Pub Date : 2024-02-27DOI: 10.33871/23594373.2023.25.02.8181
D.F.L. Kayser, Cassiano Vicente de Lima, Carla Andréia Lorscheider, L. Romanello
A esquistossomose é uma doença parasitária provocada pelo helminto Schistosoma mansoni e afeta cerca de 240 milhões de pessoas em todo mundo. O tratamento da doença atualmente dá-se pela administração de apenas um fármaco, o praziquantel entretanto, pelo seu uso em massa, diversos casos de resistência do parasita ao fármaco tem sido reportados. Diferente de seu hospedeiro humano, o S. mansoni não possui a via de síntese de purinas, dependendo exclusivamente da via de salvação de purinas para o suprimento dessas bases. Deste modo esta via tem sido citada como alvo potencial para o desenvolvimento de novos fármacos contra a esquistossomose. A adenosina desaminase (ADA) é uma das enzimas dessa via, convertendo a adenosina em inosina e hipoxantina. Uma vez que a estrutura tridimensional dessa enzima não foi resolvida experimentalmente, a modelagem molecular comparativa possibilitou a análise molecular e bioquímica. O estudo foi desenvolvido em etapas: seleção do molde, alinhamento alvo-molde, construção do modelo molecular, avaliação e validação do modelo, análises moleculares. As avaliações do modelo obtido apresentaram qualidade satisfatória e, em comparação com ADA humana foi possível observar substituições de resíduos de aminoácidos no sítio ativo que suportam a investigação da enzima como alvo potencial para desenvolvimento de fármacos através de experimentos de docagem, cinética enzimática e cristalografia de proteínas.
血吸虫病是一种由曼氏血吸虫引起的寄生虫病,全世界约有 2.4 亿人感染这种疾病。目前治疗这种疾病的药物只有一种,即吡喹酮,但由于这种药物的广泛使用,已经出现了几例寄生虫对这种药物产生抗药性的病例。与人类宿主不同,曼氏沙门氏菌没有嘌呤合成途径,完全依赖嘌呤挽救途径提供这些碱基。因此,这一途径被认为是开发血吸虫病新药的潜在靶点。腺苷脱氨酶(ADA)是这一途径中的酶之一,它将腺苷转化为肌苷和次黄嘌呤。由于这种酶的三维结构尚未在实验中得到解决,通过比较分子建模可以进行分子和生化分析。研究分阶段进行:选择模具、目标-模具配准、构建分子模型、评估和验证模型以及分子分析。对所获模型的评估表明,模型质量令人满意,而且与人类 ADA 相比,可以观察到活性位点氨基酸残基的替换,这有助于通过对接实验、酶动力学和蛋白质晶体学,将该酶作为药物开发的潜在目标进行研究。
{"title":"Modelagem e análise molecular da enzima Adenosina Desaminase (ADA) do parasito Schistosoma mansoni","authors":"D.F.L. Kayser, Cassiano Vicente de Lima, Carla Andréia Lorscheider, L. Romanello","doi":"10.33871/23594373.2023.25.02.8181","DOIUrl":"https://doi.org/10.33871/23594373.2023.25.02.8181","url":null,"abstract":"A esquistossomose é uma doença parasitária provocada pelo helminto Schistosoma mansoni e afeta cerca de 240 milhões de pessoas em todo mundo. O tratamento da doença atualmente dá-se pela administração de apenas um fármaco, o praziquantel entretanto, pelo seu uso em massa, diversos casos de resistência do parasita ao fármaco tem sido reportados. Diferente de seu hospedeiro humano, o S. mansoni não possui a via de síntese de purinas, dependendo exclusivamente da via de salvação de purinas para o suprimento dessas bases. Deste modo esta via tem sido citada como alvo potencial para o desenvolvimento de novos fármacos contra a esquistossomose. A adenosina desaminase (ADA) é uma das enzimas dessa via, convertendo a adenosina em inosina e hipoxantina. Uma vez que a estrutura tridimensional dessa enzima não foi resolvida experimentalmente, a modelagem molecular comparativa possibilitou a análise molecular e bioquímica. O estudo foi desenvolvido em etapas: seleção do molde, alinhamento alvo-molde, construção do modelo molecular, avaliação e validação do modelo, análises moleculares. As avaliações do modelo obtido apresentaram qualidade satisfatória e, em comparação com ADA humana foi possível observar substituições de resíduos de aminoácidos no sítio ativo que suportam a investigação da enzima como alvo potencial para desenvolvimento de fármacos através de experimentos de docagem, cinética enzimática e cristalografia de proteínas. ","PeriodicalId":489281,"journal":{"name":"LUMINÁRIA","volume":"11 3","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140425285","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-12-01DOI: 10.33871/23594373.2023.25.02.8506
Marcos Otávio Ribeiro
{"title":"Caderno de Resumos do Cesb 2023","authors":"Marcos Otávio Ribeiro","doi":"10.33871/23594373.2023.25.02.8506","DOIUrl":"https://doi.org/10.33871/23594373.2023.25.02.8506","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":489281,"journal":{"name":"LUMINÁRIA","volume":"89 5","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"138623522","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-12-01DOI: 10.33871/23594373.2023.25.02.7937
Ana Carolina De Deus Bueno Krawczyk, Marcos Otávio Ribeiro, Rogério Antonio Krupek, Beatriz Wierzbicki, L. Costa
Ciência é uma atividade que tem como proposta buscar de forma consistente e pragmática a elaboração de teses fundamentadas e explicativas sobre diversos mecanismos da natureza/sociedade. Para que a ciência seja aplicada e depois compreendida, é necessário lançar mão de diversas ferramentas que auxiliam nesse processo. Uma dessas ferramentas é a criação de metodologias ativas que podem ser mediadores e facilitadores no processo ensino-aprendizagem. Dito isso, o presente estudo teve como objetivo e proposta avaliar o grau de compreensão e entendimento de um grupo de alunos do curso de licenciatura em Ciências Biológicas dentro da temática conceitual em Ecologia. Para tal, foram selecionados 14 alunos, inicialmente inseridos em aulas com abordagens expositivas e dialogadas sobre o tema “Interações Ecológicas”. Após a finalização das aulas, aplicou-se um questionário online elaborado com cinco questões de múltipla escolha que versavam sobre o tema trabalhado durante as aulas. Subsequentemente, foi proposto aos estudantes o desenvolvimento de um experimento replicando possíveis interações ecológicas, objetivando observar na prática os eventos de competição e predação. Após a realização do experimento e observação dos alunos, foi aplicado o mesmo questionário utilizado anteriormente ao início do experimento. Nossos resultados apontaram que houve aumento de acertos no questionário após a realização do experimento, sendo que em termos gerais os acertos do pré-teste foram de 61,4% e no pós-teste, 67,1%. Os resultados majoritários apontados neste estudo demonstraram que, a prática em laboratório, utilizando a modalidade de delineamento experimental e abordagem problematizadora, teve papel agregador e de consolidação do conhecimento prévio estabelecido nas aulas teóricas. Esses resultados também reforçam a hipótese de que aulas interativas como metodologias ativas, associadas à contextualização observacional, podem desempenhar papel fundamental no processo ensino aprendizagem
{"title":"Princípios da iniciação científica em sequencia didática de Ecologia: um estudo de caso com estudantes de graduação em Ciências Biológicas","authors":"Ana Carolina De Deus Bueno Krawczyk, Marcos Otávio Ribeiro, Rogério Antonio Krupek, Beatriz Wierzbicki, L. Costa","doi":"10.33871/23594373.2023.25.02.7937","DOIUrl":"https://doi.org/10.33871/23594373.2023.25.02.7937","url":null,"abstract":"Ciência é uma atividade que tem como proposta buscar de forma consistente e pragmática a elaboração de teses fundamentadas e explicativas sobre diversos mecanismos da natureza/sociedade. Para que a ciência seja aplicada e depois compreendida, é necessário lançar mão de diversas ferramentas que auxiliam nesse processo. Uma dessas ferramentas é a criação de metodologias ativas que podem ser mediadores e facilitadores no processo ensino-aprendizagem. Dito isso, o presente estudo teve como objetivo e proposta avaliar o grau de compreensão e entendimento de um grupo de alunos do curso de licenciatura em Ciências Biológicas dentro da temática conceitual em Ecologia. Para tal, foram selecionados 14 alunos, inicialmente inseridos em aulas com abordagens expositivas e dialogadas sobre o tema “Interações Ecológicas”. Após a finalização das aulas, aplicou-se um questionário online elaborado com cinco questões de múltipla escolha que versavam sobre o tema trabalhado durante as aulas. Subsequentemente, foi proposto aos estudantes o desenvolvimento de um experimento replicando possíveis interações ecológicas, objetivando observar na prática os eventos de competição e predação. Após a realização do experimento e observação dos alunos, foi aplicado o mesmo questionário utilizado anteriormente ao início do experimento. Nossos resultados apontaram que houve aumento de acertos no questionário após a realização do experimento, sendo que em termos gerais os acertos do pré-teste foram de 61,4% e no pós-teste, 67,1%. Os resultados majoritários apontados neste estudo demonstraram que, a prática em laboratório, utilizando a modalidade de delineamento experimental e abordagem problematizadora, teve papel agregador e de consolidação do conhecimento prévio estabelecido nas aulas teóricas. Esses resultados também reforçam a hipótese de que aulas interativas como metodologias ativas, associadas à contextualização observacional, podem desempenhar papel fundamental no processo ensino aprendizagem","PeriodicalId":489281,"journal":{"name":"LUMINÁRIA","volume":"21 17","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"138624905","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-10-05DOI: 10.33871/23594373.2023.25.02.8078
Karla Letícia Ferreira, Rafael Bueno Noleto
The subfamily Corydoradinae is the second largest among the callictids, comprising three genera, with Corydoras Lacépède, 1803 being the largest in the number of species. The genus Corydoras has been divided into five groups of species based on differences in diploid number, chromosomal morphology, and DNA content. Chromosome studies can provide crucial details on population differentiation. To better understand the diversification that occurs in this fish group, the current study based on such markers, presents data from a population of Corydoras paleatus from the first plateau of Paraná, putting them in a comparative scenario. The specimens studied has 2n=44 chromosomes with a karyotypic formula of 18m+26sm. Although conserved, this karyotypic structure shows variation in other populations of C. paleatus already studied, a consequence of chromosomal rearrangements that modify the morphology of chromosomes without modifying the 2n, such as centromeric repositioning. C-banding revealed conspicuous pericentromeric markings in metacentric pairs 4 and 8 and in submetacentric pairs 10 and 14, whose bands have been considered a chromosomal marker not only for C. paleatus but also for the genus. Fluorescent in situ hybridization (FISH) showed the major rDNA (45S) in the terminal region of the long arm of metacentric pair 5. Such location has already been described in other populations of C. paleatus, as they have also been mapped in short arms and with multiple patterns. The present study also provides a review of the genus Corydoras regarding the 2n, karyotypic formula and mainly regarding the number and location of the 45S and 5S rDNA, confirming a scenario in which chromosomal rearrangements have been modeling karyotypes of different populations and settling in the absence of gene flow, a consequence of vicariant events that occurred in the different basins.
{"title":"Karyotype reexamination of Corydoras paleatus (Siluriformes) and a review of the cytogenetics of genus with a focus on the ribosomal genes","authors":"Karla Letícia Ferreira, Rafael Bueno Noleto","doi":"10.33871/23594373.2023.25.02.8078","DOIUrl":"https://doi.org/10.33871/23594373.2023.25.02.8078","url":null,"abstract":"The subfamily Corydoradinae is the second largest among the callictids, comprising three genera, with Corydoras Lacépède, 1803 being the largest in the number of species. The genus Corydoras has been divided into five groups of species based on differences in diploid number, chromosomal morphology, and DNA content. Chromosome studies can provide crucial details on population differentiation. To better understand the diversification that occurs in this fish group, the current study based on such markers, presents data from a population of Corydoras paleatus from the first plateau of Paraná, putting them in a comparative scenario. The specimens studied has 2n=44 chromosomes with a karyotypic formula of 18m+26sm. Although conserved, this karyotypic structure shows variation in other populations of C. paleatus already studied, a consequence of chromosomal rearrangements that modify the morphology of chromosomes without modifying the 2n, such as centromeric repositioning. C-banding revealed conspicuous pericentromeric markings in metacentric pairs 4 and 8 and in submetacentric pairs 10 and 14, whose bands have been considered a chromosomal marker not only for C. paleatus but also for the genus. Fluorescent in situ hybridization (FISH) showed the major rDNA (45S) in the terminal region of the long arm of metacentric pair 5. Such location has already been described in other populations of C. paleatus, as they have also been mapped in short arms and with multiple patterns. The present study also provides a review of the genus Corydoras regarding the 2n, karyotypic formula and mainly regarding the number and location of the 45S and 5S rDNA, confirming a scenario in which chromosomal rearrangements have been modeling karyotypes of different populations and settling in the absence of gene flow, a consequence of vicariant events that occurred in the different basins.","PeriodicalId":489281,"journal":{"name":"LUMINÁRIA","volume":"63 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-10-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135547071","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}