Sangho Koh, M. Mizuno, Keita Koumoto, Ryohei Mitsumori, Genya Hayakawa, Y. Amano
植物細胞壁は,セルロース,ヘミセルロース,リグニン の主要成分から構成され,地球上で最大の炭素貯蓄源であ り,植物バイオマスと呼ばれている.人類は,植物バイオ マスを直接的な燃料や建築材料,紙パルプなどの資源とし て利用してきた.しかし,化石資源の枯渇が懸念される 中,これまで以上に,植物バイオマスをより多様な用途に 活用していくための技術革新が求められている.自然界の 循環系に目を向けてみると,光合成によって生産された植 物細胞壁の大部分が,担子菌をはじめとする森林の微生物 によって資化されており,この際に大きな役割を果たすの が,菌体外に分泌される酵素である.このことを考える と,我々が植物細胞壁をバイオマス資源として上手く利用 していくためには,酵素による細胞壁分解をより本質的に 理解することが重要だと言える.筆者らの研究室では,植 物細胞壁中の多糖類の利用を目的に,木材腐朽力が高い菌 として単離された白色腐朽菌ウスバタケ (Irpex lacteus) が Extraction of Intact Heteroxylan by Ionic Liquid and Its Structural Characterization イオン液体を用いた天然型キシランの抽出とその 構造的特徴
植物细胞壁由纤维素、半纤维素、木质素等主要成分构成，是地球上最大的碳储蓄源，被称为植物生物量。人类一直将植物生物量作为直接的燃料、建筑材料、纸浆等资源加以利用。但是，在化石资源枯竭的担忧下，植物生物量比以往更加多样化的用途为了灵活运用，需要技术革新。把目光转向自然界的循环系统，光合作用所生产的植物细胞壁的大部分，被担子菌等森林微生物所养分化，这时担子菌就发挥了很大的作用。但是，从菌体外分泌的酶。考虑到这一点，我们为了把植物细胞壁作为生物量资源好好利用，更本质地理解酶对细胞壁的分解是很重要的。在笔者的研究室里，为了利用植物细胞壁中的多糖类物质，分离出了一种具有很强的木材朽力的白色朽菌——薄糟朽菌(Irpex lacteus)。Heteroxylan by Ionic Liquid and Its Structural Characterization使用离子液体的天然型氧基烷的提取及其结构特征
{"title":"[Review] Extraction of Intact Heteroxylan by Ionic Liquid and Its Structural Characterization","authors":"Sangho Koh, M. Mizuno, Keita Koumoto, Ryohei Mitsumori, Genya Hayakawa, Y. Amano","doi":"10.5458/BAG.10.2_76","DOIUrl":"https://doi.org/10.5458/BAG.10.2_76","url":null,"abstract":"植物細胞壁は,セルロース,ヘミセルロース,リグニン の主要成分から構成され,地球上で最大の炭素貯蓄源であ り,植物バイオマスと呼ばれている.人類は,植物バイオ マスを直接的な燃料や建築材料,紙パルプなどの資源とし て利用してきた.しかし,化石資源の枯渇が懸念される 中,これまで以上に,植物バイオマスをより多様な用途に 活用していくための技術革新が求められている.自然界の 循環系に目を向けてみると,光合成によって生産された植 物細胞壁の大部分が,担子菌をはじめとする森林の微生物 によって資化されており,この際に大きな役割を果たすの が,菌体外に分泌される酵素である.このことを考える と,我々が植物細胞壁をバイオマス資源として上手く利用 していくためには,酵素による細胞壁分解をより本質的に 理解することが重要だと言える.筆者らの研究室では,植 物細胞壁中の多糖類の利用を目的に,木材腐朽力が高い菌 として単離された白色腐朽菌ウスバタケ (Irpex lacteus) が Extraction of Intact Heteroxylan by Ionic Liquid and Its Structural Characterization イオン液体を用いた天然型キシランの抽出とその 構造的特徴","PeriodicalId":202833,"journal":{"name":"Bulletin of Applied Glycoscience","volume":"19 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2020-05-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"133306360","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
A. Nakamura, K. Okazaki, T. Furuta, M. Sakurai, R. Iino
1.1 プロセッシブな糖質分解酵素 プロセッシビティとは,1回の基質酵素複合体形成あた りの触媒反応回数ということができる.糖質関連酵素の分 野では,セルラーゼ,キチナーゼなどの加水分解酵素につ いて解析がなされることが多いため分解反応回数と思われ がちである.しかし他分野では DNAポリメラーゼの合成 反応回数やモーター蛋白質の運動回数として使われる概念 であり,酵素の重要な性質の一つである. セルラーゼについては,X線結晶構造解析によりトンネ ル状の触媒ドメインの構造が明らかになりプロセッシブ反 応の可能性が示された.その後,分解反応後の結晶性セ ルロースが尖ることからプロセッシブ反応が検証された. またキチナーゼについても,分解後の結晶性キチンの形状 変化からプロセッシブ反応モデルが提案された.更にプ ロセッシビティ定量のために,生成物の奇数糖と偶数糖の 比から推定する方法,基質を改変するまたは可溶性と不 溶性の基質を混合して計測する方法などが提案されてき た.プロセッシビティの定義を考えると,生成物の量と Moving Mechanism of Chitinase A from Serratia marcescens セラチア菌由来キチン加水分解酵素の運動機構
1.1处理性糖质分解酶所谓处理性，可以说是指1次基质酶复合物形成值的催化反应次数。在糖类相关酶的分野中，由于多分析纤维素酶、激酶等水解酶，所以容易被认为是分解反应次数。但是在其他领域DNA聚合酶的合成是作为反应次数和马达蛋白的运动次数使用的概念，是酶的重要性质之一。关于塞尔酶，通过X射线结晶结构分析，发现了隧道状催化域的结构，处理反随后，由于分解反应后结晶性脊骨变尖，验证了处理反应。另外，激酶分解后结晶性甲壳素的形状。从变化中提出了处理反应模型。为了进一步定量焦糖，提出了根据生成物的奇数糖和偶数糖之比推算的方法，改变基质或混合可溶性和不可溶性基质测量的方法等。考虑处理器的定义，生成物的量和Moving Mechanism of Chitinase A from Serratia marcescens来自塞拉西菌的甲壳素水解酶的运动机制
{"title":"[Review] Moving Mechanism of Chitinase A from Serratia marcescens","authors":"A. Nakamura, K. Okazaki, T. Furuta, M. Sakurai, R. Iino","doi":"10.5458/BAG.10.2_89","DOIUrl":"https://doi.org/10.5458/BAG.10.2_89","url":null,"abstract":"1.1 プロセッシブな糖質分解酵素 プロセッシビティとは,1回の基質酵素複合体形成あた りの触媒反応回数ということができる.糖質関連酵素の分 野では,セルラーゼ,キチナーゼなどの加水分解酵素につ いて解析がなされることが多いため分解反応回数と思われ がちである.しかし他分野では DNAポリメラーゼの合成 反応回数やモーター蛋白質の運動回数として使われる概念 であり,酵素の重要な性質の一つである. セルラーゼについては,X線結晶構造解析によりトンネ ル状の触媒ドメインの構造が明らかになりプロセッシブ反 応の可能性が示された.その後,分解反応後の結晶性セ ルロースが尖ることからプロセッシブ反応が検証された. またキチナーゼについても,分解後の結晶性キチンの形状 変化からプロセッシブ反応モデルが提案された.更にプ ロセッシビティ定量のために,生成物の奇数糖と偶数糖の 比から推定する方法,基質を改変するまたは可溶性と不 溶性の基質を混合して計測する方法などが提案されてき た.プロセッシビティの定義を考えると,生成物の量と Moving Mechanism of Chitinase A from Serratia marcescens セラチア菌由来キチン加水分解酵素の運動機構","PeriodicalId":202833,"journal":{"name":"Bulletin of Applied Glycoscience","volume":"7 3 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2020-05-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"116795754","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Nozomu Shibata, M. Suetsugu, Toshiharu Arai, T. Kodama, H. Kakeshita, K. Igarashi
{"title":"[Mini Review] Development of Enzymes for Biomass Saccharification Using Trichoderma reesei.","authors":"Nozomu Shibata, M. Suetsugu, Toshiharu Arai, T. Kodama, H. Kakeshita, K. Igarashi","doi":"10.5458/bag.9.4_249","DOIUrl":"https://doi.org/10.5458/bag.9.4_249","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":202833,"journal":{"name":"Bulletin of Applied Glycoscience","volume":"23 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-11-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"121862883","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"[Review] Advanced Studies of the Biological Functions of Milk Oligosaccharides (4)","authors":"T. Urashima, K. Fukuda","doi":"10.5458/bag.9.4_254","DOIUrl":"https://doi.org/10.5458/bag.9.4_254","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":202833,"journal":{"name":"Bulletin of Applied Glycoscience","volume":"14 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-11-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"125995271","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Masako Kawanishi-Asaoka, Chikage Kikuta, Seina Hagiwara, K. Iwaki, Y. Sugimoto
{"title":"[Note] Physicochemical Properties of Bulb Starches","authors":"Masako Kawanishi-Asaoka, Chikage Kikuta, Seina Hagiwara, K. Iwaki, Y. Sugimoto","doi":"10.5458/bag.9.4_266","DOIUrl":"https://doi.org/10.5458/bag.9.4_266","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":202833,"journal":{"name":"Bulletin of Applied Glycoscience","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2019-11-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"128391948","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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