcolinesterase e galantamina, usada no tratamento do Alzheimer.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"28 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"116808255","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.229818
Daniela Fernandes do Nascimento, C. Souza, L. Berretta, S. T. Carvalho
A reabilitação é um processo que visa recuperar as funções motoras de pacientes. O acompanhamento de um profissional de saúde e a constância do paciente são cruciais para o sucesso do tratamento. Para melhorar esse processo, jogos sérios podem ser integrados às atividades de reabilitação. Neste sentido, foi desenvolvido o jogo digital CicloExergame, em que o paciente deve pedalar em um cicloergômetro, desviando de obstáculos e coletando moedas, enquanto dados fisiológicos são capturados e apresentados. O objetivo deste trabalho é avaliar o CicloExergame quanto às suas funcionalidades de comunicação, junto a especialistas (fisioterapeutas), por meio do método Delphi, e voluntários em ambiente controlado. Os testes e avaliações demonstram a eficácia do CicloExergame para a telerreabilitação de pacientes.
{"title":"Avaliação de um Exergame para a Telerreabilitação de Pacientes","authors":"Daniela Fernandes do Nascimento, C. Souza, L. Berretta, S. T. Carvalho","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.229818","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.229818","url":null,"abstract":"A reabilitação é um processo que visa recuperar as funções motoras de pacientes. O acompanhamento de um profissional de saúde e a constância do paciente são cruciais para o sucesso do tratamento. Para melhorar esse processo, jogos sérios podem ser integrados às atividades de reabilitação. Neste sentido, foi desenvolvido o jogo digital CicloExergame, em que o paciente deve pedalar em um cicloergômetro, desviando de obstáculos e coletando moedas, enquanto dados fisiológicos são capturados e apresentados. O objetivo deste trabalho é avaliar o CicloExergame quanto às suas funcionalidades de comunicação, junto a especialistas (fisioterapeutas), por meio do método Delphi, e voluntários em ambiente controlado. Os testes e avaliações demonstram a eficácia do CicloExergame para a telerreabilitação de pacientes.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"20 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"114650312","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.230162
J. Pereira, Thaís de Jesus Soares, R. S. Oliveira, Joventino Oliveira Campos, R. W. D. Santos
O estudo eletrofisiológico cardíaco é um procedimento que investiga os riscos de arritmia cardíaca em pacientes cardiopatas. Um aspecto crucial deste é o protocolo de estimulação elétrica programada, o qual, neste estudo, foi simulado em dois cenários distintos: tecido cardíaco saudável e tecido cardíaco com fibrose. Os resultados obtidos indicam que o protocolo de estimulação induziu arritmia cardíaca apenas no cenário com fibrose. Isso é consistente com o relatado na literatura médica e demonstra que o emprego de modelos relativos ao protocolo de estimulação é um passo significativo no desenvolvimento de gêmeos digitais para auxiliar na estratificação do risco de arritmia cardíaca.
{"title":"Simulação de Protocolo de Estudo Eletrofisiológico com Foco na Avaliação da Indução de Arritmias Cardíacas","authors":"J. Pereira, Thaís de Jesus Soares, R. S. Oliveira, Joventino Oliveira Campos, R. W. D. Santos","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.230162","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.230162","url":null,"abstract":"O estudo eletrofisiológico cardíaco é um procedimento que investiga os riscos de arritmia cardíaca em pacientes cardiopatas. Um aspecto crucial deste é o protocolo de estimulação elétrica programada, o qual, neste estudo, foi simulado em dois cenários distintos: tecido cardíaco saudável e tecido cardíaco com fibrose. Os resultados obtidos indicam que o protocolo de estimulação induziu arritmia cardíaca apenas no cenário com fibrose. Isso é consistente com o relatado na literatura médica e demonstra que o emprego de modelos relativos ao protocolo de estimulação é um passo significativo no desenvolvimento de gêmeos digitais para auxiliar na estratificação do risco de arritmia cardíaca.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"135 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"131631036","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.229937
Ricardo B. Lima Filho, M. Carneiro
Este trabalho investiga técnicas de classificação de alto nível baseadas em propriedades e medidas de redes complexas para a detecção salivar de câncer de boca a partir da Reflectância Total Atenuada por Espectroscopia de Infravermelho por Transformada de Fourier (ATR-FTIR). ATR-FTIR é uma plataforma sustentável, rápida e não invasiva capaz de contribuir para a detecção de diversas doenças. Dentre as diversas medidas de rede avaliadas neste estudo, nossos resultados indicam o coeficiente de agrupamento como o mais satisfatório com 71% e 81% de acurácia e sensibilidade respectivamente. Além disso, a técnica de alto nível superou vários outros classificadores usados para análise espectral, incluindo os de última geração, como máquina de vetores de suporte e redes neurais convolucionais.
{"title":"Diagnóstico do câncer oral através da classificação de alto nível","authors":"Ricardo B. Lima Filho, M. Carneiro","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.229937","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.229937","url":null,"abstract":"Este trabalho investiga técnicas de classificação de alto nível baseadas em propriedades e medidas de redes complexas para a detecção salivar de câncer de boca a partir da Reflectância Total Atenuada por Espectroscopia de Infravermelho por Transformada de Fourier (ATR-FTIR). ATR-FTIR é uma plataforma sustentável, rápida e não invasiva capaz de contribuir para a detecção de diversas doenças. Dentre as diversas medidas de rede avaliadas neste estudo, nossos resultados indicam o coeficiente de agrupamento como o mais satisfatório com 71% e 81% de acurácia e sensibilidade respectivamente. Além disso, a técnica de alto nível superou vários outros classificadores usados para análise espectral, incluindo os de última geração, como máquina de vetores de suporte e redes neurais convolucionais.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"7 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"133060433","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.231515
Raphael Silva Fontes, Methanias Colaço Júnior, Helder Prado, Ana Nely, J. Araújo, J. Paiva, R. Valentim
Contexto: Apesar do avanço da tecnologia, muitos processos, especialmente no setor público, ainda necessitam de buscas manuais ou não inteligentes, para construção de conhecimento. Para as auditorias do Ministério da Saúde e do Sistema Único de Saúde (SUS), as diversas fontes de pesquisa a serem exploradas provocam demora e altos custos. Objetivo: Avaliar preliminarmente uma ferramenta, baseada em recuperação de conteúdo textual, o Sussurro, para coletar e apresentar as diversas matérias relacionadas à saúde pública, as quais podem nortear auditorias. Método: Prova de conceito do Sussurro. Resultados: Entre mais de 2 milhões de registros de matérias, 56.053 foram classificadas como indícios para auditoria em saúde. Conclusão: O Sussurro otimiza a seleção de conteúdo necessário para executar uma auditoria, beneficiando a investigação e o combate à corrupção na área de saúde.
{"title":"Sussurro - Detecção na Web de eventos auditáveis que representam riscos à saúde pública","authors":"Raphael Silva Fontes, Methanias Colaço Júnior, Helder Prado, Ana Nely, J. Araújo, J. Paiva, R. Valentim","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.231515","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.231515","url":null,"abstract":"Contexto: Apesar do avanço da tecnologia, muitos processos, especialmente no setor público, ainda necessitam de buscas manuais ou não inteligentes, para construção de conhecimento. Para as auditorias do Ministério da Saúde e do Sistema Único de Saúde (SUS), as diversas fontes de pesquisa a serem exploradas provocam demora e altos custos. Objetivo: Avaliar preliminarmente uma ferramenta, baseada em recuperação de conteúdo textual, o Sussurro, para coletar e apresentar as diversas matérias relacionadas à saúde pública, as quais podem nortear auditorias. Método: Prova de conceito do Sussurro. Resultados: Entre mais de 2 milhões de registros de matérias, 56.053 foram classificadas como indícios para auditoria em saúde. Conclusão: O Sussurro otimiza a seleção de conteúdo necessário para executar uma auditoria, beneficiando a investigação e o combate à corrupção na área de saúde.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"120 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"128042202","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.31414/ee.2023.d.131608
L. Carlini
Recém-nascidos (RNs) em estado crítico ou prematuros passam diariamente por inúmeros procedimentos dolorosos, necessitando avaliação contínua da dor. No entanto, resultados recentes evidenciaram a subjetividade dos métodos aplicados por profissionais de saúde. Neste contexto, este trabalho aplica modelos computacionais para compreender de maneira específica a dor expressa por RNs, comparando as características faciais relevantes para a máquina com as regiões observadas por Médicos e Pais de RN durante avaliação da dor. Os resultados obtidos mostraram que as regiões relevantes para os modelos computacionais são clinicamente importantes e, em partes, concordam com a percepção facial humana.
{"title":"Human vs machine towards neonatal pain assessment: a comparison of the facial features extracted by adults and convolutional neural networks","authors":"L. Carlini","doi":"10.31414/ee.2023.d.131608","DOIUrl":"https://doi.org/10.31414/ee.2023.d.131608","url":null,"abstract":"Recém-nascidos (RNs) em estado crítico ou prematuros passam diariamente por inúmeros procedimentos dolorosos, necessitando avaliação contínua da dor. No entanto, resultados recentes evidenciaram a subjetividade dos métodos aplicados por profissionais de saúde. Neste contexto, este trabalho aplica modelos computacionais para compreender de maneira específica a dor expressa por RNs, comparando as características faciais relevantes para a máquina com as regiões observadas por Médicos e Pais de RN durante avaliação da dor. Os resultados obtidos mostraram que as regiões relevantes para os modelos computacionais são clinicamente importantes e, em partes, concordam com a percepção facial humana.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"14 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"117056338","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.230145
Jessica Cristina Santos do Nascimento, Italo Francyles Santos da Silva, A. Silva, A. Paiva
This document presents a deep learning method for the automatic detection and classification of calcified lesions in coronary arteries using Convolutional Neural Networks (CNN) based on the AlexNet architecture. The demonstration of this proposal uses orCaScore, a standardized and labeled database of low-dose radiation computed tomography (CT) images of the heart. The methodology division was designed starting with the region of interest (ROI) extraction for consecutively utilizing a patch-based approach. We tested this approach in 7,386 patches and achieved an accuracy of 67%, sensitivity of 100%, precision of 67% and specificity of 75%. Our technique aims to reinforce the detection and quantification of coronary calcified lesions, enabling accurate diagnosis and treatment of cardiovascular diseases.
{"title":"Classification of Coronary Calcifications using Deep Learning Approach: A Feasibility Study with the orCaScore Database","authors":"Jessica Cristina Santos do Nascimento, Italo Francyles Santos da Silva, A. Silva, A. Paiva","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.230145","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.230145","url":null,"abstract":"This document presents a deep learning method for the automatic detection and classification of calcified lesions in coronary arteries using Convolutional Neural Networks (CNN) based on the AlexNet architecture. The demonstration of this proposal uses orCaScore, a standardized and labeled database of low-dose radiation computed tomography (CT) images of the heart. The methodology division was designed starting with the region of interest (ROI) extraction for consecutively utilizing a patch-based approach. We tested this approach in 7,386 patches and achieved an accuracy of 67%, sensitivity of 100%, precision of 67% and specificity of 75%. Our technique aims to reinforce the detection and quantification of coronary calcified lesions, enabling accurate diagnosis and treatment of cardiovascular diseases.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"35 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"115853413","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.230385
Davi Bernardo Santos de Paula, P. Vasconcelos, T. Sirqueira
No atual cenário pós-pandemia em que vivemos, viu-se uma fragilidade nos sistemas de doação de sangue, cujo muitos estão passando por dificuldades para levantar estoques sanguíneos e com frequência notamos campanhas de doação. Diante disto, propõe-se um sistema para incentivar e fidelizar os doadores de sangue na região sul-fluminense. Através dos recursos de gamificação, buscou-se maximizar o número de doadores, para, consequentemente, aumentar o número de doações e elevar o estoque sanguíneo. Além da gamificação, o aplicativo apresenta os pontos de coletas e as informações importes que os potenciais doadores precisam saber antes de doar. Como resultado, visamos melhorar o engajamento entre os doadores.
{"title":"Incentivando e Fidelizando Doadores De Sangue na Região Sul-Fluminense","authors":"Davi Bernardo Santos de Paula, P. Vasconcelos, T. Sirqueira","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.230385","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.230385","url":null,"abstract":"No atual cenário pós-pandemia em que vivemos, viu-se uma fragilidade nos sistemas de doação de sangue, cujo muitos estão passando por dificuldades para levantar estoques sanguíneos e com frequência notamos campanhas de doação. Diante disto, propõe-se um sistema para incentivar e fidelizar os doadores de sangue na região sul-fluminense. Através dos recursos de gamificação, buscou-se maximizar o número de doadores, para, consequentemente, aumentar o número de doações e elevar o estoque sanguíneo. Além da gamificação, o aplicativo apresenta os pontos de coletas e as informações importes que os potenciais doadores precisam saber antes de doar. Como resultado, visamos melhorar o engajamento entre os doadores.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"29 5","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132653975","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.14393/ufu.di.2022.571
Elias Silva
O design de peptídeos capazes de inibir a infecção viral tem sido considerado uma das estratégias potenciais para reduzir a transmissão do SARS-CoV-2. No entanto, a questão crítica para o design de peptídeos é o grande espaço de busca, o que torna inviável avaliar todas as possibilidades. Além disso, a maioria das análises relacionadas adota docking molecular in silico para selecionar potenciais peptídeos, que é uma técnica demorada e altamente dependente da estrutura molecular dos peptídeos já conhecidos e da proteína alvo. Com o objetivo de auxiliar na avaliação, descoberta e seleção de peptídeos para cálculo de docking, desenvolvemos o SAGAPEP, um framework de Algoritmo Genético Assistido por Surrogate capaz de encontrar peptídeos com potencial para bloquear a proteína Spike do SARS-CoV-2. O modelo surrogate é usado para avaliação rápida e de alta fidelidade da energia de interação entre um peptídeo e a proteína Spike, enquanto o algoritmo genético busca descobrir e selecionar peptídeos de alto potencial inspirados em princípios de genética e seleção natural. Os experimentos foram conduzidos usando um conjunto de dados composto por vários peptídeos potenciais obtidos por meio de docking molecular por especialistas em bioinformática. Como principais resultados, o SAGAPEP obteve baixas previsões de erro de seu componente surrogate treinado sobre esse conjunto de dados e foi capaz de descobrir e selecionar peptídeos com melhor energia de ligação do que todos listados no conjunto de dados. Além disso, os resultados notáveis do SAGAPEP sugerem que ele também pode ter o potencial de fornecer resultados promissores para outros problemas de design de peptídeos.
{"title":"Algoritmo genético assistido por surrogate para avaliar e descobrir peptídeos contra o SARS-CoV-2","authors":"Elias Silva","doi":"10.14393/ufu.di.2022.571","DOIUrl":"https://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.571","url":null,"abstract":"O design de peptídeos capazes de inibir a infecção viral tem sido considerado uma das estratégias potenciais para reduzir a transmissão do SARS-CoV-2. No entanto, a questão crítica para o design de peptídeos é o grande espaço de busca, o que torna inviável avaliar todas as possibilidades. Além disso, a maioria das análises relacionadas adota docking molecular in silico para selecionar potenciais peptídeos, que é uma técnica demorada e altamente dependente da estrutura molecular dos peptídeos já conhecidos e da proteína alvo. Com o objetivo de auxiliar na avaliação, descoberta e seleção de peptídeos para cálculo de docking, desenvolvemos o SAGAPEP, um framework de Algoritmo Genético Assistido por Surrogate capaz de encontrar peptídeos com potencial para bloquear a proteína Spike do SARS-CoV-2. O modelo surrogate é usado para avaliação rápida e de alta fidelidade da energia de interação entre um peptídeo e a proteína Spike, enquanto o algoritmo genético busca descobrir e selecionar peptídeos de alto potencial inspirados em princípios de genética e seleção natural. Os experimentos foram conduzidos usando um conjunto de dados composto por vários peptídeos potenciais obtidos por meio de docking molecular por especialistas em bioinformática. Como principais resultados, o SAGAPEP obteve baixas previsões de erro de seu componente surrogate treinado sobre esse conjunto de dados e foi capaz de descobrir e selecionar peptídeos com melhor energia de ligação do que todos listados no conjunto de dados. Além disso, os resultados notáveis do SAGAPEP sugerem que ele também pode ter o potencial de fornecer resultados promissores para outros problemas de design de peptídeos.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"125 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"126495943","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-27DOI: 10.5753/sbcas_estendido.2023.229717
A. C. D. A. Coelho, R. W. D. Santos
Apresentamos um modelo computacional de baixo custo para simular a eletromecânica do miócito cardíaco, usando um sistema de seis equações diferenciais ordinárias e um sistema massa-mola para capturar a deformação e a geometria. O modelo é integrado no tempo usando o método de Verlet, e uma análise de sensibilidade é realizada para investigar parâmetros críticos. Os resultados numéricos mostram potencial de ação, contração e deformação precisos, tornando o modelo uma ferramenta essencial para caracterizar com precisão a eletromecânica do miócito cardíaco.
{"title":"Simulação de miócito único via acoplamento de modelos massa-mola e eletromecânico","authors":"A. C. D. A. Coelho, R. W. D. Santos","doi":"10.5753/sbcas_estendido.2023.229717","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.229717","url":null,"abstract":"Apresentamos um modelo computacional de baixo custo para simular a eletromecânica do miócito cardíaco, usando um sistema de seis equações diferenciais ordinárias e um sistema massa-mola para capturar a deformação e a geometria. O modelo é integrado no tempo usando o método de Verlet, e uma análise de sensibilidade é realizada para investigar parâmetros críticos. Os resultados numéricos mostram potencial de ação, contração e deformação precisos, tornando o modelo uma ferramenta essencial para caracterizar com precisão a eletromecânica do miócito cardíaco.","PeriodicalId":354386,"journal":{"name":"Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023)","volume":"358 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"115880322","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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